Muinainen Suomi
http://muinainensuomi.foorumi.eu/

Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)
http://muinainensuomi.foorumi.eu/viewtopic.php?f=21&t=2794
Sivu 1/1

Kirjoittaja:  Rekonpoika [ 17 Heinä 2019 22:32 ]
Viestin otsikko:  Population genomics of the Viking world (Margaryan 2019)

Nyt on satoja muinaisnäytteitä viikinkiajalta ympäri pohjois-Eurooppaa, pääosin juurikin viikingeistä.

Skandinaviaan tuli paljon ulkomaista perimää viikinkiajalla. Suomesta ei ole näytteitä mutta Laatokalta ja Saarenmaalta on, ainakaan finestructuren perusteella Saarenmaan viikingit eivät näytä kovin paikallisilta. Viikingit ovat pääosin skandinaavisia mutta joukossa on selviä mamuja tai paikallisia yksilöitä. Genominlaajuisella tasolla suomalaista (tai itämerensuomalaista) perimää löytyy joistakin Laatokan ja Ruotsin näytteistä. Yksi Norjan näyte taitaa olla saamelainen. Toisin kuin näytteissä syvemmällä Venäjällä (jossa puolalainen finestructure-komponentti menee tappiin) Laatokan viikingeissä ei näy
slaavilaista perimää. Vologdan alueen Mologan rannan näyte on vahvasti puolalainen eikä lainkaan suomalainen (eikä siis karjalainen/vepsäläinenkään/muu sukuväestökään) tai ruotsalainen.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/703405v1

Kirjoittaja:  mahola [ 17 Heinä 2019 23:14 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Salmen potskeista näemmä runsaasti N1-alkuisia y-haploryhmiä, mikäli oikein tulkitsen?

Kirjoittaja:  Rekonpoika [ 18 Heinä 2019 00:15 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

mahola kirjoitti:
Salmen potskeista näemmä runsaasti N1-alkuisia y-haploryhmiä, mikäli oikein tulkitsen?

Osa Gotlannin viikingeistä 11.3-figussa ainakin näyttää itämerensuomalaisilta, osa taas puolalaisilta (tai balteilta?).

Kirjoittaja:  Kinaporin kalifi [ 18 Heinä 2019 11:14 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Hieno tutkimus, valitettavasti näytteiden saatavuutta on ymmärrettävästi määritellyt hautauskäytäntö tyyppiä Laatokan nuoremman ns. maalinnan ilmeinen kristittyjen ruumishautausmaa (näytteitä) vs. läheiset polttohaudat (ei näytteitä).

Kirjoittaja:  Kristiina [ 18 Heinä 2019 12:00 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Millaisia muuten Shestovitsan näytteet ovat genominlaajuisesti?

VK539 Ukraine_Shestovitsa-8870-97 Ukraine Shestovitsa Shestovitsa 10-12th centuries CE 1.574 Male I1 V
VK540 Ukraine_Shestovitsa-8871-96 Ukraine Shestovitsa Shestovitsa 10-12th centuries CE 0.882 Female N/A V

Niitä koskevat arkeologiset luonnehdinnat ovat kovin sekalaisia ja siellä mainitaan lapponoidiset piirteet myös.

Kirjoittaja:  Kristiina [ 18 Heinä 2019 14:10 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Joukossa näyttäisi olevan yksi saamelaisnainen, mikä ilmenee myös hänen äitilinjastaan:

VK518 Norway_Nordland 4689 Norway Nor_North Nordland 9th century CE 0.438 Female N/A U5b1b1a

Autosomaalisesti hän sijoittuu lähelle Saami IA -näytteitä.

Kirjoittaja:  Rekonpoika [ 18 Heinä 2019 14:26 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Testin "nykysuomalaisimmat" näytteet ovat VK395, VK51, VK56,VK568. Nykysuomalaisiin pohjautuvaa komponenttia on 84-100%. Muutkin näytteet joissa on useampi kymmenen prosenttia suomea toki voivat olla täysin itämerensuomalaisia mutta mahdollisesti jostain muualta kuin Suomesta.
VK60 Gotlannista esim. on 66% Suomi 28% Puola 6% Italia mikä voi simppelisti tarkoittaa Viroa tai muuta Suomenlahden eteläpuolista suomalaisheimoa. Laatokka poislukien näytteet Venäjällä ja Ukrainassa ovat 0-33% "Suomi".

Kirjoittaja:  Kristiina [ 18 Heinä 2019 15:09 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Rekonpoika kirjoitti:
Testin "nykysuomalaisimmat" näytteet ovat VK395, VK51, VK56,VK568. Nykysuomalaisiin pohjautuvaa komponenttia on 84-100%. Muutkin näytteet joissa on useampi kymmenen prosenttia suomea toki voivat olla täysin itämerensuomalaisia mutta mahdollisesti jostain muualta kuin Suomesta.
VK60 Gotlannista esim. on 66% Suomi 28% Puola 6% Italia mikä voi simppelisti tarkoittaa Viroa tai muuta Suomenlahden eteläpuolista suomalaisheimoa. Laatokka poislukien näytteet Venäjällä ja Ukrainassa ovat 0-33% "Suomi".


VK395: Skara 275 Sweden Skara Varnhem 10-12th centuries CE 1.437 Male N1a1a1a1a1a2a1a2 X2c1
-> X2c1 on suomalaisille tyypillinen X-äitilinja, jota on toki muuallakin; löytynyt mm. muinaisunkarilaisista ja Puolan Wielbarkista

VK51 : Gotland_Kopparsvik-88/64 Sweden Gotland Kopparsvik 900-1050 CE 0.62 Male N1a1a1a1a1a1a U5b1e1
-> U5b1e1 on tyypillinen slaaveille ja suomalaisille.

VK56: Gotland_Frojel-001A98 Sweden Gotland Frojel 900-1050 CE 1.064 Female N/A H6a1a
H6a1a on tyypillinen Yamnaya- ja nuorakeraamikkolinja. Yleinen suomensukuisilla kansoilla, esiintyy myös suomalaisilla ja virolaisilla, esim. virolaispaperin 0LS09 on H6a1a.

VK568 Onko tunnus oikea? En löydä sitä listasta.

VK60 Gotland_Frojel-00702 Sweden Gotland Frojel 900-1050 CE 0.786 Male R1a1a1b1a2b H13a1a1b
-> H13a1a1d on tyypillinen suomalaislinja, N-isälinjaa kantava 0LS10 on H13a1a1a; H13a1a1b on itsessään harvinainen, eikä sitä ole aiemmin löytynyt muinaisnäytteistä.

Kirjoittaja:  Rekonpoika [ 18 Heinä 2019 15:24 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

VK568 on Sigtunan näytteitä, mahd. KAL006
Kaksi muutakin Sigtunan näytettä saa 50% suomalaista tässä mutta toisin kuin VK568:lla (85/15 Suomi/Puola) niillä on skandiakin.

Kirjoittaja:  Kristiina [ 18 Heinä 2019 15:46 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Rekonpoika kirjoitti:
VK568 on Sigtunan näytteitä, mahd. KAL006
Kaksi muutakin Sigtunan näytettä saa 50% suomalaista tässä mutta toisin kuin VK568:lla (85/15 Suomi/Puola) niillä on skandiakin.


KAL006 on äitilinjansa perusteella varmaankin suomensukuinen:
Medieval Sigtuna Kållandet Sweden 7006/kal006 c. 1000 AD V7a

V7a:ta on kielisukulaisilla Venäjällä, tietenkin myös slaaveilla, ja V7a1 on tyypillinen saamelaislinja.

Kirjoittaja:  Rekonpoika [ 18 Heinä 2019 15:59 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Ei-sigtunalaiset (joita mahtuu kolme tähän väliin) joilla on 40-60% suomea
VK17, VK18, VK367, VK475, VK481, VK495, VK533, VK64
Ja VK443. VK517 pääsee 39% eli melkein.

Kirjoittaja:  Johannes [ 30 Heinä 2019 21:07 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

mahola kirjoitti:
Salmen potskeista näemmä runsaasti N1-alkuisia y-haploryhmiä, mikäli oikein tulkitsen?

Näin näyttää olevan.

Tässä lisää tutkimuksen aineiston Saarenmaan Salmen laivojen N-ryhmäläisistä.

Kahdesta laivasta (Salme I ja Salme II) on yhteensä 34 näytettä, kaikki miehiä. Näistä 7:n (n. viidennes kaikista) on määritetty kuuluvan Y-DNA:n N-haploryhmään. Laivassa I heitä oli 3 ja laivassa II 4. Alla taulukossa nuo seitsemän Salmen N-ryhmäläistä laivojen mukaisessa järjestyksessä.

Kuva
Taulukko. Saarenmaan Salmen laivahautojen N-haploryhmäläiset n. vuodelta 750.

Aiemman artikkelin isotooppitutkimus yhdessä arkeologisen analyysin kanssa tuli jo siihen tulokseen, että Salmen laivojen vainajien todennäköisin kotiseutu oli ollut Mälarenin alue Keski-Ruotsissa

Kirjoittaja:  cromwell [ 31 Heinä 2019 15:09 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Tuo "Finnish-like" tarkoittaa ilmeisesti Kainuuta kuten aina. Yllättävän paljon "vanhaa karjalaa" Ruotsissa jo tuohon aikaan.

Kirjoittaja:  Johannes [ 31 Heinä 2019 19:03 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

cromwell kirjoitti:
Tuo "Finnish-like" tarkoittaa ilmeisesti Kainuuta kuten aina. Yllättävän paljon "vanhaa karjalaa" Ruotsissa jo tuohon aikaan.

Artikkelin tietojen mukaan (SUPPLEMENTARY INFORMATION, Supplementary Note 2. Ancient DNA laboratory procedures and
sample selection) he ovat käyttäneet vertailuaineiston paneleiden kokoamisessa eri lähteitä. Suomalaiset ovat mukana ainakin ns. EU-datasarjassa (EU dataset), joka samaisen liitteen mukaan on "EGAD00000000120 dataset from The International Multiple Sclerosis Genetics Consortium & The Wellcome Trust Case ControlConsortium 2" (rivit 475-483), sekä 1000 Genomes -projektin 3-vaiheen aineistossa, jonka avulla on laadittu genominlaajuisia SNP-allelitaajuuksia liittyen pigmentaatioon, fenotyyppiin ja laktoosi-intoleranssiin. Uskon siksi, että EU-datasarjassakin ajatellen sen kokoamisen alkuperäistä tarkoitusta on suomalaisten osalta kyse laajemmasta otannasta kuin kuusamolaisista. Joku tuota aineistoa tunteva osaa kertoa tarkemmin.

Seuraava kohta itse artikkelitekstin osassa Gene flow into Scandinavia during the Viking era viittaa kontaktien osalta myös ilmeisesti pikemmin Lounais-Suomeen ainakin lähdeviitteen nro 45 nimen perusteella (ks. lainauksen alla) ja perustuen arkeologiseen lähdemateriaaliin
Lainaa:
A substantial interaction across the Baltic Sea is also suggested by objects from Finland found in graves in Middle Sweden, albeit recent Sr-isotope analyses are inconclusive regarding the origin of the buried individuals 45,46

Lähteet edellä ovat:
45. Gustin, I. Contacts identity and Hybridity: Objects from South-western Finland in the Birka graves. in Identity Formation and Diversity in the Early Medieval Baltic and Beyond 205–258 (BRILL, 2017). Google Scholar
46. Price, T. D., Arcini, C., Gustin, I., Drenzel, L. & Kalmring, S. Isotopes and human burials at Viking Age Birka and the Mälaren region, east central Sweden. Journal of Anthropological Archaeology 49, 19–38 (2018).

Kirjoittaja:  cromwell [ 31 Heinä 2019 23:59 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Jooh, vanha karjala jo Ruotsissa tuohon aikaan selittäisi ymmärtääkseni aika paljon koko Euroopan perimästä, vaikka tuntuvat esittävän ettei sitä muualla ole.
Voin toki olla täysin väärässäkin.

Kirjoittaja:  Johannes [ 01 Elo 2019 00:10 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

cromwell kirjoitti:
Jooh, vanha karjala jo Ruotsissa tuohon aikaan selittäisi ymmärtääkseni aika paljon koko Euroopan perimästä, vaikka tuntuvat esittävän ettei sitä muualla ole.
Voin toki olla täysin väärässäkin.

En ole tuosta vanhasta karjalaisesta perillä. Missä ja miten se on perimästä puhuttaessa määritelty? Ketkä ja missä esittävät, ettei sitä ole muualla [kuin Karjalassa?]?

Kirjoittaja:  Kristiina [ 10 Elo 2019 12:34 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Koska tuoreen viikinkipaperin näytteiden suuri määrä antaa mahdolllisuuden vertailla näytteitä monipuolisesti, laskeskelin äsken alueellisia eroja viikinkien isälinjoissa. Paperissa itsessäänhän annetaan pelkkä kokonaisjakauma.

Vanhimmat Tanskassa 100-300 AD
VK582 I2a1b1a-CTS616 (Globular Amphorae-linja)
VK532 I1a2a-Z59
VK521 I1a2a2a-Z2040 (Puola, Slovenia, Bulgaria, Suomi; germaanialue)

Salme Viro 700 AD
20/34 I1 (joista 7/20 L22 ja 8/20 Z73 sekä yksi 1/20 Z2040, neljä epäselviä; VK495 (I1a-DF29) on vahvasti suomalainen)
7/34 R1a1 (joista kaksi itäistä tyyppiä (M558) ja kaksi germaanista tyyppiä (Z284), muut epäselviä)
7/34 N (suurin osa L550, yksi VL29 ja yksi Y4706)

Tanska 800-1000 AD
19/43 R1b (joista 9/19 U106-linjassa ja 8/19 P312-linjassa ja kaksi epäselviä)
16/43 I1 (joista 7/16 L22-linjassa tai siihen johtavassa linjassa, 5/16 Z59-linjassa ja yksi I1c-linjassa; kolme epäselviä)
4/43 R1a1 (joista 2 itäisessä M558-linjassa ja yksi puolalaistyyppinen M458-linjassa, yksi epäselvä)
1/43 I2 I2a1b1a-CTS616 (Globular Amphorae-linja)
1/43 G2a-P15
1/43 J2a1a1a2b2
1/43 E1b1b1a1b1a-V13

Norja, Färsaaret, Islanti, Grönlanti ja Orkneysaaret (700-1600 AD)
19/56 R1b (joista 4/19 U106-linjassa ja 9/19 P312-linjassa, kaksi harvinaisessa A8041-linjassa (xU106, P312) ja neljä epäselviä)
19/56 R1a1 (joista yksi Z282-linjassa, 16/19 germaanista tyyppiä (Z284) ja kaksi epäselviä)
15/56 I1 (joista 4/15 L22-linjassa ja 2/15 Z73-linjassa, 9/15 epäselviä)
1/56 I2a1b1a-CTS616 (Globular Amphorae)
1/56 N (L550)
1/56 R2a2b1

Gotlanti 900-1100
10/23 R1a1 (joista kolme itäistä tyyppiä (M558; joukossa yksi perimältään vahvasti suomalainen), yksi Z92-linjassa (perimältään vahvasti suomalainen) ja yksi germaanista tyyppiä (Z284), viisi epäselviä)
5/23 R1b (joista 3/5 U106-linjassa ja 1/5 P312-linjassa ja yksi epäselvä
3/23 N (joista yksi L550, yksi VL29 ja yksi vahvasti suomalainen Y5005)
2/23 I1 (joista yksi L22:een johtavassa linjassa ja yksi maantieteellisesti laajalle levinneessä mutta pienehkössä M227-linjassa)
1/23 I2a1a2b1a1-CTS10228 (erityisesti slaaveille tyypillinen linja)
1/23 G2a2b2a1a1b1a1a2a1a-S23438/CTS10391
1/23 E1b1b1b2a1a4-L791

Uppsala, Skara, Öland ja Kärda (Etelä-Ruotsi) 700-1100 AD
20/55 R1b (joista 6/20 U106-linjassa ja 8/20 P312-linjassa ja kuusi epäselviä
12/55 I1 (joista kolme L22-linjassa ja kolme I1a2a1a1-linjassa (L1248 ja Z140), kuusi epäselviä)
7/55 R1a1 (joista yksi Z282-linjassa ja neljä germaanista tyyppiä (Z284), kaksi epäselviä)
6/55 I2 (joista viisi L801-linjassa (Globular Amphorae) tai siihen johtavassa linjassa; yksi epäselvä)
5/55 N (joista kolme L550-linjassa, yksi epäselvä ja yksi perimältään vahvasti suomalainen Y5003)
2/55 J2
1/55 G2a2b2a1a1b1a-Z40854
1/55 T1a2b1-CTS933
1/55 L2-L595

Yhdistynyt kuningaskunta (Oxford, Dorset), Irlanti (600-1100 AD)
14/35 R1b (joista 7/13 U106-linjassa ja 6/13 P312-linjassa ja yksi epäselvä)
11/35 I1 (joista 2/11 L22-linjassa, yksi Z59- ja yksi Z73-linjassa, 7/11 epäselviä)
7/35 R1a1 (joista 4/5 germaanista tyyppiä (Z284) ja kolme epäselviä)
2/35 I2 (joista yksi L1195 (Scotland Neolithic) ja toinen CTS6433 (Globular Amphorae, Polish Corded Ware)
1/35 Q1b-M346

Puola, Laatokan Karjala, Gnezdovo (Tverin Karjala), Pihkova, Shestovitsa Ukraina (900-1200 AD)
12/30 I1 (joista 2/12 L22-linjassa, 10/12 epäselviä)
10/30 R1a1 (joista 1/7 Z92-linjassa (Puola), 2/7 slaavilaista M458-tyyppiä (Venäjä, Ukraina), 1/7 germaanista tyyppiä (Z284, Laatokka; perimältään vahvasti suomalainen) ja kuusi epäselviä)
4/30 R1b (joista 2/4 P312-linjassa ja kaksi epäselviä)
2/30 I2 (joista yksi YP189 (PWC Motala & slaavilinja) ja toinen epäselvä)
1/30 N-VL29 (Gnezdovo, Tver)
1/30 T1a1a-L208 (40-60% suomea)

Italia (1000-1200)
2/3 R1b (joista yksi P312-linjassa ja toinen on Yamnaya-linja Z2108)
1/3 L1a1b-Z5926

Kirjoittaja:  Kristiina [ 10 Elo 2019 12:40 ]
Viestin otsikko:  Re: Population genomics of the Viking world

Kommentteja:

N-isälinja keskittyy tiettyihin paikkoihin eli erityisesti Viroon, Gotlantiin ja Ruotsiin. Tanskassa ja Norjassa ja lännempänä sitä ei näytä olevan juuri lainkaan. Tämä puoltaisi L550:n saapumissuunnaksi rautakautista Viroa. Salmen isälinjat muistuttavat muutenkin suomalaisia siinä, että tärkeimmät linjat ovat I1, N ja R1a1, mutta ei R1b.

Tanskassa tärkeimmät linjat ovat R1b ja I1. R1b jakaantuu melko tasaisesti U106:n ja P312:n kesken ja toisaalta myös I1-L22 ja xL22-linjojen kesken. Kaksi tanskalaista näytettä, yksi ruotsalainen näyte ja yksi englantilaisnäyte kuuluu Iberialle tyypilliseen R1b-DF27-linjaan.

Gotlanti poikkeaa isälinjafrekvensseiltään sekä Ruotsista että Tanskasta. Gotlannin R1a1-näytteistä vain yksi on varmasti germaanilinja

Ruotsin viikingeillä on enemmän R1b:tä kuin nykyruotsalaisilla.

Kaksi Färsaarten R1b-näytteistä kuuluu harvinaiseen A8041-linjaan L151/A8039:n alla.

Britteinsaarten isälinjajakauma muistuttaa Tanskan ja Ruotsin viikinkien isälinjajakaumaa.

Idässä on yllättävän paljon I1-linjaa. Määrä on jopa suurempi kuin R1a1-näytteiden määrä. Valitettavasti suurin osa näytteistä on tarkemmin määrittelemättömiä. Sama koskee valitettavasti myös R1a1-näytteitä. Olen laskenut R- ja R1-näytteen R1a:n alle, joten antamani frekvensit voivat niiden osalta poiketa todellisuudesta. Näyttäisi kuitenkin siltä, että idässä isälinjojen joukossa on paljon muita kuin tyypillisiä germaanilinjoja.

Italia poikkeaa tietenkin kaikista muista. Näytteitä on vain kolme, ja mikään niistä ei ole tyypillinen germaanilinja (R1b-P312, R1b-Z2108 ja L1a1b).

Sivu 1/1 Kaikki ajat ovat UTC + 2 tuntia [ DST ]
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group
http://www.phpbb.com/