Näytä vastaamattomat viestit | Näytä aktiiviset viestiketjut Tänään on 07 Maalis 2021 08:14



Vastaa viestiin  [ 37 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1, 2
 Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019) 
Kirjoittaja Viesti
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 30 Joulu 2011 12:21
Viestit: 144
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world
Kristiina kirjoitti:
Millaisia muuten Shestovitsan näytteet ovat genominlaajuisesti?

VK539 Ukraine_Shestovitsa-8870-97 Ukraine Shestovitsa Shestovitsa 10-12th centuries CE 1.574 Male I1 V
VK540 Ukraine_Shestovitsa-8871-96 Ukraine Shestovitsa Shestovitsa 10-12th centuries CE 0.882 Female N/A V

Niitä koskevat arkeologiset luonnehdinnat ovat kovin sekalaisia ja siellä mainitaan lapponoidiset piirteet myös.

Jotain suomalaisten ja ruotsalaisten väliltä, ehkä aivan Suomen länsirannikolta. Aika paljon germaania (NLD) ja hyvin vähän siperiaa.

Target: VK2020_UKR_Shestovitsa_VA:VK540
Distance: 3.4256% / 0.03425643
60.4 NLD_BAI4070
27.8 Baltic_EST_BAX08_1
10.4 Iberia_Central_BA:I6618
1.4 RUS_Shamanka_N_DA247

Target: VK2020_UKR_Shestovitsa_VA:VK539
Distance: 4.0498% / 0.04049763
55.2 NLD_BAI4070
33.0 Baltic_EST_BAX08_1
9.4 Iberia_Central_BA:I6618
2.4 RUS_Shamanka_N_DA247

Keskiverto suomalainen ja ruotsalainen:

Target: Finnish
Distance: 2.5331% / 0.02533086
47.2 Baltic_EST_BAX08_1
44.6 NLD_BAI4070
5.6 RUS_Shamanka_N_DA247
2.6 Iberia_Central_BA:I6618

Target: Swedish
Distance: 2.3655% / 0.02365457
65.2 NLD_BAI4070
20.4 Baltic_EST_BAX08_1
14.2 Iberia_Central_BA:I6618
0.2 RUS_Shamanka_N_DA247


30 Syys 2020 13:47
Profiili WWW
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 30 Joulu 2011 12:21
Viestit: 144
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world
Kristiina kirjoitti:
Joukossa näyttäisi olevan yksi saamelaisnainen, mikä ilmenee myös hänen äitilinjastaan:

VK518 Norway_Nordland 4689 Norway Nor_North Nordland 9th century CE 0.438 Female N/A U5b1b1a

Autosomaalisesti hän sijoittuu lähelle Saami IA -näytteitä.

VK518 U5b1b1a N/A

Distance to: VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518
0.04082941 FIN_Levanluhta_IA:DA238
0.04522914 Saami:GS000035025
0.05119202 Khanty:776_R02C02
0.05230090 Khanty:799_R01C02
0.05492679 RUS_Krasnoyarsk_MLBA_o:I6717
0.05570016 FIN_Levanluhta_IA:JK1970
0.06560372 Udmurt:udmurd8
0.06630696 Selkup:Selkup105
0.06645753 Udmurt:udmurd15
0.07041296 Udmurt:udmurd1

VK519 HV0a1 I1

Distance to: VK2020_NOR_North_VA_o2:VK519
0.02720773 Komi:653_R01C02
0.03466480 Komi:652_R01C01
0.03607676 Komi:652_R01C02
0.03675460 Komi:636_R02C02
0.03685559 Komi:653_R02C02
0.03750018 Udmurt:Udmurt1
0.03804501 Komi:652_R02C02
0.04049868 Komi:653_R01C01
0.04944861 Tatar_Kazan:TTR-097
0.05067656 Komi:654_R01C01


30 Syys 2020 19:48
Profiili WWW
Kielevä karjalainen
Kielevä karjalainen

Liittynyt: 29 Elo 2015 19:08
Viestit: 799
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Mistä löytää tietoja näytteistä VK482, VK369 ja VK475? Haluaisin tietää mistä paikasta näytteet ovat peräisin ym.


04 Loka 2020 19:41
Profiili
Hiljainen hämäläinen
Hiljainen hämäläinen

Liittynyt: 17 Elo 2012 14:44
Viestit: 26
Paikkakunta: Heinola
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
https://haplogroup.info/all-ancient-dna.pdf


04 Loka 2020 20:20
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 30 Joulu 2011 12:21
Viestit: 144
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Anskuq kirjoitti:
Mistä löytää tietoja näytteistä VK482, VK369 ja VK475? Haluaisin tietää mistä paikasta näytteet ovat peräisin ym.

Taulukko, jossa taitaa olla kaikki viikingit. Ei oo mun tuotos..
https://drive.google.com/file/d/1Gt-tqarRhNAiLY9CHg_nn8TJXS8PKnVp/view?usp=sharing

Distance to: VK2020_EST_Saaremaa_EVA:VK482
0.02513457 Swedish:Sweden11
0.02643663 SWE_Viking_Age_Sigtuna:vik_84001
0.02654903 Bell_Beaker_Bavaria:I5023
0.02830635 Swedish:Sweden12
0.02948981 SWE_LN:RISE98

Distance to: VK2020_DNK_Sealand_VA:VK369
0.02096888 Belgian:Belgium23
0.02271482 French_Nord:N_19
0.02278293 French_Nord:N_48
0.02390249 French_Paris:5_2
0.02470614 French_Occitanie:T_112

Distance to: VK2020_SWE_Gotland_VA:VK475
0.02277754 Lithuanian_SZ:LTG-645
0.02378792 Latvian:latvian58C6
0.02415333 Lithuanian_PZ:LTG-885
0.02417285 Lithuanian_VA:LTG-597
0.02453300 Lithuanian_SZ:LTG-1127


04 Loka 2020 22:03
Profiili WWW
Kielevä karjalainen
Kielevä karjalainen

Liittynyt: 29 Elo 2015 19:08
Viestit: 799
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
perttimp kirjoitti:
Anskuq kirjoitti:
Mistä löytää tietoja näytteistä VK482, VK369 ja VK475? Haluaisin tietää mistä paikasta näytteet ovat peräisin ym.

Taulukko, jossa taitaa olla kaikki viikingit. Ei oo mun tuotos..
https://drive.google.com/file/d/1Gt-tqarRhNAiLY9CHg_nn8TJXS8PKnVp/view?usp=sharing

Distance to: VK2020_EST_Saaremaa_EVA:VK482
0.02513457 Swedish:Sweden11
0.02643663 SWE_Viking_Age_Sigtuna:vik_84001
0.02654903 Bell_Beaker_Bavaria:I5023
0.02830635 Swedish:Sweden12
0.02948981 SWE_LN:RISE98

Distance to: VK2020_DNK_Sealand_VA:VK369
0.02096888 Belgian:Belgium23
0.02271482 French_Nord:N_19
0.02278293 French_Nord:N_48
0.02390249 French_Paris:5_2
0.02470614 French_Occitanie:T_112

Distance to: VK2020_SWE_Gotland_VA:VK475
0.02277754 Lithuanian_SZ:LTG-645
0.02378792 Latvian:latvian58C6
0.02415333 Lithuanian_PZ:LTG-885
0.02417285 Lithuanian_VA:LTG-597
0.02453300 Lithuanian_SZ:LTG-1127

Kiitos paljon näistä. On mielenkiintoista nähdä mitä väestöä he olivat. Minun äitilinja on englannista ja myös Ranskasta lähtöisin. Tämä minun äitilinja, kuten muutkin äitilinjat, on sellainen ettei niitä mutaatioita juuri synny ja tästä on nyt Y-fullista pystytty eriyttämään uusi haara H1a:n.


05 Loka 2020 22:06
Profiili
Kielevä karjalainen
Kielevä karjalainen

Liittynyt: 29 Elo 2015 19:08
Viestit: 799
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Anskuq kirjoitti:
perttimp kirjoitti:
Anskuq kirjoitti:
Mistä löytää tietoja näytteistä VK482, VK369 ja VK475? Haluaisin tietää mistä paikasta näytteet ovat peräisin ym.

Taulukko, jossa taitaa olla kaikki viikingit. Ei oo mun tuotos..
https://drive.google.com/file/d/1Gt-tqarRhNAiLY9CHg_nn8TJXS8PKnVp/view?usp=sharing

Distance to: VK2020_EST_Saaremaa_EVA:VK482
0.02513457 Swedish:Sweden11
0.02643663 SWE_Viking_Age_Sigtuna:vik_84001
0.02654903 Bell_Beaker_Bavaria:I5023
0.02830635 Swedish:Sweden12
0.02948981 SWE_LN:RISE98

Distance to: VK2020_DNK_Sealand_VA:VK369
0.02096888 Belgian:Belgium23
0.02271482 French_Nord:N_19
0.02278293 French_Nord:N_48
0.02390249 French_Paris:5_2
0.02470614 French_Occitanie:T_112

Distance to: VK2020_SWE_Gotland_VA:VK475
0.02277754 Lithuanian_SZ:LTG-645
0.02378792 Latvian:latvian58C6
0.02415333 Lithuanian_PZ:LTG-885
0.02417285 Lithuanian_VA:LTG-597
0.02453300 Lithuanian_SZ:LTG-1127

Kiitos paljon näistä. On mielenkiintoista nähdä mitä väestöä he olivat. Minun äitilinja on englannista ja myös Ranskasta lähtöisin. Tämä minun äitilinja, kuten muutkin äitilinjat, on sellainen ettei niitä mutaatioita juuri synny ja tästä on nyt Y-fullista pystytty eriyttämään uusi haara H1a:n.

Toisaalta ihmettelen kovasti serkkuni osumia mytrueancestryn kautta. Hän on länsisuomesta, pelkkää viikinkiä ja muuta länsieurooppalaista ainakin mytrueancestry siis Saksan, Ranskan, Italian osumia ja Ruotsin, Norjan Tanskan-viikinkejä vaikka kuin paljon. On oma serkku suomalaisen äitini puolelta. Olivatko länsisuomalaiset tosiaan Viron ja Ruotsin jälkeläisiä näin paljon ja näin läheistä sukua? Olemme kuitenkin varmoja ensimmäisiä serkkuja, jopa FF serkku tutkimuksen kautta. Ällistyin tuloksesta...


08 Loka 2020 00:26
Profiili
Paikalla
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 9620
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Anskuq kirjoitti:
Toisaalta ihmettelen kovasti serkkuni osumia mytrueancestryn kautta. Hän on länsisuomesta, pelkkää viikinkiä ja muuta länsieurooppalaista ainakin mytrueancestry siis Saksan, Ranskan, Italian osumia ja Ruotsin, Norjan Tanskan-viikinkejä vaikka kuin paljon. On oma serkku suomalaisen äitini puolelta. Olivatko länsisuomalaiset tosiaan Viron ja Ruotsin jälkeläisiä näin paljon ja näin läheistä sukua? Olemme kuitenkin varmoja ensimmäisiä serkkuja, jopa FF serkku tutkimuksen kautta. Ällistyin tuloksesta...

Tässä pitää muistaa, että voidaan verrata vain näytteisiin, joita on olemassa. Suomalaisia muinaisnäytteitä ei vielä ole, joten lähimmät osumat ovat väkisinkin ihan muilta alueilta.

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


08 Loka 2020 13:57
Profiili WWW
Lipevä lappilainen
Lipevä lappilainen

Liittynyt: 09 Helmi 2012 22:11
Viestit: 482
Paikkakunta: Kymenlaakso
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Aivan samaa juuri kelasin ja jospa löytyisi muinainen FGC14542:n jälkeläisnäyte vaikkapa Visulahdesta, niin jo alkaisi muuttua kuumottavaksi...


08 Loka 2020 16:05
Profiili
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen

Liittynyt: 14 Marras 2016 13:41
Viestit: 294
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Anskuq kirjoitti:
Toisaalta ihmettelen kovasti serkkuni osumia mytrueancestryn kautta. Hän on länsisuomesta, pelkkää viikinkiä ja muuta länsieurooppalaista ainakin mytrueancestry siis Saksan, Ranskan, Italian osumia ja Ruotsin, Norjan Tanskan-viikinkejä vaikka kuin paljon. On oma serkku suomalaisen äitini puolelta. Olivatko länsisuomalaiset tosiaan Viron ja Ruotsin jälkeläisiä näin paljon ja näin läheistä sukua? Olemme kuitenkin varmoja ensimmäisiä serkkuja, jopa FF serkku tutkimuksen kautta. Ällistyin tuloksesta...

En ihmettelisi. Pelkästään ulkonäköä vertailemalla länsisuomalaisten yhdennäköisyys vaikka ruotsalaisiin ja virolaisiin on silmiinpistävä. Tämä on tietenkin yleistys, koska yksilöissä on aina erikoisuuksia. Kansat, jotka jakavat enimmäkseen samat geenit, jakavat myös enimmäkseen saman ulkonäön.

_________________
Juuret: Keski-Suomi ja Laatokan Karjala
Y-DNA N1c1
mtDNA U5a


08 Loka 2020 16:22
Profiili
Paikalla
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 9620
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Jegor kirjoitti:
Anskuq kirjoitti:
Toisaalta ihmettelen kovasti serkkuni osumia mytrueancestryn kautta. Hän on länsisuomesta, pelkkää viikinkiä ja muuta länsieurooppalaista ainakin mytrueancestry siis Saksan, Ranskan, Italian osumia ja Ruotsin, Norjan Tanskan-viikinkejä vaikka kuin paljon. On oma serkku suomalaisen äitini puolelta. Olivatko länsisuomalaiset tosiaan Viron ja Ruotsin jälkeläisiä näin paljon ja näin läheistä sukua? Olemme kuitenkin varmoja ensimmäisiä serkkuja, jopa FF serkku tutkimuksen kautta. Ällistyin tuloksesta...

En ihmettelisi. Pelkästään ulkonäköä vertailemalla länsisuomalaisten yhdennäköisyys vaikka ruotsalaisiin ja virolaisiin on silmiinpistävä. Tämä on tietenkin yleistys, koska yksilöissä on aina erikoisuuksia. Kansat, jotka jakavat enimmäkseen samat geenit, jakavat myös enimmäkseen saman ulkonäön.

Jo 2008 genominlaajuisissa tutkimuksissa havaittiin, että FST-arvoilla lounaissuomalaisten etäisyys ruotsalaisiin, venäläisiin ja virolaisiin on pienin (siinä 30 eli 0,0003), ja itäsuomalaisiin suunnilleen saman verran. Itäsuomalaiset taas ovat kaukana kaikista mainituista.

Joka tapauksessa tuollaiset FST-arvot osoittavat, että kyse on eri väestöistä; vain jos FST jäisi alle 20, voitaisiin puhua samasta väestöstä. Näin mitaten pohjoispohjalaiset ovat geneettisesti itäsuomalaista väestöä.

_________________
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)


08 Loka 2020 17:16
Profiili WWW
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen

Liittynyt: 14 Marras 2016 13:41
Viestit: 294
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Jaska kirjoitti:
...pohjoispohjalaiset ovat geneettisesti itäsuomalaista väestöä.

Siltä he yleensä näyttävät ja kuulostavatkin PDT_Armataz_01_18

_________________
Juuret: Keski-Suomi ja Laatokan Karjala
Y-DNA N1c1
mtDNA U5a


08 Loka 2020 20:18
Profiili
Kielevä karjalainen
Kielevä karjalainen

Liittynyt: 29 Elo 2015 19:08
Viestit: 799
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Anskuq kirjoitti:
perttimp kirjoitti:
Anskuq kirjoitti:
Mistä löytää tietoja näytteistä VK482, VK369 ja VK475? Haluaisin tietää mistä paikasta näytteet ovat peräisin ym.

Taulukko, jossa taitaa olla kaikki viikingit. Ei oo mun tuotos..
https://drive.google.com/file/d/1Gt-tqarRhNAiLY9CHg_nn8TJXS8PKnVp/view?usp=sharing

Distance to: VK2020_EST_Saaremaa_EVA:VK482
0.02513457 Swedish:Sweden11
0.02643663 SWE_Viking_Age_Sigtuna:vik_84001
0.02654903 Bell_Beaker_Bavaria:I5023
0.02830635 Swedish:Sweden12
0.02948981 SWE_LN:RISE98

Distance to: VK2020_DNK_Sealand_VA:VK369
0.02096888 Belgian:Belgium23
0.02271482 French_Nord:N_19
0.02278293 French_Nord:N_48
0.02390249 French_Paris:5_2
0.02470614 French_Occitanie:T_112

Distance to: VK2020_SWE_Gotland_VA:VK475
0.02277754 Lithuanian_SZ:LTG-645
0.02378792 Latvian:latvian58C6
0.02415333 Lithuanian_PZ:LTG-885
0.02417285 Lithuanian_VA:LTG-597
0.02453300 Lithuanian_SZ:LTG-1127

Kiitos paljon näistä. On mielenkiintoista nähdä mitä väestöä he olivat. Minun äitilinja on englannista ja myös Ranskasta lähtöisin. Tämä minun äitilinja, kuten muutkin äitilinjat, on sellainen ettei niitä mutaatioita juuri synny ja tästä on nyt Y-fullista pystytty eriyttämään uusi haara H1a:n.


Ei ole enää Y-Fullissa erillinen ryhmä tuo, vaan kaikki on taas samassa *H1a:ssa.


18 Loka 2020 17:42
Profiili
Lipevä lappilainen
Lipevä lappilainen

Liittynyt: 09 Helmi 2012 22:11
Viestit: 482
Paikkakunta: Kymenlaakso
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Ohessa Salmen tutkimuksiin liittyen pari mielenkiintoista juttua Saarenmaalta, joiden perusteella mysteeri on kaikkea muuta kuin ratkaistu:

https://saartehaal.postimees.ee/7030136 ... -viikingid
https://novaator.err.ee/1116598/euroopa ... usteeriume


22 Loka 2020 09:59
Profiili
Sutki savolainen
Sutki savolainen

Liittynyt: 07 Tammi 2015 01:30
Viestit: 585
Paikkakunta: Helsinki
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
wejoja kirjoitti:
Ohessa Salmen tutkimuksiin liittyen pari mielenkiintoista juttua Saarenmaalta, joiden perusteella mysteeri on kaikkea muuta kuin ratkaistu:

https://saartehaal.postimees.ee/7030136 ... -viikingid
https://novaator.err.ee/1116598/euroopa ... usteeriume

Kiitos, tuota Saarte Häälessä elokuun 1. ilmestynyttä artikkelia en ollut nähnytkään. Siinä Marika Mägi on ensinnäkin täysin varma siitä, että paikalliset saarelaiset ovat haudanneet laivojen vainajat, vaikka suurin osa vainajista olivatkin muualta tulleita. Hän ei kuitenkaan ole toistaiseksi julkaisuuteen annetun ja näkemänsä tutkimusaineiston perusteella lainkaan varma siitä, että kyse olisi yhdestä samanaikaisesta hautauksesta, vaan hänen mielestään tekemistä olisi joistain kymmenistä vuosista aina sataan vuoteen asti käytössä olleesta hautapaikasta. Hänen tulkintansa on, että kyse voisi olla muualta tulleista mutta jonkinlaisten paikallisten saarelaisten päälliköiden palveluksessa olleista henkilöistä.


24 Loka 2020 23:20
Profiili
Lipevä lappilainen
Lipevä lappilainen

Liittynyt: 09 Helmi 2012 22:11
Viestit: 482
Paikkakunta: Kymenlaakso
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
MM onkin yksi harvoista, joka on uskaltanut kritisoida Salmen menetelmiä ja tulkintoja ja sitäkin, että dataa on piiloteltu vuosikaudet muilta tutkijoilta sen mukaan, mistä on saatu hilloa tutkimuksiin. No, se kai lienee aivan yleinen käytäntö kaikkialla...!

Mitä itse hautaamiseen tai siitä tehtyihin tulkintoihin tulee, niin siihen on voitu käyttää esim. taistelussa vaurioituneet kaksi alusta, minkä jälkeen eloon jääneet seilasivat muilla laivoilla takaisin länteen tai pohjoiseen. On nimittäin Leväluhdan tavoin pelkkää spekulointia, että Salmessa olisi mukamas tapahtunut totaalinen tappio. Tapetut saattoivat todellisuudessa edustaa viides- tai kymmenesosaa isommasta sotajoukosta! Mikäli muut olisivat lähteneet karkuun muilla laivoilla, on hautaus hyvinkin voitu tehdä saarelaisten toimesta. Tai on tultu myöhemmin takaisin hautaamaan uhrit.


25 Loka 2020 15:16
Profiili
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen

Liittynyt: 09 Maalis 2019 15:01
Viestit: 162
Vastaa lainaamalla
Viesti Re: Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
Tässä on PCA G25:ssä olevista paperin näytteistä:

Kuva

Koodi:
library("tidyverse")
library("colorspace")

download.file("https://drive.google.com/uc?export=download&id=","ancientind")

t=read.csv("ancientind",header=T,row.names=1)
t2=t[startsWith(row.names(t),"VK2020"),]

k<-cutree(hclust(dist(t2)),k=6)
p=prcomp(t2)
p2=as.data.frame(p$x)
p2$cluster=as.vector(k)

pct=paste0(colnames(p$x)," (",sprintf("%.1f",p$sdev/sum(p$sdev)*100),"%)")

ggplot(p2,aes(x=PC1,y=PC2))+
geom_point(aes(color=as.factor(cluster)),size=.5)+
geom_polygon(data=p2%>%group_by(cluster)%>%slice(chull(PC1,PC2)),alpha=.2,aes(color=as.factor(cluster),fill=as.factor(cluster)),size=.3)+
geom_text(label=rownames(p2),aes(color=as.factor(cluster)),size=2,vjust=-.7)+
theme(
  aspect.ratio=3/4,
  legend.position="none",
  axis.ticks.x=element_blank(),
  axis.ticks.y=element_blank(),
  axis.ticks.length=unit(0,"pt"),
  plot.background=element_rect(fill="gray50"),
  panel.grid.major=element_line(color="gray50",size=.2),
  panel.background=element_rect(fill="gray20"),
  panel.grid.minor=element_blank(),
  axis.text=element_text(color="black")
)+
scale_x_continuous(breaks=seq(-1,1,.05),expand=expansion(mult=.16))+
scale_y_continuous(breaks=seq(-1,1,.05),expand=expansion(mult=.04))+
xlab(pct[1])+ylab(pct[2])+
scale_color_discrete_qualitative(palette="Set 3")+
ggsave("/tmp/a.png")
system("/usr/local/bin/mogrify -trim -shave 5x5 /tmp/a.png")


VK2020_NOR_North_LN_HG:VK531 ei ole nimestäkään päätellen mikään viikinkiaikainen. Sille lähimpiin muinaisväestöjen keskiarvoihin kuuluvat EHG:t ja SHG:t:

Distance to: VK2020_NOR_North_LN_HG:VK531
.033 Baltic_LVA_MN
.035 NOR_Meso
.036 UKR_Meso
.041 NOR_N_HG
.058 UKR_N
.061 RUS_Veretye_Meso
.071 RUS_Sidelkino_HG
.084 RUS_Volga-Kama_N
.090 RUS_Karelia_HG
.092 RUS_Samara_HG
.097 SWE_Meso
.099 SWE_Motala_HG

Tässä on toinen PCA ilman tuota HG:tä ja ilman italialaisia. Aika ihmeellistä, että VK51 on jokaisella ensimmäisestä neljästä PC:stä niin kaukana muista.

KuvaKuva

VK2020_SWE_Gotland_VA_o:VK56 on suomalaisten keskiarvoa lähin muinaisnäyte G25:ssä:

$ mkdir g25;printf %s\\n ai\ 1UrhcfNMLW0oMXIbHGUE60v2taCM7PFw1 aa\ 1F2rKEVtu8nWSm7qFhxPU6UESQNsmA-sl mi\ 1HYrDwxEXv82DvDLoq736pS5ZTGJA4dn5 ma\ 1wZr-UOve0KUKo_Qbgeo27m-CQncZWb8y|while read l m;do curl "drive.google.com/uc?export=download&id=$m" -Lso g25/$l;done
$ dist(){ awk -F, 'NR==FNR{for(i=2;i<=NF;i++)a[i]=$i;next}$1{s=0;for(i=2;i<=NF;i++)s+=($i-a[i])^2;if(s)print s^.5,$1}' "$2" "$1" |sort -n|awk '{printf"%.3f %s\n",$1,$2}'|sed s,^0,,;}
$ dist g25/ai <(grep Finnish g25/ma)|head -n16
.025 VK2020_SWE_Gotland_VA_o:VK56
.039 SWE_Viking_Age_Sigtuna:vik_KAL006
.043 VK2020_RUS_Ladoga_VA:VK21
.046 VK2020_SWE_Skara_VA:VK395
.050 VK2020_RUS_Ladoga_VA:VK18
.050 Baltic_EST_IA:s19_VII4_1
.051 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK51
.055 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK461
.055 Baltic_EST_IA:s19_0LS10_1
.057 Baltic_EST_IA:s19_V10_2
.058 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK457
.058 RUS_Ingria_IA:VIII9_1
.059 VK2020_UKR_Shestovitsa_VA:VK539
.059 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK452
.060 SWE_Viking_Age_Sigtuna:vik_stg020
.060 Baltic_EST_IA:s19_V12_1VK56:

Kahdesta pohjois-Norjan outlierista VK518 on itäisempi:

$ dist <(cat g25/[am]a) <(grep VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518 g25/ai)|head -n16
.053 RUS_Krasnoyarsk_MLBA_o
.059 FIN_Levanluhta_IA
.065 Saami
.076 Udmurt
.082 RUS_Chalmny-Varre
.085 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov
.088 Bashkir
.088 Mari
.089 MNG_Pazyryk_EIA_6
.092 Besermyan
.095 Scythian_Aldy_Bel_IA
.097 MNG_EIA_2
.097 Chuvash
.100 RUS_Karasuk
.103 MNG_Sagly_EIA_4
.103 Scythian_RUS_Urals
$ dist <(cat g25/[am]a) <(grep VK2020_NOR_North_VA_o2:VK519 g25/ai)|head -n16
.035 Komi
.040 Saami_Kola
.056 Tatar_Mishar
.056 Russian_Pinega
.058 RUS_Mezhovskaya
.060 VK2020_SWE_Gotland_VA_o
.062 Tatar_Kazan
.062 Vepsian
.064 RUS_Chalmny-Varre
.064 Karelian
.065 Finnish_East
.071 Besermyan
.071 Mordovian
.074 Russian_Kostroma
.077 Ingrian
.077 Saami

Kun näytteitä mallinnetaan nykyväestöjen kanssa nMontella, VK518 saa aika paljon hanti-komponenttia:

Target: VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518 (Distance: .026)
66.8 Saami
9.0 Khanty
7.6 Mari
6.4 Mansi
4.0 Ket
3.4 Nenets
2.8 Selkup

Target: VK2020_NOR_North_VA_o2:VK519 (Distance: .030)
22.6 Komi
18.6 Saami_Kola
15.2 Udmurt
13.8 Saami
7.8 Cossack_Kuban
7.6 Finnish
7.2 Karelian
7.2 Lithuanian_PA

Muinvaisväestöillä VK518 saa Levänluhtaa, BOO:ta, ja kra001:tä (RUS_Krasnoyarsk_BA):

Target: VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518 (Distance: .024)
39.6 FIN_Levanluhta_IA
20.0 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov
19.1 VK2020_NOR_North_VA_o2
13.2 RUS_Krasnoyarsk_MLBA_o
8.1 RUS_Krasnoyarsk_BA

Target: VK2020_NOR_North_VA_o2:VK519 (Distance: .024)
35.9 VK2020_NOR_North_VA_o1
23.3 Baltic_EST_MA
12.1 CZE_Early_Slav
9.8 RUS_Chalmny-Varre
8.6 RUS_Petrovka_MLBA
7.7 UZB_Kokcha_BA
2.6 VK2020_ISL_Ingiridarstadir_VA

Tässä on tiedot niistä outliereista taulukosta S1 (https://www.nature.com/articles/s41586-020-2688-8):

Sample;56;518;519;531
Sample;VK56;VK518;VK519;VK531
Laboratory_ID;Gotland_Frojel-001A98;Norway_Nordland 4689;Norway_Nordland 4691b;Norway_Troms 5001A
Museum_ID;Gotland_Frojel-001A98;Norway_Nordland 4689;Norway_Nordland 4691b;Norway_Troms 5001A
Country;Sweden;Norway;Norway;Norway
MajorDivision;Gotland;Nor_North;Nor_North;Nor_North
MinorDivision;Frojel;Nordland;Nordland;Troms
Lat;57.34;67.69;67.93;69.47
Lon;18.19;12.7;14.96;18
Age;Viking;Viking;Viking;LNBA
Finer_age;900-1050 CE;9th century CE;6-10th centuries CE;2400 BC
14C Cal. Date (1 sigma);;;;
SampleType;Tooth;Tooth;Tooth;Tooth
Relatedness;outlier;outlier;outlier;outlier_Neolithic
AvgDepth(X);1.064;0.438;0.217;1.399
Sex;Female;Female;Male;Male
Contam_mtDNA;1.2;0.05;0.3;2.36
Damage (%);14.88;5.61;5.34;5.64
DoC_X;1.05;0.44;0.11;0.73
Contam_X (%);;;0.52;1.32
Y_haplogroup;N/A;N/A;I1;R1b1a1
mtDNA_haplogroup;H6a1a;U5b1b1a;HV0a1;U2e2a
DoC_mtDNA;97.5;64.5;46.9;87.1

Tässä on suomalaisten keskiarvoa lähimpänä olevat näytteet:

$ dist <(grep VK2020 g25/ai) <(grep Finnish g25/ma)|head -n16
.025 VK2020_SWE_Gotland_VA_o:VK56
.043 VK2020_RUS_Ladoga_VA:VK21
.046 VK2020_SWE_Skara_VA:VK395
.050 VK2020_RUS_Ladoga_VA:VK18
.051 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK51
.055 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK461
.058 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK457
.059 VK2020_UKR_Shestovitsa_VA:VK539
.059 VK2020_SWE_Gotland_VA:VK452
.060 VK2020_RUS_Ladoga_VA:VK17
.060 VK2020_SWE_Oland_VA:VK354
.061 VK2020_RUS_Gnezdovo_VA:VK224
.062 VK2020_SWE_Oland_VA:VK342
.062 VK2020_SWE_Oland_VA:VK334
.063 VK2020_DNK_Langeland_VA:VK367
.064 VK2020_RUS_Kurevanikha_VA:VK160


01 Maalis 2021 01:28
Profiili
Näytä viestit ajalta:  Järjestä  
Vastaa viestiin   [ 37 viestiä ]  Mene sivulle Edellinen  1, 2

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Ei rekisteröityneitä käyttäjiä ja 1 vierailijaa


Et voi kirjoittaa uusia viestejä
Et voi vastata viestiketjuihin
Et voi muokata omia viestejäsi
Et voi poistaa omia viestejäsi

Etsi tätä:
Hyppää:  
cron
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group.
Designed by STSoftware.
Käännös, Lurttinen, www.phpbbsuomi.com uncommitted-decoy