Näytä vastaamattomat viestit | Näytä aktiiviset viestiketjut Tänään on 19 Loka 2017 10:03



Vastaa viestiin  [ 84 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1, 2, 3, 4, 5  Seuraava
 N-Z5038 
Kirjoittaja Viesti
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Ilpo kirjoitti:
Onko näille testituloksille tehty Fluxus-analyysiä tai cladogrammia?


Tuossa on pari, jotka tein juuri äsken. En ymmärrä asiasta juurikaan, kunhan vain tein kuvat.

Kaikki joilla lukee Z-5038 haploryhmänä Ftdna projekteissa
http://imgur.com/zBfCpug

Minä ja kaikki gd3,4,5 @67 henkilöt riippumatta siitä, mitä haploryhmässä lukee
http://imgur.com/6i9srWS

Siirsin kuvissa paria nodea ihan millin, jotta tekstit ei jäisi toisten alle.

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


17 Touko 2017 14:48
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
Z5038* (YF07897)


Tämä kit on minun hallinnoima ja jopa aikaansaama. Mutta se en ole minä itse. Varsin kiinnostunut olen hänen mätseistä ja geeneistä kun mätsejä tulee paljon tiheämmin kuin minulle itselle. Ja mahdollisesti saan kohtuullisen läheisen sukulaisen myös teettämään YFull-testin.


17 Touko 2017 14:53
Profiili
Lipevä lappilainen
Lipevä lappilainen

Liittynyt: 17 Tammi 2014 18:19
Viestit: 469
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
Kaikki joilla lukee Z-5038 haploryhmänä Ftdna projekteissa
http://imgur.com/zBfCpug

Näistä #166675 ja #444329 ovat N-Z4786, jotka asettuvat kauniisti omaan haaraansa, mutta myös #557917, joka ei ole samassa.


17 Touko 2017 15:48
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
Kaikki joilla lukee Z-5038 haploryhmänä Ftdna projekteissa
http://imgur.com/zBfCpug

Minä ja kaikki gd3,4,5 @67 henkilöt riippumatta siitä, mitä haploryhmässä lukee
http://imgur.com/6i9srWS


Kiitos! Löysin molemmista FTDNA kitin #459876. Haluaisin viedä tämän Karjala DNA projektiin keskusteluihin, jotta se saattaisi käynnistää jonkun uuden ihmisen mielenkiinnon näihin dna-asioihin ja kuvaustekniikoihin. Pyydän nyt lupaa siirtää.

Yritin löytää ISOGG Wikistä selitystä pallukalle modal. Suoraa vastausta siihen ei löytynyt. Onko nyt näin, että modal on tässä tapauksessa haploryhmän N-Z5038 näytteiden tulosten "keskiarvo" tai keskus ja sitten nuo testitapaukset ovat sijoittuneet geneettisen etäisyyden verran tuosta modalista?

Kaaviosta ehkä näkee, minkä testitulosten kanssa saattaisi syntyä uutta oksaa haplopuuhun kun katsoo näytteen lähistöllä olevia testituloksia kaaviossa?

Muuta ihmeteltävää ei nyt heti tule mieleen.


18 Touko 2017 04:35
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Noista Fluxus-diagrammeista kysymys: Mitä ovat ne punaiset / mustat pisteet, jotka ovat viivojen solmukohtia, mutta joihin ei liity näytettä / testitulosta?


18 Touko 2017 05:25
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Tässä on yksi ohjelma, jolla noita diagrammeja voi tehdä. Ohjelma on ilmainen. Mutta lähdekoodeja ei ole jaossa.

Free Phylogenetic Network Software
Käyttäjäopas Network 5.0.0.0.0 ohjelmaan

Huomaan, että koko homma pelaa vain Windowsissa. Linux-käyttäjät voinevat kokeilla winen avulla tuota ohjelmaa. Minulla ei ole testiaineistoa, joten en asenna sitä koneelleni.


18 Touko 2017 07:26
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Voit laittaa nämä Karjala-projektiin. Punaiset pisteet ovat median vectoreita. Nämä kuvat ovat tehty nimenomaan tuolla Network 5 ohjelmalla. Kuvien takana ei ole tiedettä eikä ohjelmaa käyttänyt asiaa ymmärtävä henkilö :)

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


18 Touko 2017 09:40
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
Voit laittaa nämä Karjala-projektiin. Punaiset pisteet ovat median vectoreita. Nämä kuvat ovat tehty nimenomaan tuolla Network 5 ohjelmalla. Kuvien takana ei ole tiedettä eikä ohjelmaa käyttänyt asiaa ymmärtävä henkilö :)


Nyt tekee mieli kysyä, että onko ne testiaineistot FTDNA:n projektista? Eli minäkin saisin ne tiedot ohjelman kokeiluun? Jos näin on, teen N-Y5003 haploryhmästä samanlaisen. Googlen kanssa netistä löytää Fluxukseen liittyviä tekstejä, joista voi oppia lisää asioista. Sitä en kyllä tiedä, mitä hyötyä noista tiedoista on. Ehkä osaisi kannustaa sopivia sukulaisia testeihin, jotta haplopuu saisi uusia oksia? Tai voisi ymmärtää jotain ihmisten liikkumisista kautta aikojen. No, kaaviot ovat ainakin mielenkiintoisen näköisiä. :)


18 Touko 2017 16:44
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Kaikki data on poimittu Finland, Karjala, North Eurasia projekteista. Tee ihmeessä omia kaavioita. Ensin copy-paste projektista tuonne http://www.mymcgee.com/tools/yutility111.html , rasti Fluxus kohtaan ja outputti copy-paste xxx.ych nimiseen tiedostoon, jonka avaat Network ohjelmalla. Calculate, Draw. Esikäsittele data siten, että siinä on VAIN 67 markkeria kaikilla, tai 111 markkeria kaikilla ... ei sekamääriä. North Eurasiasta copy-pastetussa datassa on yksi kenttä enemmän joka pitää editoida pois.

Tein vielä yhden kuvan. Poimin kaikki Z5038+ ja alaryhmätkin, joilla on tehtynä y111. Piirsin kuvan Networkilla ja lisäsin muutaman haploryhmän mukaan kuvioon. Onhan tuo aika paljon samannäköinen kuin virallinen snippiperusteinen yfull-puu.

http://imgur.com/a/lZBSJ

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


18 Touko 2017 19:03
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
Kaikki data on poimittu Finland, Karjala, North Eurasia projekteista. Tee ihmeessä omia kaavioita.


Suuret kiitokset tiedoista. Olen nyt auttamassa lisää BigY ja YFull tuloksia N-Z5038 ryhmään. Yhden testituloksen verran. N-Y5003 ryhmään on tullut myös uusia sen jälkeen kun olen sitä seurannut. Mutta mätsiyhteyksiä tutkituilla tuloksilla on mielestäni vähemmän tai ne ovat hajanaisempia.


18 Touko 2017 20:26
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Kauanko YFull-analyysissä kestää? Olettaen että bam-file on jo valmiina ja laitan YFullia tilatessani sen latauslinkin, enkä ala itse tätä varten imuroimaan ja uploadaamaan 2 gigatavun tiedostoa. Tuleeko tulokset kertarykäyksellä vai tipoittain?

Kysyn tätä, koska ehkä kuukauden sisällä lähtee pari BigY-bammia YFulliin. Yksi N-Z5038 ja yksi N-savo.

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


16 Kesä 2017 20:36
Profiili
Lipevä lappilainen
Lipevä lappilainen

Liittynyt: 17 Tammi 2014 18:19
Viestit: 469
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
Kauanko YFull-analyysissä kestää? Olettaen että bam-file on jo valmiina ja laitan YFullia tilatessani sen latauslinkin, enkä ala itse tätä varten imuroimaan ja uploadaamaan 2 gigatavun tiedostoa. Tuleeko tulokset kertarykäyksellä vai tipoittain?

Kysyn tätä, koska ehkä kuukauden sisällä lähtee pari BigY-bammia YFulliin. Yksi N-Z5038 ja yksi N-savo.

Aiemmin YFullin SNP-tulokset tulivat noin kuukauden sisällä, ensimmäisenä tulos kuitenkin näkyy haplopuussa merkinnällä New - jo ennen kuin siitä tulee mitään ilmoitusta, ehkä jo parin viikon kuluttua. Eli sitä kannattaa tarkkailla. Seuraavaksi tulevat SNP-tulokset ja ilmoitus siitä, että tulokset ovat valmiit ja on aika maksaa. STR-tulokset tulevat viimeisenä ja ne viipyvät aika kauan, en tiedä nykyistä tahtia, mutta ainakin kuukausi lisää.


18 Kesä 2017 11:41
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Ok tässä saakin sitten odottaa SNP-tuloksia jonnekin syyskuun alkuun ja STR-tuloksia ehkä marraskuun alkuun. Pitkä odotus tulossa. Virallinen tieto vuodelta 2016 olisi, että snipit kuukaudessa ja str:ät kolmessa.


Q: How soon will I receive my YFull interpretation?

A: Your basic SNP interpretation will be ready within about one month after your raw data upload to YFull. YFull will send you an email informing you that your SNP data is ready and requesting payment of the one time interpretation fee. After payment of the fee, the SNP information will be unlocked and available by logging in to your account. [Your YFull id number followed by the word "new" will usually appear in the YTree before your basic SNP interpretation is ready.]

Some YFull interpretation information (such as SNP age estimation and STR details) will not be available until about two months after the SNP information is unlocked.

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


18 Kesä 2017 22:49
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
Kauanko YFull-analyysissä kestää?.


Minulla YFull-analyysi kesäkuu 2016 kesti parisen kuukautta ja tuli SNP-mätsit ja SNP arvot. Sitten siitä noin puoli vuotta niin tuli STR-arvot ja STR-mätsit.


19 Kesä 2017 00:28
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Ok. Faguksen, Ilpon ja FAQ:n mediaani ... keskiarvot olisivat :)

- snp-tulokset 1 ... 1,33 kk
- str-tulokset 3 ... 4 kk

YFull-puussa on uusi id:YF09952 https://yfull.com/tree/N-Z5038/ Onko havaintoa kuka hän on (hänen varhaisin tunnettu esi-isänsä siis)?

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


19 Kesä 2017 00:57
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
YFull-puussa on uusi id:YF09952 https://yfull.com/tree/N-Z5038/ Onko havaintoa kuka hän on (hänen varhaisin tunnettu esi-isänsä siis)?


Ei ole vielä mätsännyt siihen toiseen samassa haploryhmässä (ei siis alemmissa haploissa) SNP- eikä STR-mätsinä. Puhutaanko alemmista haploista downstreamina? Nyt kun hiiren vie sen tunnuksen ylle, sivusto sanoo, että analysointi on kesken. Taitaa olla varsin tuore id:n saaja. Netistä voi haravoida kaikki YFullista kyselleet viime aikoina. :)


19 Kesä 2017 17:24
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
BigY snippejä ja novel variantteja alkoi näkymään tänään minulla. Matcheja ei vielä ole. Kesti siis 3 viikkoa ja 1 pv siitä, kun tilaus meni batched-tilaan.

BAM-tilaus on tehty. Matchejakin alkoi näkymään 1pv valmistumisen jälkeen.
[editoitu]

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


Viimeksi muokannut Giösta päivämäärä 28 Kesä 2017 11:38, muokattu yhteensä 1 kerran



27 Kesä 2017 23:09
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Minun lähimmät BigY-matchit ovat

SharedNV KnownSNPdiff Non-matchingSNP MatchingSNP Name
24 0 - 26297 Juho Liira d. 1739 Rautu Finland
22 0 - 24811 Heikki Ristonpoika (Suo) 1767-1830
22 0 - 26464 Paavo Wäisänen b.1520- d.1589,Pyhäjärvi,Finland
22 0 - 26857 Vincentius, b~1490, d~1550 in Johannes, Kaijala

Voiko noista luvuista arvioida yhteisen esi-isän ikää jotenkin?

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


28 Kesä 2017 10:56
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 13 Huhti 2016 14:40
Viestit: 169
Paikkakunta: Helsinki, Finland
Viesti Re: N-Z5038
Giösta kirjoitti:
22 0 - 24811 Heikki Ristonpoika (Suo) 1767-1830


Yhteinen esi-isä kiinnostaa minuakin kun tuo saattaa olla yksi esi-isistäni tai sitten ehkä läheinen sukulainen. Nimi on ainakin esi-isissäni äidin puolelta.


28 Kesä 2017 12:00
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
Avatar

Liittynyt: 10 Touko 2013 04:50
Viestit: 220
Viesti Re: N-Z5038
Jotakin tapahtuu. N North Eurasiassa järjestys muuttui. Jouduin tai pääsin Liiran kanssa samaan osastoon.

N1c1 - 078 Karelian Branch Z1940+ Z5038+ Y21077+ Y22105+
379661 Abraham Effa, b ~1640, d. >1692, Sakkola, Kosela

N1c1 - 078 Karelian Branch Z1940+ Z5038+ Y21077+ Y22105+ Y31250+ (YFull)
480358 Koivunen

N1c1 - 078 Karelian Branch Z1940+ Z5038+ Y21077+ Y22105+ Y31250+ Y32734+
403365 Christer Henriksson Kiesi,1713-1772,Suomenniemi,FI
501377 Adam Jacobsson Loica,1733-1790,Johannes,ex-Finland
527606 Vincentius, b~1490, d~1550 in Johannes, Kaijala

N1c1 - 078 Karelian Branch Z1940+ Z5038+ Y34063+
459876 Heikki Ristonpoika (Suo) 1767-1830
478971 Paavo Wäisänen b.1520- d.1589,Pyhäjärvi,Finland

N1c1 - 078 Karelian Branch Z1940+ Z5038+ Y34063+ A14951301G
322686 Samuel Hindersson 1691-1776 Vehkalahti,Finland
435309 Juho Liira d. 1739 Rautu Finland

_________________

N-BY22080 (Z5038 -> Z34063 -> BY22080)


29 Kesä 2017 00:51
Profiili
Näytä viestit ajalta:  Järjestä  
Vastaa viestiin   [ 84 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1, 2, 3, 4, 5  Seuraava

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Ei rekisteröityneitä käyttäjiä ja 1 vierailijaa


Et voi kirjoittaa uusia viestejä
Et voi vastata viestiketjuihin
Et voi muokata omia viestejäsi
Et voi poistaa omia viestejäsi

Etsi tätä:
Hyppää:  
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group.
Designed by STSoftware.
Käännös, Lurttinen, www.phpbbsuomi.com uncommitted-decoy