Tutkijat ovat julkaisseet uuden tietokoneohjelman, jolla voi selvittää DNA:n muinaisnäytteistä, jakavatko ne sukulaisuudesta kertovia IBD-jaksoja. Samalla tutkijat ovat myös testanneet ohjelmaa ja löytäneet sillä sukulaisuussuhteita yli kymmenen tuhannen euraasialaisen muinaisnäytteen joukosta.
Ringbauer, H., Huang, Y., Akbari, A., Mallick, S., Patterson, N., & Reich, D.E. (2023)
ancIBD-Screening for identity by descent segments in human ancient DNA
https://www.biorxiv.org/content/10.1101 ... 1.abstract
"Long DNA sequences shared between two individuals, known as Identical by descent (IBD) segments, are a powerful signal for identifying close and distant biological relatives because they only arise when the pair shares a recent common ancestor."
"[L]everaging the fact that biological relatives up to the sixth degree are expected to share multiple long IBD segments, we identify relatives between 10,156 ancient Eurasian individuals and document evidence of long-distance migration [...]"
Artikkelin liitteenä olevasta taulukosta (table 1) näkee nämä muinais-DNA-näytteiden jakamat IBD-jaksot. Sieltä selviää esimerkiksi, että näyte KRA001 on jollain tavalla sukua näytteille YAK023 ja RISE493.
KRA001 Krasnoyarsk Nefteprovod-2 2340-2064 calBCE (Kılınç, 2021)
YAK023 Yakutia Kolyma Kamenka-2 1882-1689 calBCE (Kılınç, 2021)
RISE493 Altai Karasuk Sabinka-2 1518-1427 calBCE (Allentoft, 2015)
Näytteiden jakamat IBD-jaksot ovat kuitenkin melko vähälukuisia ja lyhyitä: KRA001 ja RISE493 jakavat viisi yli 8 cM (senttimorganin) pituista jaksoa ja yhden yli 12 cM pituisen jakson, kun taas KRA001 ja YAK023 jakavat vain neljä yli 8 cM pituista jaksoa. Tätä voi verrata esimerkiksi siihen, että YAK023 jakaa viisi yli 8 cM pituista jaksoa ja yhden yli 12 cM jakson huomattavasti vanhemman YAK025:n kanssa, vaikka näiden kahden näytteen ikäero on yli 12000 vuotta. Kaikissa tapauksissa lienee siis kyse vain varsin kaukaisista sukulaisuussuhteista?
Näyte YAK025 jakaa vastaavalla tavalla IBD-jaksoja esimerkiksi kiinalaisen Qihe3:n, Venäjän Kaukoidän NEO238:n ja vietnamilaisen Vt719:n kanssa.
YAK025 Yakutia Lena Khaiyrgas-1 14990-14602 calBCE (Kılınç, 2021)
Qihe3 China Fujian Zhangping 9798-9407 calBCE (Wang, 2021)
NEO238 Russia Devil's Gate Cave 5712-5484 calBCE (Sikora, 2019)
Vt719 Vietnam Quang Ninh 1641-1950 calCE (McColl, 2018)