Näytä vastaamattomat viestit | Näytä aktiiviset viestiketjut Tänään on 21 Huhti 2018 06:40



Vastaa viestiin  [ 437 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1 ... 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ... 22  Seuraava
 Geenejä testaamaan! Voit myös kysyä aiheesta 
Kirjoittaja Viesti
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 249
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Kokeilin huuhaa-nimellä, YPRIME coupon koodi pudottaa $400 ja postikuluja tulee päälle $39

Shipping: 1x$39.00 USD = $39.00 USD
Coupon: YPRIME: 1x$-400.00 USD = $-400.00 USD
Comprehensive Y-Chromosome Sequencing: 1x$999.00 USD = $999.00 USD
Total Price: $638.00 USD

joten hinnaksi tulisi noin 475 euroa. Koodi toimii ilmeisesti elokuun loppuun saakka, sen jälkeen hinta on $625 joka on sekin paljon vähemmän kuin $999

Elite-testi ei ole vielä myynnissä, tai en ainakaan löytänyt. Hyvä että tulee kilpailua lisää. Nyt myydään tuotteita sillä, kuinka paljon enemmän snippejä testillä saa verrattuna kilpailijoihin. Myöhemmin toivottavasti vertaillaan myös laadulla "meidän testi lukee 99% snipeistä oikein, kilpailijoilla tm:n testin mukaan 88%"

... lisäys ...

Anthrogenica-foorumilla oli vielä hieman lisätietoja, joiden kirjoittajana oli nimimerkki FGC Corp:

The Y Prime product has launched at $599/sample. Our analyses of the beta test suggest that the results will have at least 90% of the coverage of the FGC BGI test, which is currently $999.

Where FGC Elite (BGI) = 100%

Elite = 100
Y Prime = 90 or better
Big Y = 65

Y Prime uses a lab based in the United States, while Y Elite uses BGI, based in Hong Kong


27 Heinä 2014 20:29
Profiili
Ujo ugri
Ujo ugri

Liittynyt: 14 Touko 2014 19:40
Viestit: 7
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jos isälinja on tutkittu 67 markkerin tarkkuudella, niin kumpi kannattaa, jotta haploryhmä vielä tarkentuisi: markkereiden lisääminen vai ehdotettujen snp-testien tilaaminen? Kumpaankaan ei olisi kauhiasti varaa... :cry: Vai ryhtyisinkö vain arvailemaan? :wink:


10 Elo 2014 09:21
Profiili
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7120
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Cemoi kirjoitti:
Jos isälinja on tutkittu 67 markkerin tarkkuudella, niin kumpi kannattaa, jotta haploryhmä vielä tarkentuisi: markkereiden lisääminen vai ehdotettujen snp-testien tilaaminen? Kumpaankaan ei olisi kauhiasti varaa... :cry: Vai ryhtyisinkö vain arvailemaan? :wink:

Vastaus riippuu aika paljon siitä, kuinka tarkkaan haplotyyppisi nyt pystytään ryhmittelemään; siitä ja alaryhmästä riippuu, onko sopivia SNP-testejä tarjolla ja ovatko ne tarpeellisia.

Kerrotko kit-numerosi tai haplotyyppisi, niin katsotaan miltä näyttää?

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


11 Elo 2014 16:47
Profiili WWW
Ujo ugri
Ujo ugri

Liittynyt: 14 Touko 2014 19:40
Viestit: 7
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Haplotyyppi (ei oma, mutta isälinja :-)) on tällä hetkellä L22. Family Tree DNA tarjoilee sen mukaisesti vaihtoehdoiksi:

P109
L300
Z74 sekä Z75
L287
L258
L296
L813 sekä CTS9346
L205

Ehkä voisin arvata ja tilata suoraan ja pelkästään tuon L258? :-)


12 Elo 2014 17:22
Profiili
SuuBaltti
SuuBaltti

Liittynyt: 12 Elo 2013 12:41
Viestit: 3616
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Cemoi kirjoitti:
Haplotyyppi (ei oma, mutta isälinja :-)) on tällä hetkellä L22. Family Tree DNA tarjoilee sen mukaisesti vaihtoehdoiksi:

P109
L300
Z74 sekä Z75
L287
L258
L296
L813 sekä CTS9346
L205

Ehkä voisin arvata ja tilata suoraan ja pelkästään tuon L258? :-)


Jos 12 ensimmäistä STR-markkeria näyttävät jotakuinkin tältä niin aika varma valinta
13 23 14 10 14-14(tai 15) 11 14 10 12 11 28


12 Elo 2014 18:38
Profiili
Ujo ugri
Ujo ugri

Liittynyt: 14 Touko 2014 19:40
Viestit: 7
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Ei ihan näytä tuolta, vaan tältä:

13 23 14 10 14-14 11 13 10 13 11 29

Olen pähkäillyt, josko isälinjani edustaisi Wiikin lajittelun mukaisesti Yleisryhmä ykköstä, mutta näyttää menevän vain sitä lähelle, täsmällene se ei ole sitäkään.
Täytynee odotella tarjouspäiviä, jotta pääsen taas tilailemaan lisätestejä! :cool:


13 Elo 2014 09:01
Profiili
SuuBaltti
SuuBaltti
Avatar

Liittynyt: 16 Helmi 2011 12:09
Viestit: 6170
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Cemoi kirjoitti:
Ei ihan näytä tuolta, vaan tältä:

13 23 14 10 14-14 11 13 10 13 11 29

Olen pähkäillyt, josko isälinjani edustaisi Wiikin lajittelun mukaisesti Yleisryhmä ykköstä, mutta näyttää menevän vain sitä lähelle, täsmällene se ei ole sitäkään.
Täytynee odotella tarjouspäiviä, jotta pääsen taas tilailemaan lisätestejä! :cool:


Taidat kuulua meihin L69-bothnioihin, Viikin mukaan Satakunta - Pohjois-Pohjanmaa. Meistä monen juuret ovat Kokkolan ja Keski-Pohjanmaan alueella, mutta alku lienee Pirkanmaalla tai Ala-Satakunnassa. Olemme valloittaneet Pohjois-Pohjanmaan osia, mutta PP on liian laaja ja kulttuuririkas paikka historiakehykseksi.

_________________
Der Teufel steckt im Details:

Väinämöinen - R1a
Lemminkäinen - I1
Joukahainen - N


13 Elo 2014 09:15
Profiili WWW
Ujo ugri
Ujo ugri

Liittynyt: 14 Touko 2014 19:40
Viestit: 7
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Matchien perusteella ja vanhimman tunnetun esi-isän paikkakunnan perusteella kyllä.


13 Elo 2014 09:44
Profiili
SuuBaltti
SuuBaltti
Avatar

Liittynyt: 16 Helmi 2011 12:09
Viestit: 6170
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Cemoi kirjoitti:
Matchien perusteella ja vanhimman tunnetun esi-isän paikkakunnan perusteella kyllä.


Jos esi-isäsi asui Pohjamaan rantaruotsien alueesta pohjoiseen, niin hän kului todennäköisesti siihen savottaan, joka valtasi takaisin nuo vanhat erämetsät Novgorodilta vuodesta 1293 lähtien.

_________________
Der Teufel steckt im Details:

Väinämöinen - R1a
Lemminkäinen - I1
Joukahainen - N


13 Elo 2014 10:08
Profiili WWW
Ujo ugri
Ujo ugri

Liittynyt: 14 Touko 2014 19:40
Viestit: 7
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
No ei asunut, vaan Pirkanmaalla, ainakin 1600-luvulta lähtien. :-)


13 Elo 2014 22:23
Profiili
SuuBaltti
SuuBaltti
Avatar

Liittynyt: 16 Helmi 2011 12:09
Viestit: 6170
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Cemoi kirjoitti:
No ei asunut, vaan Pirkanmaalla, ainakin 1600-luvulta lähtien. :-)


No sopiihan se. Barbarossa varmaan voisi tehdä alustavan luokituksen, jos saisi tuloksesi. Itseäni kiinnostaa tuo L69, koska se on hyvä markkeri kuvaaman kiinnostavia satakuntalaishämäläisten reittejä pohjoiseen. Erityistä mielenkiintoa sen vuoksi, että se näyttää liittyvän ns. pirkkalaisliikettä vanhempaan tapahtumaan, jota ei voi samalla tarkkuudella tutkia nimistön avulla.

_________________
Der Teufel steckt im Details:

Väinämöinen - R1a
Lemminkäinen - I1
Joukahainen - N


13 Elo 2014 22:55
Profiili WWW
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 249
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Familytreedna "End of Summer Sale! Huge Savings on all Y-DNA Tests and Upgrades!"
Y111 $279
Y67 $199
Y37 $129


28 Elo 2014 10:43
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 249
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
En keksi parempaakaan paikkaa tälle aiheelle, mutta siis

28.4.2014 Geno 2.0 tulokseni valmistui, imuroin raw datat kotikoneelle ja siirsin tulokset myös Familytreedna:lle. Nyt tänään 28.8.2014 imuroin huvikseni raw datan uudelleen ja ajelin linuxissa diff, wc -l ja muita pieniä hyviä komentoja.

Uudemmassa raw datassa on 2826 riviä enemmän. Kaikilla muuttuneilla riveillä on "Mt", joten uudemmassa on siis paljon enemmän Mitokondrio-rivejä kuin vanhassa. Löysin kahdenlaisia eroja

Esim.

MUUTTUNEET noin 40 kpl
file1 769,Mt,C,C
file2 769,Mt,G,G

UUDET lähes 2800 kpl
file1 ei löydy
file2 152,Mt,C,C

Kysymys 1: mitä ihmettä
Kysymys 2: pitäisiköhän tehdä uusi datan siirto geno -> ftdna
Kysymys 3: jos teillä on vanhempi raw data imuroituna, niin kokeilkaapa imuroida uudelleen ja verratkaa, onko muilla samaa vain olenko minä mokannut jotakin joskus


28 Elo 2014 22:15
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 249
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Huhtikuisessa Geno 2.0 mt-datassa oli minulla 3 HVR1, 3 HVR2 ja 39 CR riviä

Elokuisessa oli 135 HVR1, 159 HVR2 ja 2577 CR riviä

Löysin netistä tämmöisen saitin mistä voi imuroida esimerkki-rawdatoja
https://my.pgp-hms.org/public_genetic_d ... mit=Search

Imuroin sieltä Geno2 mt esimerkkidatan ja siinäkin oli vain noin 40 riviä vain tuota mitokondriodataa. Eli kyllä näyttäisi siltä, että National Geographic on jotenkin jälkikäteen lisännyt raw dataan 132 HVR1, 156 HVR2 ja 2538 CR riviä, joka on aika suuri määrä.

Kokeilin myös James Lickin mthap-new nettivempelettä tällä uudemmalla Geno2 raw datalla ja sehän meni jotenkin nurin. Laitoin herra Lickille asiasta ilmoituksen. Vanhalla eli huhtikuisella datalla mthap-new toimi oireettomasti.


30 Elo 2014 00:53
Profiili
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7120
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Kuulostaa todella omituiselta... Osaisiko joku "Genotyyppi" kommentoida?

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


30 Elo 2014 11:44
Profiili WWW
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 249
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Giösta kirjoitti:
Huhtikuisessa Geno 2.0 mt-datassa oli minulla 3 HVR1, 3 HVR2 ja 39 CR riviä
Elokuisessa oli 135 HVR1, 159 HVR2 ja 2577 CR riviä


Imuroin tuolta pgp-hms.org:ista äsken kaikki eri geno2 raw datat ja laskin niistä sekä omistani mitokondrio-rivit

henkilö a: 47
henkilö b: 50
henkilö c: 41
minun huhtikuinen: 45
minun elokuinen: 2871

Nuo pgp-hms.org datat olivat suunnilleen vuodelta 2012-13 ja omani 2014.

Joten voisin arvella, että ainakin joillakin Geno-testaajilla olisi havaittavissa samanlainen mukava mt-data-bonus, kunhan vain imuroi raw datan uudelleen, koska muutos näyttäisi tapahtuneen touko-heinä 2014 välisenä aikana.


10 Syys 2014 23:26
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 249
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Imuroin huvikseni 23andme raw datat uudelleen ja vertailin 2013 imuroituihin. Ne olivat hieman muuttuneet edellisestä lataamisesta vuosi sitten. Esim

vanha i4990110 MT 16129 --
uusi i4990110 MT 16129 G

Uudemmassa datassa oli ilmestynyt tuollainen G-kirjain mt-dataan ja se on jossakin määrin oleellinen, koska tuota 16129:ää käytetään testatun henkilön mt-haploryhmän määrittelyissä.

Eli Geno2 ja 23andme raw datat kannattaa imuroida uudelleen, kun alkaa tekemään niillä jotakin. Ne muuttuvat "itsekseen". Asiakastuki ei ole koskaan kuullutkaan tällaisesta.

23andme:n tapauksessa kyse ei ole mistään v2/v3/v4 jutuista vaan sama data mutta kirjain/kirjaimia muuttunut. Eroavaisuudet on haettu unixin diff-komennolla.

lisäys

- 1 kittiin oli tullut siis kirjain mt 16129 kohdalle, aikaisemmin siinä oli --
- 3 kittiin oli tullut tuo sama 16129 ja sen lisäksi kokonaan uusi snp kromosomiin 6:
rs28357069 6 31963860 GG


14 Loka 2014 16:32
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 249
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Facebook-foorumeilla huhuttu Familytreedna:n tarjous 23andme ja ancestry raw datojen ilmaisesta siirrosta on nyt auki. Esim. 23andme raw datan tapauksessa sinne kelpaa vain V3 version data, eli se jonka zipin koko on noin 7,8 megatavua. Ilmaiset siirtäjät saavat rajoitetut käyttöoikeudet Ftdna:lla, mutta voivat ostaa täydet oikeudet $39 (aik $69)

Siirsin juuri pari kittiä 23andme:stä ja nyt pitää odotella tunti, kun dataa käsitellään.


16 Loka 2014 21:58
Profiili
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7120
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Giösta kirjoitti:
Facebook-foorumeilla huhuttu Familytreedna:n tarjous 23andme ja ancestry raw datojen ilmaisesta siirrosta on nyt auki. Esim. 23andme raw datan tapauksessa sinne kelpaa vain V3 version data, eli se jonka zipin koko on noin 7,8 megatavua. Ilmaiset siirtäjät saavat rajoitetut käyttöoikeudet Ftdna:lla, mutta voivat ostaa täydet oikeudet $39 (aik $69)

Siirsin juuri pari kittiä 23andme:stä ja nyt pitää odotella tunti, kun dataa käsitellään.

Hyvä että täällä olikin jo tästä. Eli Ancestry- ja 23andMe-datan ilmainen muuntaminen FamilyTreeDNA:lle tällä sivulla:
https://www.familytreedna.com/Autosomal ... dium=email

Tosin jotain höpinää, että kaikkia osumia ei saa ellei sitten maksa vähän...

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


18 Loka 2014 14:24
Profiili WWW
Hiljainen hämäläinen
Hiljainen hämäläinen

Liittynyt: 28 Joulu 2013 00:16
Viestit: 33
Paikkakunta: Pirkkala
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jaska kirjoitti:
Giösta kirjoitti:
Hei kaikille

Olen ajautumassa puolivahingossa jonkinlaiseksi "epäviralliseksi sukututkimus-dna-asiantuntijaksi" parin sukuseuran kohdalla ja koska en ihan oikeasti tiedä, mitä olen tekemässä niin haluaisin kysellä mielipiteitä ennenkuin neuvon ihan väärin ja suosittelen tekemään testejä.

Näissä minun tapauksissa sukuseuroilla on jo valmis sukukirja, joissa muinaisella s.n. 1600 esi-isällä on ainakin kaksi poikaa ja mieslinja jatkuu molemmista nykypäivään saakka. Olen ajatellut ehdottaa, että jos molemmista (useammista) haaroista tehdään esim. Y67-testi, niin sillä saadaan seuraavia asioita

- muinaisiin epämääräisiin henki- ja maakirjoihin perustuva sukujohto varmistetaan ... tai siis varmistetaan että nuo olivat oikeasti veljeksiä samasta isästä tai ainakin erottavia mutaatioita pitäisi olla aika vähän
- samalla saadaan selville y-haplorymä joka mahdollisesti kertoo jotakin tämän suvun alkuvaiheista ja
- kun näytteet on saatu Ftdna:n labraan, niin niitä voi sukuseuran budjetista tms. sitten myöhemmin ilman uutta dna-näytettä (jotkut ovat melko vastahankaisia) laajentaa näyte esim. Y111:een tai tilata tarkentavia lisä-snippejä, jotka kertovat ehkä hieman enemmän suvun alkuperästä

Onko tämä edes suunnilleen oikein? Eli jos alkaa kritisointi, niin edes perusteet pitäisi olla kohdallaan ...

Juuri noin, ei korjattavaa!
Rohkaisuksi olisi tietysti hyvä heittää jokin esimerkki jonkin toisen suvun selvityksistä siitä, miten geenitestit ja sukututkimus tukevat toisiaan ja millä lailla geenitesti tuo suuremman aikasyvyyden mukaan. Mutta ei nyt heti tule mieleen netistä löytyvää esimerkkitiedostoa... Heitelkööt muut linkkejä jos keksivät.


Moikka, olen tässä kesän kiireiden takia ollut passivinen foorumin seuraaja, muta nyt löysin kommentoitavaa. Giösta kyseli ja Jaskakin jo vastaili.

Olet täysin oikella tiellä.
Olen sukuseuran toimesta tehnyt vastaavan, joskin laajemman tutkimuksen. Testasimme 7 eri isälinjaa, joilla tutkitusti yhteinen esi-isä eli 400 vuotta sitten (vv. 1590 -1661).

Ensimmäiseksi piti määrittää yhteisen esi-isämme FHT eli lähtötilanne, joka on yhteinen kaikille sukuhaaroille. Se oli helppoa, koska testien lukumäärä oli näin suuri.

Mutaatioiden määrä eri sukuhaaroissa oli vähäinen, joskin eri sukuhaarojen päähän ero oli suurimmillaan 5/67. Tutkitut sukuhaarat erkanivat eri vuosisadoilla, joten mielenkiintoista oli sijoittaa ne sukupuuhun. Näin oli suhteellisen helppoa ajoittaa eri linjoissa tapahtuneet mutaatiot ja verrata niitä lähtöarvoon. Lopputuloksena oli, että kahdessa sukuhaarassa ei ole tapahtunut yhtään mutaatiota tänä aikana (n. 400 v.), kolmessa haarassa tapahtui 1 mutaatio ja suurin ero löytyi kahdessa haarassa eli 2/67.

Tämä on tietenkin vahvistanut tekemämme perinteisen sukututkimuksen oikeellisuuden ja avannut samalla mielenkiitoisen tutkimuskohteen selvittää juuriamme pidemmälle.

Tämä antaa osaltaan uutta näkemystä siihen, mikä on muaatioden tapahtumistieheys. Tämän mukaan paljon aiemmin vakiona pidettyä arvoa hitaampi.

Kit- numero on 234049, jolla pääsee STR-tuloksiin, muut numerot löytyy vierestä. Meillä on myös SNP:t L550- ja L1022+ ja Y-DNA 111 testi tehtynä em. Kit:lle. Odottelen osaltani neuvoja, millä testeillä järkevimmin voin päästä tästä eteenpäin. Tähän astiset tiedot viittaavat pohjois-Baltian kautta tulleisiin hämäläisiin, mutta aika näyttää, mitä löytyy.

Jos heräsi kysymyksiä, autan mielelläni.
terv. AR

_________________
N1a1a1a1a1a2a1a3~ ; L1022 > Y5004 > Y5005 > BY6003
(Antti Mäntzä, s. n. 1460, Sääksmäki Tyrväntö);
T2b9


05 Marras 2014 20:31
Profiili WWW
Näytä viestit ajalta:  Järjestä  
Vastaa viestiin   [ 437 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1 ... 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ... 22  Seuraava

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Ei rekisteröityneitä käyttäjiä ja 1 vierailijaa


Et voi kirjoittaa uusia viestejä
Et voi vastata viestiketjuihin
Et voi muokata omia viestejäsi
Et voi poistaa omia viestejäsi

Etsi tätä:
Hyppää:  
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group.
Designed by STSoftware.
Käännös, Lurttinen, www.phpbbsuomi.com uncommitted-decoy