Näytä vastaamattomat viestit | Näytä aktiiviset viestiketjut Tänään on 26 Huhti 2018 16:28



Vastaa viestiin  [ 450 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1, 2, 3, 4, 5 ... 23  Seuraava
 Geenejä testaamaan! Voit myös kysyä aiheesta 
Kirjoittaja Viesti
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 251
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Geno 2.0:n saa 159 dollarilla, alkup 199, tosin hetken se oli 149


12 Marras 2013 12:21
Profiili
Hiljainen hämäläinen
Hiljainen hämäläinen

Liittynyt: 31 Touko 2013 19:48
Viestit: 31
Paikkakunta: Helsinki
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Family Tree DNA:n Y-DNA 67 vai Geno 2.0?

Olen hankkimassa ensimmäistä geenitestiä ja päätynyt rajaamaan valinnan näihin kahteen. Rajallinen budjetti pakottaa valitsemaan vain toisen. Y-DNA 67 on nyt 189$, Geno 2.0 159$ joten hinta ei ole valintaperuste näiden välillä. Family Tree DNA:n testissä houkuttelee tuo 67 markkerin tuoma resoluutio isälinjassa. Toisaalta Geno 2.0 sisältää valtavan joukon snipsejä ja paljastaa myös äitilinjan. Kokeneempien vinkkejä, ehdotuksia? Onko tuosta Geno 2.0:sta kokemuksia foorumilaisilla?

_________________
http://tuhatkipinaa.blogspot.fi/


13 Marras 2013 17:32
Profiili WWW
SuuBaltti
SuuBaltti

Liittynyt: 12 Elo 2013 12:41
Viestit: 3646
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Y-67 on ainoaksi testiksi parempi vaihtoehto noista kahdesta vain mikäli testaaja on kiinnostunut löytämään isälinjan jakavia serkkuja.

Geno tosiaan selvittää haploryhmät sekä isä- että äitilinjoissa (omalla kohdallani molemmat niin tarkasti kuin tällä hetkellä on mahdollista SNP-tasolla) ja antaa myös arvion autosomaalisen perimän koostumuksesta.


13 Marras 2013 19:34
Profiili
Hiljainen hämäläinen
Hiljainen hämäläinen

Liittynyt: 31 Touko 2013 19:48
Viestit: 31
Paikkakunta: Helsinki
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Rekonpoika kirjoitti:
Y-67 on ainoaksi testiksi parempi vaihtoehto noista kahdesta vain mikäli testaaja on kiinnostunut löytämään isälinjan jakavia serkkuja.

Geno tosiaan selvittää haploryhmät sekä isä- että äitilinjoissa (omalla kohdallani molemmat niin tarkasti kuin tällä hetkellä on mahdollista SNP-tasolla) ja antaa myös arvion autosomaalisen perimän koostumuksesta.


Ilmeisesti Genon tulokset saa myös siirrettyä Family Tree DNA:n tietokantoihin ja esimerkiksi Suomi DNA-projektiin? Alan kyllä kallistua vahvasti Genon puoleen, hinta-laatu -suhde näyttäisi olevan kohdallaan ja tulosten visualisointi ja selvitys laadukasta esimerkkien perusteella.

_________________
http://tuhatkipinaa.blogspot.fi/


13 Marras 2013 22:58
Profiili WWW
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7186
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
FVM kirjoitti:
Rekonpoika kirjoitti:
Y-67 on ainoaksi testiksi parempi vaihtoehto noista kahdesta vain mikäli testaaja on kiinnostunut löytämään isälinjan jakavia serkkuja.

Geno tosiaan selvittää haploryhmät sekä isä- että äitilinjoissa (omalla kohdallani molemmat niin tarkasti kuin tällä hetkellä on mahdollista SNP-tasolla) ja antaa myös arvion autosomaalisen perimän koostumuksesta.


Ilmeisesti Genon tulokset saa myös siirrettyä Family Tree DNA:n tietokantoihin ja esimerkiksi Suomi DNA-projektiin? Alan kyllä kallistua vahvasti Genon puoleen, hinta-laatu -suhde näyttäisi olevan kohdallaan ja tulosten visualisointi ja selvitys laadukasta esimerkkien perusteella.

Geno on varmasti kilpailukykyinen yleistesti, eli sopiva valikoima snippejä niin kaikkien autosomien DNA:sta, mitokondriaalisesta DNA:sta kuin Y-kromosomin DNA:stakin. Snippien kokonaismäärässä se kuitenkin häviää reippaasti 23andMe:n Relative Finder -testille, joka siis on käyttökelpoisempi genominlaajuisella tasolla (yhteensä yli miljoona snippiä vs. genon yhteensä 150 000 snippiä). En tiedä, miten erilaisia tai samanlaisia snippejä nämä testaavat isä- ja äitilinjoista, mutta kovin suuria erot eivät liene.

Se, mikä FamilyTreeDNA:n isälinjatesteissä on ainutlaatuista, on STR-markkerien testaaminen (yleisin nykyään 67 markkeria). Eli jos haluaa konkreettisen haplotyypin verrattavaksi lähiosumia vasten mutaatio mutaatiolta (tähän tapaan: http://www.elisanet.fi/alkupera/SuomiN1c67.pdf ), niin FTDNA:n testi on ainoa - Geno tai Relative Finder ei tällaista STR-haplotyyppiä tuota, vaan kertoo pelkästään haploryhmän joltisellakin alahaploryhmätarkkuudella.

Eli vertailua tehdessä kannattaa arvioida kokonaisuutta sen kannalta mitä hakee:
- vain äitilinjatestinä Geno ajanee asiansa ja vastaa Relative Finderin tai FTDNA:n mitokondrio-DNA:n testejä;
- genominlaajuisena testinä se häviää Family Finderille (FamilyTreeDNA) ja Relative Finderille (23andMe) snippimäärässä, tosin 150 000 snippiä tuottaa jo ihan luotettavia tuloksia väestögenetiikassa;
- isälinjatestinä se on Relative Finderin tasolla, mutta näissä kummassakaan ei saa yksilöllistä haplotyyppiä kuten FTDNA:n Y-kromosomitesteissä. Jälkimmäisessä ei saa haploryhmätestiä samaan hintaan, mutta yleensä alahaploryhmänkin voi suurella varmuudella päätellä haplotyypistä. Toisaalta kaikki alahaploryhmien SNP:t pitää FTDNA:lla ostaa aina erikseen.

Jos itse haluaisin testata nyt kaiken mahdollisen, niin ottaisin Relative Finderin tai Genon (äitilinjan ja genominlaajuisen tason osalta, sekä isälinjan alahaploryhmien osalta) mutta lisäksi FamilyTreeDNA:lta testin Y-67 tai Y-111 (isälinjan tarkan haplotyypin saadakseni; äitilinjoissa ei sellaisia saavutetakaan).

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


14 Marras 2013 01:36
Profiili WWW
Hiljainen hämäläinen
Hiljainen hämäläinen

Liittynyt: 31 Touko 2013 19:48
Viestit: 31
Paikkakunta: Helsinki
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jaska kirjoitti:
Eli vertailua tehdessä kannattaa arvioida kokonaisuutta sen kannalta mitä hakee:
- vain äitilinjatestinä Geno ajanee asiansa ja vastaa Relative Finderin tai FTDNA:n mitokondrio-DNA:n testejä;
- genominlaajuisena testinä se häviää Family Finderille (FamilyTreeDNA) ja Relative Finderille (23andMe) snippimäärässä, tosin 150 000 snippiä tuottaa jo ihan luotettavia tuloksia väestögenetiikassa;
- isälinjatestinä se on Relative Finderin tasolla, mutta näissä kummassakaan ei saa yksilöllistä haplotyyppiä kuten FTDNA:n Y-kromosomitesteissä. Jälkimmäisessä ei saa haploryhmätestiä samaan hintaan, mutta yleensä alahaploryhmänkin voi suurella varmuudella päätellä haplotyypistä. Toisaalta kaikki alahaploryhmien SNP:t pitää FTDNA:lla ostaa aina erikseen.

Jos itse haluaisin testata nyt kaiken mahdollisen, niin ottaisin Relative Finderin tai Genon (äitilinjan ja genominlaajuisen tason osalta, sekä isälinjan alahaploryhmien osalta) mutta lisäksi FamilyTreeDNA:lta testin Y-67 tai Y-111 (isälinjan tarkan haplotyypin saadakseni; äitilinjoissa ei sellaisia saavutetakaan).


No niin, nyt haluan nuo kaikki :lol: Pitänee valmistautua siihen että nälkä kasvaa syödessä ja tämä nyt tehtävä testi on vain lähtölaukaus harrastukselle. Geno yleistestinä tuntuisi palkitsevimmalta näin alkuun kun geneettiset isä- ja äitilinjani ovat vielä täysin hämärän peitossa. Isälinjan tarkka haplotyyppi kiinnostaa myös. Se saa sitten olla seuraava askel kun on taas resursseja lisätesteihin.

_________________
http://tuhatkipinaa.blogspot.fi/


14 Marras 2013 02:05
Profiili WWW
Lipevä lappilainen
Lipevä lappilainen

Liittynyt: 16 Helmi 2011 21:58
Viestit: 468
Paikkakunta: Tampere
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Minä lähtisin liikkeelle - samoin kuin tein viisi vuotta sitten - vaiheittain eli ensin esim. FTDNA Y67 olettaen, että perinteinen sukututkimus on tehty riittävän pitkälle (ainakin kirkonkirjoista niin pitkälle kuin mahdollista). Tässäkin riittää pureksimista, tajuamista ja hyödyntämistä muutamaksi vuodeksi. Lisäksi saatat huomata, että suvussa olisi hyvä tehdä lisää testejä, jotta eri sukuhaarojen sukulaisuus saataisiin selville, mutta sukulaisilla voi olla ennakkoluuloja testaamista kohtaan. DNA-testi ei ole helppo oikotie sukututkimukseen tai historiaan, mutta parhaimmillaan rikastava ja avartava kokemus ja uusi maailma.

_________________
Jola
YDNA: N-BY30452 Pre-Savo (YFullin mukaan N-YP6269), mtDNA: H45a. Juuret pääosin Savosta ja Kainuusta


14 Marras 2013 12:01
Profiili
Hiljainen hämäläinen
Hiljainen hämäläinen

Liittynyt: 31 Touko 2013 19:48
Viestit: 31
Paikkakunta: Helsinki
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jola kirjoitti:
Minä lähtisin liikkeelle - samoin kuin tein viisi vuotta sitten - vaiheittain eli ensin esim. FTDNA Y67 olettaen, että perinteinen sukututkimus on tehty riittävän pitkälle (ainakin kirkonkirjoista niin pitkälle kuin mahdollista). Tässäkin riittää pureksimista, tajuamista ja hyödyntämistä muutamaksi vuodeksi. Lisäksi saatat huomata, että suvussa olisi hyvä tehdä lisää testejä, jotta eri sukuhaarojen sukulaisuus saataisiin selville, mutta sukulaisilla voi olla ennakkoluuloja testaamista kohtaan. DNA-testi ei ole helppo oikotie sukututkimukseen tai historiaan, mutta parhaimmillaan rikastava ja avartava kokemus ja uusi maailma.


Sukututkimusta on tehty niin että isälinja tunnetaan muistaakseni 1700-luvulle asti. Äitilinjassa olisi vielä pengottavaa, tällä hetkellä vanhin tunnettu esiäiti suorassa linjassa eli 1800-luvulla. Y67 tosiaan vaikuttaa antoisalta testiltä. Valinnan vaikeus...

_________________
http://tuhatkipinaa.blogspot.fi/


14 Marras 2013 16:29
Profiili WWW
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 28 Huhti 2012 20:54
Viestit: 114
Paikkakunta: Helsinki
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jos ei ole erityinen kiinnostus pelkästään y-DNA:n selvittämiseen, niin en käsitä miksi kukaan ikinä suosittelisi ftDNA:ta 23andme:n sijaan.
23andme on paljon miellyttävämpi käyttää/silmälle, paljon erilaisia ominaisuuksia mitä ftDNA:ssa ei ole ja mikä tärkeintä: monta kertaa suurempi database.

Tietysti kyse on siitä mitä haluaa. Itseä kiinnostaa enemmän löytää koko DNA:sta matcheja ja tietoja, kuin pelkkä suppea, joskin tarkka, y-DNA:n analyysi paljon pienemmässä tietokannassa.


14 Marras 2013 20:03
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 28 Touko 2012 21:24
Viestit: 141
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
No niin, nyt on Big Y tulossa - jännittävä nähdä, onko siitä mihinkään so. löytyykö omaan Y-linjaan mitään tarkennuksia tms., joita Geno 2.0 ei tuonut.


14 Marras 2013 22:28
Profiili
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7186
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jerry kirjoitti:
Jos ei ole erityinen kiinnostus pelkästään y-DNA:n selvittämiseen, niin en käsitä miksi kukaan ikinä suosittelisi ftDNA:ta 23andme:n sijaan.

Tuskin kukaan rajoittuu pelkkään Y:hyn, mutta muualta ei saa haplotyyppiä selville kuin FTDNA:lta, mikä jättäisi selvittelyt aika pintapuolisiksi.

Jerry kirjoitti:
23andme on paljon miellyttävämpi käyttää/silmälle, paljon erilaisia ominaisuuksia mitä ftDNA:ssa ei ole ja mikä tärkeintä: monta kertaa suurempi database.

Missä siihen tietokantaan voi tutustua? Vai näkeekö kukin vain omat osumansa kuten FTDNA:n Family Finderissakin?
Toki esim. IBS-arvot kai tulevat 23andMe:ssä mukana; mutta mitäs muita ominaisuuksia tulee?

Bertarido kirjoitti:
No niin, nyt on Big Y tulossa - jännittävä nähdä, onko siitä mihinkään so. löytyykö omaan Y-linjaan mitään tarkennuksia tms., joita Geno 2.0 ei tuonut.

Erittäin mielenkiintoista! Tuo on siis kai vähän samanlainen kuin "Walk through Y"? Tuloksesi voi auttaa selvittämään ryhmäsi alarakennetta. Yritän päivittää pikapuoliin siltä osin haplotyyppipuuta, että pääsen testaamaan STR-ennustustani uusia snippejä vasten. :wink:

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


15 Marras 2013 17:55
Profiili WWW
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 28 Touko 2012 21:24
Viestit: 141
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jaska kirjoitti:
Bertarido kirjoitti:
No niin, nyt on Big Y tulossa - jännittävä nähdä, onko siitä mihinkään so. löytyykö omaan Y-linjaan mitään tarkennuksia tms., joita Geno 2.0 ei tuonut.

Erittäin mielenkiintoista! Tuo on siis kai vähän samanlainen kuin "Walk through Y"? Tuloksesi voi auttaa selvittämään ryhmäsi alarakennetta. Yritän päivittää pikapuoliin siltä osin haplotyyppipuuta, että pääsen testaamaan STR-ennustustani uusia snippejä vasten. :wink:


Se on joo WTY:n kaltainen, tosin paljon kattavampi. Ei ole mitään megaisoja odotuksia sen suhteen, mitä sieltä olisi tulossa, koska lähiosumia ei nykyiselläänkään ole juurikaan eikä oman ryhmän (CTS9976+, L1022-) sisällä testattuja ole nykyisilläkään SNP:eillä kuin pari hassua. Ehkäpä joku rajantakainen "veli kulta veikkoseni" testaa laajemmin ja onhan sitä nytkin jo oma SNP (CTS3451), josta löytyy Suomesta toinenkin osuma 1000 Genomes -projektista.


17 Marras 2013 13:14
Profiili
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7186
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Bertarido kirjoitti:
Jaska kirjoitti:
Bertarido kirjoitti:
No niin, nyt on Big Y tulossa - jännittävä nähdä, onko siitä mihinkään so. löytyykö omaan Y-linjaan mitään tarkennuksia tms., joita Geno 2.0 ei tuonut.

Erittäin mielenkiintoista! Tuo on siis kai vähän samanlainen kuin "Walk through Y"? Tuloksesi voi auttaa selvittämään ryhmäsi alarakennetta. Yritän päivittää pikapuoliin siltä osin haplotyyppipuuta, että pääsen testaamaan STR-ennustustani uusia snippejä vasten. :wink:


Se on joo WTY:n kaltainen, tosin paljon kattavampi. Ei ole mitään megaisoja odotuksia sen suhteen, mitä sieltä olisi tulossa, koska lähiosumia ei nykyiselläänkään ole juurikaan eikä oman ryhmän (CTS9976+, L1022-) sisällä testattuja ole nykyisilläkään SNP:eillä kuin pari hassua. Ehkäpä joku rajantakainen "veli kulta veikkoseni" testaa laajemmin ja onhan sitä nytkin jo oma SNP (CTS3451), josta löytyy Suomesta toinenkin osuma 1000 Genomes -projektista.

Kas kas, olisikohan se jo "oikeasti" sukua? Siis sukuhistoriallisella aikajänteellä.
Kunhan hinnat tulevat alas, niin selvästi useampi varmaankin testaa tuossa laajuudessa, jolloin alkaa niitä alaryhmiäkin löytyä SNP-perusteisesti.

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


17 Marras 2013 16:58
Profiili WWW
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 28 Huhti 2012 20:54
Viestit: 114
Paikkakunta: Helsinki
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jaska kirjoitti:
Jerry kirjoitti:
Jos ei ole erityinen kiinnostus pelkästään y-DNA:n selvittämiseen, niin en käsitä miksi kukaan ikinä suosittelisi ftDNA:ta 23andme:n sijaan.

Tuskin kukaan rajoittuu pelkkään Y:hyn, mutta muualta ei saa haplotyyppiä selville kuin FTDNA:lta, mikä jättäisi selvittelyt aika pintapuolisiksi.

Jerry kirjoitti:
23andme on paljon miellyttävämpi käyttää/silmälle, paljon erilaisia ominaisuuksia mitä ftDNA:ssa ei ole ja mikä tärkeintä: monta kertaa suurempi database.

Missä siihen tietokantaan voi tutustua? Vai näkeekö kukin vain omat osumansa kuten FTDNA:n Family Finderissakin?
Toki esim. IBS-arvot kai tulevat 23andMe:ssä mukana; mutta mitäs muita ominaisuuksia tulee?


Mitä tarkoitat, että muaalta ei saa haplotyyppiä selville? Saahan... ei tosin yhtä tarkasti.

Toiseen pointtiin:
Niin, no siis, jos monta kertaa enemmän ihmisiä on tehnyt testin toisessa paikasssa, niin kai on luonnollista, että nuo IBD-matchit ovat silloin mielenkiintoisempia? Itse ainakin pidän mielenkiintoisena "serkkujen" löytämistä eri paikoista, ja sitä kautta sukuhaarojen tarkentumista, ja siihen ihan todennäköisyyksien pohjalta 23andme on parempi.

Lisäksi 23andme on interaktiivinen ja "dynaamisempi", tuolla on keskusteluja ja asioita muuttuu ja tulee uusia ominaisuuksia, kun taas ftDNA näyttää minun silmiini samalta vuodesta toiseen. ftDNA on graafisesti mielestäni kuin MS-DOS ja 23andme sitten jokin uusi Windows (en tiedä tosin onko sama analogia myös toimivuuteen......).
Siis i


19 Marras 2013 12:36
Profiili
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7186
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jerry kirjoitti:
Mitä tarkoitat, että muaalta ei saa haplotyyppiä selville? Saahan... ei tosin yhtä tarkasti.

Käsittääkseni ei saa - haplotyyppi on siis tällainen pitkä, STR-mutaatioihin perustuva yksilöllinen lukusarja, joita tietokannoissa on listattu:
http://www.familytreedna.com/public/n1c ... n=yresults

Geno, 23andMe ja muut selvittävät vain SNP:itä, eivät STR:iä. Ne kertovat siis vain alahaploryhmän, esim. N1c1a1a1a1a1a1a1a1... jne. mutteivät tuota yksilöllistä haplotyyppiä.

Jerry kirjoitti:
Toiseen pointtiin:
Niin, no siis, jos monta kertaa enemmän ihmisiä on tehnyt testin toisessa paikasssa, niin kai on luonnollista, että nuo IBD-matchit ovat silloin mielenkiintoisempia? Itse ainakin pidän mielenkiintoisena "serkkujen" löytämistä eri paikoista, ja sitä kautta sukuhaarojen tarkentumista, ja siihen ihan todennäköisyyksien pohjalta 23andme on parempi.

FamilyTreeDNA mainostaa itseään: "90% of genealogists choose Family Tree DNA - with the largest DNA database." http://www.familytreedna.com/

Miten näitä eri firmojen väitteitä voisi verrata/varmentaa? Haluaisin nähdä konkreettisia lukuja, ettei kuluttaja tule harhaanjohdetuksi.

Jerry kirjoitti:
Lisäksi 23andme on interaktiivinen ja "dynaamisempi", tuolla on keskusteluja ja asioita muuttuu ja tulee uusia ominaisuuksia, kun taas ftDNA näyttää minun silmiini samalta vuodesta toiseen. ftDNA on graafisesti mielestäni kuin MS-DOS ja 23andme sitten jokin uusi Windows (en tiedä tosin onko sama analogia myös toimivuuteen......).

FTDNA:llakin on keskustelufoorumi, ja käyttöliittymä muuttui juuri.
Mitä osioita vertaat graafisesti? Käyttäjän omia tulossivuja vai mitä? En ole nähnyt 23andMe:n tulossivustoa, oletko sinä nähnyt FTDNA:n tulossivuja? Näistä olisi kiva saada jokin vertailu.

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


19 Marras 2013 16:29
Profiili WWW
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 28 Huhti 2012 20:54
Viestit: 114
Paikkakunta: Helsinki
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Menee mielestäni hieman semantiikan puolelle tuo haplotyypin määritelmä. 23andme:stä saa tietoonsa, että esim. minä olen n1c1* ja H1. Mielestäni tämä ei ole nollainformaatiota, vaan itselle jo kertoo ihan hyvin haplotyypeistäni, vaikka ei kaikkia STR-mutaatioita paljastakaan.
Toki hienoahan siitä enemmän on saada tietoa, siksi minäkin olen ftDNA:n asiakas.

Minulla on siis tulokset molemmissa, ja molempia käytän. Olen 100% varma, että 23andme:lla on isompi asiakaskunta, ja varmasti se on todettavissakin, mutta nyt ei ole aikaa etsiä.
Se nyt on yksi esimerkki kuitenkin, että ftDNA family finderissä minulla on n.200 sukulaista, ja 23andme:ssä n. 1200 kpl. Saattaa toki olla, että thresholdit ovat noissa erilaiset.
ftDNA.n keskusteluosioista en tiennyt, OK.

PS. Juuri tätä kirjoittaessani kirjauduin ftDNA:n sivustolle, ja ainakin Family Finder sivu oli kokenut jonkinlaisen face liftin ja näyttää paremmalta nyt silmiini :D Ehkä olin vähän liian hätäinen.
Itse pidän enemmän kuitenkin 23andme:stä, mutta toki tämä on vain oma mielipiteeni.


19 Marras 2013 18:46
Profiili
Sutki savolainen
Sutki savolainen

Liittynyt: 08 Tammi 2012 22:13
Viestit: 655
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
FTDNA:n Family Finder-tuote ei ole kaikilla asiakkailla, joten vertailu ei tässä kohtaa toimi. Henkilökohtaisesti 23andMe:ssä ei ole tapahtunut viime aikoina, AC on huono ja Global similarity-kartoissakaan ei osu European-tasoa tarkemmin vertailuun. Olen kuulemma sukua Jesse Jamesille. Nopea vetämään vai kuinka se oli?

*Edit. FTDNA:lla näyttää olevan jokin ale menossa. Minähän sanoin, että joulu on taas. Itse en taida tilata nyt juuri mitään ennenkuin joku käskee tai näkee ensin mitä nuo laajat uudet testit tuovat tullessaan.

http://www.familytreedna.com/products.aspx

Lainaa:
Jaska: Geno tai Relative Finder ei tällaista STR-haplotyyppiä tuota, vaan kertoo pelkästään haploryhmän joltisellakin alahaploryhmätarkkuudella


Tarkkuushan on tasoa N1c1* ainakin minulla 19.11.2013.


19 Marras 2013 19:06
Profiili
SuuBaltti
SuuBaltti

Liittynyt: 12 Elo 2013 12:41
Viestit: 3646
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
23andMe:llä on parhaillaan käynnissä Ancestry Compositionin uudistus jonka pitäisi korjata overfitting-ongelmat ja lisätä populaatioita.

Lisäksi muutaman viikon kuluessa siellä otetaan käyttöön uusi v4-siru, joka mahdollisesti on parempi haploryhmien kanssa.

http://blog.23andme.com/news/23andmes-new-custom-chip/


19 Marras 2013 19:40
Profiili
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 7186
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Jerry kirjoitti:
Menee mielestäni hieman semantiikan puolelle tuo haplotyypin määritelmä. 23andme:stä saa tietoonsa, että esim. minä olen n1c1* ja H1. Mielestäni tämä ei ole nollainformaatiota, vaan itselle jo kertoo ihan hyvin haplotyypeistäni, vaikka ei kaikkia STR-mutaatioita paljastakaan.
Toki hienoahan siitä enemmän on saada tietoa, siksi minäkin olen ftDNA:n asiakas.

Kyllä se on ihan oikea ero eikä semantiikkaa:
- haploryhmätaso selviää SNP:istä
- haplotyyppitaso (yksilötaso) selviää STR:istä

Ei tietenkään ensimmäinenkään ole nollainformaatiota, mutta se ei myöskään ole kaikista tarkin mahdollinen taso.

Jerry kirjoitti:
Minulla on siis tulokset molemmissa, ja molempia käytän. Olen 100% varma, että 23andme:lla on isompi asiakaskunta, ja varmasti se on todettavissakin, mutta nyt ei ole aikaa etsiä.
Se nyt on yksi esimerkki kuitenkin, että ftDNA family finderissä minulla on n.200 sukulaista, ja 23andme:ssä n. 1200 kpl. Saattaa toki olla, että thresholdit ovat noissa erilaiset.
ftDNA.n keskusteluosioista en tiennyt, OK.

23andMe kertoo, että heillä on 400 000 asiakasta; FTDNA:lta en löydä mitään lukumäärätietoa, ei myöskään Wikipediasta. En tiedä, mihin he perustavat väitteensä "90 % sukututkijoista". Genominlaajuinen testi tuli FTDNA:lle vasta 2010, joten varmaankin sillä tasolla testattuja on vähemmän kuin 23andMe:llä. Isä- ja äitilinjatestejä on kuitenkin tehty jo pitkään.

Jerry kirjoitti:
PS. Juuri tätä kirjoittaessani kirjauduin ftDNA:n sivustolle, ja ainakin Family Finder sivu oli kokenut jonkinlaisen face liftin ja näyttää paremmalta nyt silmiini :D Ehkä olin vähän liian hätäinen.
Itse pidän enemmän kuitenkin 23andme:stä, mutta toki tämä on vain oma mielipiteeni.

Olihan se aiempi käyttöliittymä ankea, eikä esim. Population finder toimi vieläkään järkevästi (minä olen muka 100 % venäläinen), joten mitään ekstraherkkuja ei FTDNA tarjoa. Chromosome browser on potentiaalisesti hyödyllinen mutta vaatisi niin paljon osumien vertailujen läpikäymistä, etten ole vielä jaksanut...

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


19 Marras 2013 20:00
Profiili WWW
Sutki savolainen
Sutki savolainen

Liittynyt: 08 Tammi 2012 22:13
Viestit: 655
Viesti Re: Geenejä testaamaan!
Tuota FTDNA:n Population Finderia en muistanutkaan eli löytyi Europe Finnish 100,00% ±0,01%. 23andMe AC näyttää 99.9% Finnish ja < 0.1% Nonspecific East Asian & Native American & Sub-Saharan African. Taas olen hieman viisaampi tässäkin asiassa.


19 Marras 2013 20:23
Profiili
Näytä viestit ajalta:  Järjestä  
Vastaa viestiin   [ 450 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1, 2, 3, 4, 5 ... 23  Seuraava

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Google [Bot], Kinaporin kalifi ja 3 vierailijaa


Et voi kirjoittaa uusia viestejä
Et voi vastata viestiketjuihin
Et voi muokata omia viestejäsi
Et voi poistaa omia viestejäsi

Etsi tätä:
Hyppää:  
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group.
Designed by STSoftware.
Käännös, Lurttinen, www.phpbbsuomi.com uncommitted-decoy