Switch to full style
Genetiikka tutkii menneisyyttä geenien kautta ja (fyysinen) antropologia ihmisen kehonmittojen kautta.

Lähetä vastaus

Re: Geenejä testaamaan!

19 Marras 2013 20:31

Tuohikirje kirjoitti:FTDNA:n Family Finder-tuote ei ole kaikilla asiakkailla, joten vertailu ei tässä kohtaa toimi. Henkilökohtaisesti 23andMe:ssä ei ole tapahtunut viime aikoina, AC on huono ja Global similarity-kartoissakaan ei osu European-tasoa tarkemmin vertailuun. Olen kuulemma sukua Jesse Jamesille. Nopea vetämään vai kuinka se oli?

Tai geneettinen taipumus tulla selkään ammutuksi/puukotetuksi? :wink:

Tuohikirje kirjoitti:
Jaska kirjoitti:Geno tai Relative Finder ei tällaista STR-haplotyyppiä tuota, vaan kertoo pelkästään haploryhmän joltisellakin alahaploryhmätarkkuudella

Tarkkuushan on tasoa N1c1* ainakin minulla 19.11.2013.

Sieltä varmaan olisi käsityönä löydettävissä tarkempikin. Eli katsoo esim. ISOGGin puuta:
http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpN.html

Sinun pitäisi siis ulottua tuonne alahaploryhmään N1c1a1a2a1 saakka, eli mutaatio Z1941 olisi vielä positiivinen. Genossa ei valitettavasti ole Y-kromosomista kuin CTS- ja F-alkuisia SNP:itä, eikä alahaploryhmien kannalta olennaisia kohtia löydy.

23andMe:n testin kannalta hankalaa on, että he käyttävät rs-koodeja, joita taas täällä SNP-listassa ei käytetä:
http://www.familytreedna.com/faq/answers.aspx?id=26

Pitäisi saada muuntotaulukot kaikille näille eri koodausjärjestelmille, että voisi penkoa esiin oman alahaploryhmänsä.

Re: Geenejä testaamaan!

19 Marras 2013 20:51

Jessen ankeasta lopusta huolimatta sukulainen T2c jäi kuitenkin jäljelle (23andMe:n mukaan) :mrgreen:

Niin, ongelmahan 23andMe:n puolella ovat juuri nuo rs + kirjaimet tavallisille pulliaisille ilman muuta lisätietoa tai muuntovälineitä.

Re: Geenejä testaamaan!

20 Marras 2013 11:07

Bertarido kirjoitti:No niin, nyt on Big Y tulossa - jännittävä nähdä, onko siitä mihinkään so. löytyykö omaan Y-linjaan mitään tarkennuksia tms., joita Geno 2.0 ei tuonut.

Tuosta Big Y-testistä käydään keskustelua FTDNA:n forumilla.Siellä esitetään tervettä kritiikkiä,kun pitäisi ostaa sika säkissä.http://forums.familytreedna.com/showthread.php?t=33754

Re: Geenejä testaamaan!

21 Marras 2013 11:56

Tämä 23andmen Ancestry Composition on ollut jo nyt omituinen tester, ja omituisemmaksi se on tulossa kunhan saavat meneillään olevat päivitykset suoritetuksi loppuun. Olin yhteydessä firman asiakaspalveluun esimerkkien voimin, eivät vaivautuneet vastaamaan. Tästä on jo puoli vuotta. Nyt kun mulla on tämä blogi (ja olen jo munannut itseni :oops: ), niin pistän tekstiä ylitsepääsemättömin todistein, kunhan ne ovat ensin möhlineet loppuun :-). Myyvät fantasiaa.
Viimeksi muokannut Sigfrid päivämäärä 21 Marras 2013 15:08, muokattu yhteensä 1 kerran

Re: Geenejä testaamaan!

21 Marras 2013 13:53

Sigfrid kirjoitti:Tämä 23andmen Ancestry Composition on ollut jo nyt omituinen tester, ja omituisemmaksi se on tulossa kunhan saavat meneillään olevat päivitykset suoritetuksi loppuun. Olin yhteydessä firman asiakaspalveluun esimerkkien voimin, eivät vaivautuneet vastaamaan. Tästä on jo puoli vuotta. Nyt kun mulla on tämä blogi, niin pistän tekstiä ylitsepääsemättömin todistein, kunhan ne ovat ensin möhlineet loppuun :-). Myyvät fantasiaa.

Kuulostaa mielenkiintoiselta.

Re: Geenejä testaamaan!

21 Marras 2013 14:21

Jaska kirjoitti:
Sigfrid kirjoitti:Tämä 23andmen Ancestry Composition on ollut jo nyt omituinen tester, ja omituisemmaksi se on tulossa kunhan saavat meneillään olevat päivitykset suoritetuksi loppuun. Olin yhteydessä firman asiakaspalveluun esimerkkien voimin, eivät vaivautuneet vastaamaan. Tästä on jo puoli vuotta. Nyt kun mulla on tämä blogi, niin pistän tekstiä ylitsepääsemättömin todistein, kunhan ne ovat ensin möhlineet loppuun :-). Myyvät fantasiaa.

Kuulostaa mielenkiintoiselta.


Varmaankin, ehkä ei kuitenkaan 23andmen näkökulmasta. Ne ovat uusimassa Ancestry Composition -testiään. Vanhassa versiossa on ollut merkittäviä ongelmia, joita on nyt vuoden ajan korjattu ja korjauksia juuri nyt päivitetään. Oletan kuitenkin, että saan vielä senkin jälkeen kommentoitavaa :)

Re: Geenejä testaamaan!

21 Marras 2013 15:06

Karoliini kirjoitti:
Bertarido kirjoitti:No niin, nyt on Big Y tulossa - jännittävä nähdä, onko siitä mihinkään so. löytyykö omaan Y-linjaan mitään tarkennuksia tms., joita Geno 2.0 ei tuonut.

Tuosta Big Y-testistä käydään keskustelua FTDNA:n forumilla.Siellä esitetään tervettä kritiikkiä,kun pitäisi ostaa sika säkissä.http://forums.familytreedna.com/showthread.php?t=33754


Joo toki olen tuosta ongelmatiikasta tietoinen eikä minulla olekaan suuria illuusioita tämän suhteen. Toisaalta välillä voi yllättyä iloisesti kuten vaikka Geno 2.0:sta, joka toi itselleni kaksi uutta SNP:iä. Jos tästä saisi edes sen, olisin aika tyytyväinen. Samaten suhtaudun tähän kuten johonkin köyhän miehen WTY:hyn, koska merkitykselliset SNP-tuloksethan vaativat, että sukulaismiehet lähellä ja kaukana testaisivat itseään - voisihan sitä laittaa koko Y-kromosomin testin läpi, mutta tosi hyödyllistä tietää ne tulokset yksin.

Re: Geenejä testaamaan!

23 Marras 2013 15:07

Bertarido kirjoitti:
Karoliini kirjoitti:
Bertarido kirjoitti:No niin, nyt on Big Y tulossa - jännittävä nähdä, onko siitä mihinkään so. löytyykö omaan Y-linjaan mitään tarkennuksia tms., joita Geno 2.0 ei tuonut.

Tuosta Big Y-testistä käydään keskustelua FTDNA:n forumilla.Siellä esitetään tervettä kritiikkiä,kun pitäisi ostaa sika säkissä.http://forums.familytreedna.com/showthread.php?t=33754


Joo toki olen tuosta ongelmatiikasta tietoinen eikä minulla olekaan suuria illuusioita tämän suhteen. Toisaalta välillä voi yllättyä iloisesti kuten vaikka Geno 2.0:sta, joka toi itselleni kaksi uutta SNP:iä. Jos tästä saisi edes sen, olisin aika tyytyväinen. Samaten suhtaudun tähän kuten johonkin köyhän miehen WTY:hyn, koska merkitykselliset SNP-tuloksethan vaativat, että sukulaismiehet lähellä ja kaukana testaisivat itseään - voisihan sitä laittaa koko Y-kromosomin testin läpi, mutta tosi hyödyllistä tietää ne tulokset yksin.

Sieltä on tulossa myös Geno 3.0,joka myös sisältää uusia Y-kromosomin snipsejä. Jonkin verran mietityttää nyt myös yksityisyyden suoja,kun Y-kromosomin kartoitus etenee vauhdilla.Y on edelleenkin arvoitus suurilta osin,mutta entäpä kun tulevaisuudessa tutkimustieto lisääntyy ja tietyt snipsit yhdistetään tiettyihin funktioihin.Lisäksi Y-kromosomi ei ole enää puhtaasti oma yksityisasiani,vaan myös muut sukuni miehet Y-linjassa ovat asianomistajia.Tästä en ole toistaiseksi nähnyt juurikaan keskustelua.

Re: Geenejä testaamaan!

24 Marras 2013 08:18

Jaska kirjoitti:... 23andMe:n Relative Finder -testille ...

Hieman selvennystä tähän: 23andMe ei tarjoa mitään muuta kuin sen yhden ainoan testin. Nettisivuilla on sitten tarjolla erilaisia työkaluja, joiden avulla testin tarjoamasta datasta voi saada irti mielenkiintoista tietoa. Yksi näistä työkaluista oli aiemmin nimeltään Relative Finder, mutta nettisivu-uudistuksen jälkeen se on DNA Relatives.

Ja oma suositukseni aloittelijalle on juuri tuo 23andMe. Se tarjoaa parhaimman hinta/laatu-suhteen, kun mukana on terveyteen liittyvää tietoa, serkkujenetsintätyökalu (eli se DNA Relatives), isä- ja äitilinjat (tosin muiden firmojen testeillä saa tarkemmat tulokset), yms.

Geno tarjoaa ilmeisesti parempaa dataa, mutta nettisivut olivat aikamoinen pettymys. Ne eivät kerro siitä datasta kovinkaan paljon, eli jos siitä haluaa saada kaiken irti, joutuu itse tekemään työtä sen eteen. Ei siis välttämättä sovellu aloittelijalle.

Re: Geenejä testaamaan!

24 Marras 2013 21:15

Pahis kirjoitti:
Jaska kirjoitti:... 23andMe:n Relative Finder -testille ...

Hieman selvennystä tähän: 23andMe ei tarjoa mitään muuta kuin sen yhden ainoan testin. Nettisivuilla on sitten tarjolla erilaisia työkaluja, joiden avulla testin tarjoamasta datasta voi saada irti mielenkiintoista tietoa. Yksi näistä työkaluista oli aiemmin nimeltään Relative Finder, mutta nettisivu-uudistuksen jälkeen se on DNA Relatives.

Okei, kiitos tarkennuksesta.

Re: Geenejä testaamaan!

25 Marras 2013 13:21

Thomas Krahn on pistänyt pystyyn oman puulaakin.Hänethän valitettavasti potkittiin ulos FTDNA:lta.
Hinnat ovat ainakin kohtuulliset! http://www.yseq.net/

Re: Geenejä testaamaan!

25 Marras 2013 15:41

Karoliini kirjoitti:Thomas Krahn on pistänyt pystyyn oman puulaakin.Hänethän valitettavasti potkittiin ulos FTDNA:lta.
Hinnat ovat ainakin kohtuulliset! http://www.yseq.net/

Joo, kilpailukykyiset hinnat ja testin räätälöintimahdollisuus, jos ymmärsin oikein.
Kiitos tiedosta!

Re: Geenejä testaamaan!

25 Marras 2013 23:03

Mielenkiintoista seurata,mitä tulee tapahtumaan ,kun FDA on puuttunut 23andMe:n testeihin,siis tuon lääketieteellisen tiedon ja ennusteiden luotettavuuteen.
http://www.fda.gov/ICECI/EnforcementAct ... 376296.htm

Re: Geenejä testaamaan!

26 Marras 2013 00:59

Karoliini kirjoitti:Mielenkiintoista seurata,mitä tulee tapahtumaan ,kun FDA on puuttunut 23andMe:n testeihin,siis tuon lääketieteellisen tiedon ja ennusteiden luotettavuuteen.
http://www.fda.gov/ICECI/EnforcementAct ... 376296.htm

Jopas nyt... Ilmeisesti testin markkinoiminen lääketieteellisesti valaisevana on jotenkin kyseenalaista?

Re: Geenejä testaamaan!

26 Marras 2013 10:17

Jaska kirjoitti:
Karoliini kirjoitti:Mielenkiintoista seurata,mitä tulee tapahtumaan ,kun FDA on puuttunut 23andMe:n testeihin,siis tuon lääketieteellisen tiedon ja ennusteiden luotettavuuteen.
http://www.fda.gov/ICECI/EnforcementAct ... 376296.htm

Jopas nyt... Ilmeisesti testin markkinoiminen lääketieteellisesti valaisevana on jotenkin kyseenalaista?


Kun yksi SNP on riski ja toinen suojaava ja löytöjärjestys yleensä tulee riski-SNP edellä, niin tulos on yleensä tämän yksittäisen löydön osalta riskivoittoinen ja tämän alleelin kokonaisriskit arvioitu liian suuriksi. Siis kun kootaan 10000 kakkostyypin sokeritautia sairastavaa ja haetaan riski-SNP:t vertaamalla muuhun väestöön, niin löydetään ne henkilöt, joilta puuttuu suojaava SNP (alleeliarvo toisessa paikassa). Ehkä olen väärässä, mutta minusta tulokset 23andmessä näyttävät tällaiselta.

Re: Geenejä testaamaan!

26 Marras 2013 17:46

Yhdysvaltain lääkintöviranomainen FDA on nyt kieltänyt yhtiöltä geenitestien markkinoinnin, Nature kertoi. FDA on huolissaan mahdollisesti epätarkkojen testien kansanterveydellisistä vaikutuksista. Yhtiö on luvannut noudattaa FDA:n määräyksiä.



http://www.iltasanomat.fi/ulkomaat/art- ... 48485.html

Re: Geenejä testaamaan!

05 Joulu 2013 01:19

23andMe päivittää käyttäjien Ancestry Compositionia tällä hetkellä. Jotkut ovat jo saaneet päivitetyt tulokset, tässä esimerkki miten luvut muuttuivat yhdellä suomalaisella.

Ennen (spekulatiivisilla asetuksilla):
100% Finnish.

Jälkeen:
92,4% Finnish
0,9% British & Irish
0,2% Scandinavian
4,6% Nonspecific Northern European
1,6% Eastern European
0,3% Nonspecific European
<0,1% Central & South African
<0,1% Unassigned

Re: Geenejä testaamaan!

05 Joulu 2013 02:03

Rekonpoika kirjoitti:23andMe päivittää käyttäjien Ancestry Compositionia tällä hetkellä. Jotkut ovat jo saaneet päivitetyt tulokset, tässä esimerkki miten luvut muuttuivat yhdellä suomalaisella.

Ennen (spekulatiivisilla asetuksilla):
100% Finnish.

Jälkeen:
92,4% Finnish
0,9% British & Irish
0,2% Scandinavian
4,6% Nonspecific Northern European
1,6% Eastern European
0,3% Nonspecific European
<0,1% Central & South African
<0,1% Unassigned

Tuohan vaikuttaa ihan lupaavalta!

Re: Geenejä testaamaan!

05 Joulu 2013 12:07

Juuh, pitää paikkansa!

Minä olin ennen 23andme:ssä 100% suomalainen kaikilla asetuksilla, koska olin ollut liian noheva ja ilmoittanut isovanhempieni kansallisuudet. Ei ollut mitään järkeä tuloksessa verrattuna isoäidin ja vanhempien tulokseen + siihen, että suvussa on joitain 1600 & 1700-luvun ulkomaalaisia..

Nyt muuttui tälläiseksi spekulatiivisessa:
Kuva

Standard settingseillä olen 66.7% suomalainen, ja konservatiivisessa enää vaan 28.7% pystytään todentamaan suomalaiseksi. "Konservatiivinen" arvio oli tosiaan ennen 100% :D

Re: Geenejä testaamaan!

05 Joulu 2013 14:09

Tuohikirje kirjoitti:Tuota FTDNA:n Population Finderia en muistanutkaan eli löytyi Europe Finnish 100,00% ±0,01%. 23andMe AC näyttää 99.9% Finnish ja < 0.1% Nonspecific East Asian & Native American & Sub-Saharan African. Taas olen hieman viisaampi tässäkin asiassa.


Tosiaan minulla on muuttunut myös (standard asetus kunnes toisin mainitaan) eli East Asian kohdistettu populaatioon Yakut ja Sub-Saharan African putosi pois.

99.9%
European
Northern European

89.5% Finnish
0.2% Scandinavian
8.5% Nonspecific Northern European
1.7% Nonspecific European

0.1%
East Asian & Native American
East Asian

< 0.1% Yakut
< 0.1% Nonspecific East Asian
< 0.1% Unassigned
Lähetä vastaus