Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

Alkuperää koskeva uutisointi ja uudet tutkimukset.

Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja merimaa » 23 Elo 2023 02:06

Haechan Gill, Juhyeon Lee, and Choongwon Jeong. (2023, preprint).
Reconstructing the genetic relationship between ancient and present-day Siberian populations.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101 ... 1.554074v1

Korealaiset hoitaa meille vastauksia. PDT_Armataz_01_34
merimaa
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
 
Viestit: 200
Liittynyt: 17 Marras 2022 19:14

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Jaska » 23 Elo 2023 08:02

merimaa kirjoitti:Haechan Gill, Juhyeon Lee, and Choongwon Jeong. (2023, preprint).
Reconstructing the genetic relationship between ancient and present-day Siberian populations.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101 ... 1.554074v1

Korealaiset hoitaa meille vastauksia. PDT_Armataz_01_34

Kiitos!
Poimintoja:

"Therefore, we suggest that Nganasan descended from a metapopulation to which Yakutia_LN and Krasnoyarsk_BA belonged but its direct ancestor had less contribution from the EastBaikal_N-related gene flow than Yakutia_LN."

"Russia_Bolshoy has high outgroup-f₃ values with Tarim_EMBA1, Yakutia populations, and EHG (Figure S4, Table S6). We found that a parsimonious two-way admixture model, Yakutia_MN+Middle Neolithic Combed Ceramic Culture (Estonia_MN_CCC), is feasible (p=0.453; 52% contribution from Yakutia_MN), as well as a more complex three-way admixture model of Yakutia_LN+Estonia_MN_CCC+Tarim_EMBA1 (p=0.217; 39% contribution from Yakutia_LN, 16% contribution from Tarim_EMBA1, and 45% contribution from Estonia_MN_CCC)."
[Kampakeraamikot sopivat hyvin Kuolan BOO:n eurooppalaisen perimäosuuden juureksi. Tämä puolisko lienee siis saatu Lapissa, jonne kampakeramiikka levisi jo kivikaudella, vaikkei voitane tässä vaiheessa täysin sulkea pois sitä vaihtoehtoa, että samaa perimää olisi levinnyt Luoteis-Siperiaankin.]

"We confirm that Yakutia_MN, who belonged to the Belkachi culture, is cladal with a Paleo-Eskimo individual Saqqaq (qpWave p=0.211; Table 1, Table S4). In addition, Yakutia_MN and Saqqaq are exchangeable in ancestry modeling: Yakutia_MN+Anzick fits ancient Athabaskans (p=0.264; 37% contribution from Yakutia_MN) and Saqqaq+Krasnoyarsk_MLBA adequately fits Ket (p=0.122; 75% contribution from Saqqaq) (Figure 4, Table S4). These results reveal shared Siberian ancestry between ancient North Athabaskan and present-day Yeniseian populations."

"The genetic difference between the Middle Neolithic Belkachi culture (Yakutia_MN) and Late Neolithic Ymyyakhtakh culture (Yakutia_LN) allows us to reason that the spread of the Siberian ancestry happened prior to Yakutia_LN. This fits with the time range given by the admixture date for the earliest presence of the Siberian ancestry in northeastern Europe (Bolshoy Oleni Ostrov; ca. 4,000 BP) and by the initial appearance of the Paleo-Eskimo culture (ca. 4,500 BP). This genetic evidence also aligns well with the dissemination of ceramic and lithic technologies, as documented by previous studies (Coutouly, 2016; Козлов et al., 2020).
Interestingly, evidence of the second wave of Siberian ancestry expansion, associated with Ymyyakhtakh culture, is discernible in Nganasan individuals but not in another Samoyedic-speaking population, Selkup. This suggests that the divergence within Samoyedic-speaking populations may go back to the Neolithic period."
[Tietenkin vain samojedien sulauttamien substraattiväestöjen osalta - samojedilainen kielihän levisi noille väestöille vasta tuhansia vuosia myöhemmin. Jonkun pitäisi opettaa geneetikoille monitieteisen tutkimuksen alkeet...]
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10979
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 23 Elo 2023 08:44

"Similar to Yakutia_LN and Krasnoyarsk_BA, 203 Nganasan could be modeled by Yakutia_MN+EastBaikal_N (p=0.796; 60% contribution from 204 Yakutia_MN), but its Yakutia_MN ancestry proportion was significantly higher than that of 205 Yakutia_LN (45%; Figure 4, Table 1, Table S4). This model breaks when Yakutia_LN was 206 added to the outgroup population set, supporting a strong affinity between Nganasan and Yakutia_LN (p=3.03x10-11 207 ; Table S4). Therefore, we suggest that Nganasan descended from a metapopulation to which Yakutia_LN and Krasnoyarsk_BA belonged but its direct ancestor 209 had less contribution from the EastBaikal_N-related gene flow than Yakutia_LN."

Eli edelleen näyttäisi siltä että kra001 perustuu Amurin latvojen ryhmien sekoittumiseen Lenan latvojen ryhmien kanssa. Nganasanit, ehkä liittyen maantieteeseen, omaavat enemmän Lenan alueen vanhaa perimää kuin kra001, joka on selvemmin ANA-pohjainen eli periytyy enemmän Amurin suunnalta. Yakutia_MN ja -_LN ryhmien ero tulee esille myös ilmeisesti siinä, että N-isälinja leviää samalla kun ANA-leviää, Q-isälinjan suhteellisesti vähentyessä. Olettaisin muuten että avaarit periytyvät osin myös ihan samasta EastBaikal_N-ryhmästä kuin kra001, koska heidät voidaan mallintaa kra001-genomin pohjalta ja heidän N-linjansa ainakin sivuaa uralilaisille tyypillista linjaa. Voi jopa olla että heilläkin on ihan samaa EastBaikal_N/Yakutia_MN-sekoitusta kuin kra001-näytteellä.
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6928
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja merimaa » 23 Elo 2023 19:23

Poimin artikkelin oheismateriaalin taulukoista tekstissä mainitut mallit seuraaville väestöille:

Yakutia_MN = Dzhylinda-1 (irk00x) 73% + WestBaikal_EN 27%
Yakutia_LN = Yakutia_MN 45% + EastBaikal_N 55%
Krasnoyarsk_BA (kra001) = Yakutia_MN 47,5% + EastBaikal_N 52,5%
Nganasan = Yakutia_MN 59,5% + EastBaikal_N 40,5%

WestBaikal_LNBA = irk030 76% + EastBaikal_N 24%

Selkup = Yakutia_MN 73% + Krasnoyarsk_MLBA 27%
Selkup = Yakutia_MN 73,5% + Sintashta_MLBA 26,5% (ei tekstissä)

Russia_Bolshoy = Yakutia_MN 52% + Estonia_MN_CCC 48%
Russia_Bolshoy = Yakutia_LN 39% + Estonia_MN_CCC 45% + Tarim_EMBA1 16% (vain tekstissä)

WestBaikal_EN olisi varmaan Taka-Baikalin ohella mahdollinen N-isälinjojen lähde jakutialaisille, koska Yakutia_MN on mallinnettu Dzhylinda-1 + WestBaikal_EN.

Hoksaatteko, mihin perustuu väite "Yakutia_MN belongs to Y haplogroup Q", jos ainoan näytteen N5a haploryhmää ei ole merkitty Excel-taulukkoon (Supplementary Table 1)? Sen kohdalla lukee vain "n/a (female)", mutta näytteen "molecular sex" on kuitenkin M eli mies.
merimaa
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
 
Viestit: 200
Liittynyt: 17 Marras 2022 19:14

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 23 Elo 2023 20:26

Tosin kyllä paperin kirjoittajat toteavat vielä seuraavaa:
Russia_Bolshoy has high outgroup-f₃ values with Tarim_EMBA1, Yakutia populations, and EHG (Figure S4, Table S6). We found that a parsimonious two-way
admixture model, Yakutia_MN+Middle Neolithic Combed Ceramic Culture (Estonia_MN_CCC), is feasible (p=0.453; 52% contribution from Yakutia_MN), as well as a more complex three-way admixture model of Yakutia_LN+Estonia_MN_CCC+Tarim_EMBA1 (p=0.217; 39% contribution from Yakutia_LN, 16% contribution from Tarim_EMBA1, and 45% contribution from Estonia_MN_CCC). Although less parsimonious, we still present the latter model for Y haplogroup information: Yakutia_LN and Russia_Bolshoy share haplogroup N, while Yakutia_MN belongs to Y haplogroup Q. Since only one individual is
available, we cannot ignore the possibility that Y haplogroup N existed in the Middle Neolithic
Yakutia population. Thus, further sampling on Middle Neolithic Yakutia is required to clarify
the origin of Y haplogroup N in Russia_Bolshoy.


On hyvä muistaa, että Baikalin ympäriltä löytyy varsin runsaasti eri N-haploja:
Aro: N2a-P189.2 (Botai noin 3500 BC)
Etu-Baikal: N1a2a-pre-CTS6380/M128 (7035-6690 calBCE), N1a2 (Lokomotiv 6680 ybp), N2b1 (Shamanka 7000 bp), N1a1a1a1*-Y9023* (Irkutsk 4316-3997 calBCE)
Etelä-Baikal ja Buryatia: N2b (Fofonovo 5000-4000 BCE), N1a2 (Zhindo 5706 calBC), N1a1a1b-B187 (Fofonovo 5000-4000 BC)
Taka-Baikal: N1a1a1a-L708 (brn008 5615-5485 calBCE), N1a1a1a1-M2126 (Dvorcy-Dacha 4790-4685 calBCE), N1a2b1a-pre-F1101(Nozhyj lake 4325-4280 calBCE)

Tässä korealaispaperissa esitetään myös se mahdollisuus, että uralilaisiinkin johtavia N-haploja leviää Baikalin länsipuolelta Jakutiaan jo Belkachi-kaudella, koska kra001 ja nganasanit ovat kauempana Amurista kuin Yakutia LN. Näin sitäkin kautta, että Jakutia MN muodostuu Dzhylindasta ja West-Baikal Eneolithicista, joista jälkimmäisen isälinjoista puolet on N-haploja ja puolet C-haploja.
Viimeksi muokannut Kristiina päivämäärä 24 Elo 2023 07:00, muokattu yhteensä 4 kertaa
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 23 Elo 2023 20:31

merimaa kirjoitti:Hoksaatteko, mihin perustuu väite "Yakutia_MN belongs to Y haplogroup Q", jos ainoan näytteen N5a haploryhmää ei ole merkitty Excel-taulukkoon (Supplementary Table 1)? Sen kohdalla lukee vain "n/a (female)", mutta näytteen "molecular sex" on kuitenkin M eli mies.


Kai se on virhe, koska alkuperäisessä paperissa (Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia) kyseisen näytteen isälinjaksi on merkitty Q1b1b.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 23 Elo 2023 21:17

Yksi mielenkiintoinen seuraus tästä paperista voisi olla se, että Bolshoysta ei tarvitse enää etsiä WSHG:tä vaan tämäkin perimä voidaan selittää pohjoisimman vyöhykkeen migraatioilla.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 24 Elo 2023 06:58

Huomaan, että Rekonpoika on joskus kommentoinut p-arvoa:
Siis jos outgroupeissa ovat sardinialaiset, kiinalaiset ja yorubat ja p-arvo on hyvä (akateemiset paperit hyväksyvät jo >0.05 mutta suurempi parempi, 1 on maksimi ja yli 0.7 voi pitää täysosumana) onnistunut tulos tarkoittaa että sekoitus jakaa outgroupien kanssa yhtä paljon ajautumaa kuin näyte.


Yakutia_MN + Middle Neolithic Combed Ceramic Culture (Estonia_MN_CCC) -> p=0.453
Yakutia_LN + Estonia_MN_CCC + Tarim_EMBA1 p=0.217

Onkohan niillä joku syy siihen, etteivät kokeilleet lisäksi WSHG:tä tai muuta proksimaalisempaa näytettä. Joka tapauksessa tuon ensimmäisen mallin p-arvo on selvästi parempi.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 24 Elo 2023 09:05

Kristiina kirjoitti:Yksi mielenkiintoinen seuraus tästä paperista voisi olla se, että Bolshoysta ei tarvitse enää etsiä WSHG:tä vaan tämäkin perimä voidaan selittää pohjoisimman vyöhykkeen migraatioilla.

Jo edellinen Jeong et al paperi totesi, että neoliittinen länsisiperia, Allentoft et al-paperia mukaillen, on nykyisin pohjoinen substraatti ja uralinpuhujat eivät siis jaa sitä kattavasti.

"The Botai and more recent ancient genomes from Siberia show a decrease in contributions from so-called ‘ancient North Eurasian’ ancestry over time, which is detectable only in the northern-most ‘forest-tundra’ cline."

https://www.nature.com/articles/s41559-019-0878-2
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6928
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 24 Elo 2023 10:21

Mitä oikein tarkoitat neoliittisella länsi-siperialla? Mehän käytiin juuri läpi se, mitä tuossa Jeongin paperissa sanotaan:

The steppe cline populations derive their Eastern Eurasian ancestry from a gene pool similar to contemporary Tungusic
speakers from the Amur river basin (Figs. 2 and 4), thus suggesting a genetic connection among the speakers of languages belonging to
the Altaic macrofamily (Turkic, Mongolic and Tungusic families). Based on our results, as well as Early Neolithic genomes from the
Russian Far East, we speculate that such a gene pool may represent the genetic profile of prehistoric hunter-gatherers in the
Amur river basin. In contrast, a distinct Nganasan-related Eastern Eurasian ancestry in the forest-tundra cline suggests substantial
separation between these two eastern ancestries. Nganasans have high genetic affinity with prehistoric individuals with the ANE
ancestry in North Eurasia, such as the Upper Palaeolithic Siberians or the Mesolithic eastern European hunter-gatherers (EHG), which is exceeded only by Native Americans and by Beringians among Eastern Eurasians
(Supplementary Fig. 7). Also, Northeast Asians
are closer to Nganasans than they are to either Beringians, Native Americans or ancient Baikal populations, and the ANE affinity in
East Asians is correlated well with their affinity with Nganasans (Supplementary Fig. 8). We hypothesize that Nganasans may be
relatively isolated descendants of a prehistoric Siberian metapopulation with high ANE affinity, which formed present-day Northeast
Asians by mixing with populations related to the Neolithic Northeast Asians.


Tässä menee koko ajan sekaisin Altain ja Tarimin ANE-perimä, jota on WSHG:ssä, ja arktinen ANE-perimä, jota on uralilaisissa ja nganasaneissa. Tähän arktiseen ANEen ilmeisesti yhdistyy myös sen tyyyppistä ENAa, jota on Amerikan intiaaneilla ja jota Altailla on vain vähän. Intiaaneillahan on noin 60-70 prosenttia ENAa ja ANEa vain 30-40 prosenttia. Kolmas perimätyyppi on sitten Amur-tyyppinen perimä, joka leviää arolla rautakaudella ja jota on erityisesti tunguusikielten puhujissa ja jonka haluat yhdistää uralilaisiin.

Jeong et al pitää siis nganasaneja ANE-populaationa!
Viimeksi muokannut Kristiina päivämäärä 24 Elo 2023 11:57, muokattu yhteensä 3 kertaa
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 24 Elo 2023 10:36

Yritin joskus hahmottaa tätä jatkuvaa sekaannusta nganasanien ja ANEn välillä Itä-Siperian kieliin liittyvässä kommentissani:
Joidenkin mielestä jeniseiläiskielet on otettava pois [itäsiperialaisesta] listasta, koska heillä on paljon ANEa. Selkupeilla, hanteilla ja manseillakin on paljon ANEa, mutta uralilaisia ei voi sillä perusteella missään tapauksessa ottaa pois listalta. Tämän listan tarkoitusperän näkökulmasta nganasaneilla ei tietenkään ole ANEa vaan pelkkää itäsiperiaa. Toisessa yhteydessä heillä tietenkin on paljon ANEa, koska jonkun mielestä nganasan on yhtä kuin evenki + ANE

Sekavuus syntyy siitä, että jos tarkoituksena on pitää uralilaiset erillään oikeista ANE-kansoista, väitetään, että nganasaneilla ja samalla uralilaisilla ei ole ANEa, mutta jos pitää selittää se, miksi vanhimmat N-haplot Siperiassa eivät olekaan suoraan amurilaisia, täytyy myöntää, että heillä on jopa puolet muuta perimää, mm. ANEa.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 24 Elo 2023 11:45

Kristiina kirjoitti:Jeong et al pitää siis nganasaneja ANE-populaationa!

Ei, mutta mutta yhteys on silti ilmeisesti todellinen Yakutia_MN-perimän kautta.
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6928
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 24 Elo 2023 11:54

Joo, tuo kommenttini oli ironiaa.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 24 Elo 2023 17:55

Kristiina kirjoitti:
merimaa kirjoitti:Hoksaatteko, mihin perustuu väite "Yakutia_MN belongs to Y haplogroup Q", jos ainoan näytteen N5a haploryhmää ei ole merkitty Excel-taulukkoon (Supplementary Table 1)? Sen kohdalla lukee vain "n/a (female)", mutta näytteen "molecular sex" on kuitenkin M eli mies.


Kai se on virhe, koska alkuperäisessä paperissa (Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia) kyseisen näytteen isälinjaksi on merkitty Q1b1b.


Lähetin muuten äsken kyselyn Choongwon Jeongille, jonka sähköpostiosoite annetaan preprintissä. Katsotaan, vastaako ja milloin vastaa. Tarkistin, että itse asiassa alkuperäisessäkään paperissa ei määritellä isälinjaa, joten näyttää siltä, että se on peräisin vain amatööreiltä: Taraskinin AG-postauksesta ja Quilesilta (https://indo-european.eu/2021/01/earlie ... t-siberia/). Ei varmaan kuitenkaan ole syytä mitenkään vahvasti olettaa, että määritys olisi väärä. Lisäksi kysyin myös sitä, ovatko he onnistuneet parantamaan alkuperäisen näytteen coveragea, koska se on uudessa paperissa selvästi parempi.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja merimaa » 25 Elo 2023 00:57

Kristiina kirjoitti:Lähetin muuten äsken kyselyn Choongwon Jeongille, jonka sähköpostiosoite annetaan preprintissä. Katsotaan, vastaako ja milloin vastaa. Tarkistin, että itse asiassa alkuperäisessäkään paperissa ei määritellä isälinjaa, joten näyttää siltä, että se on peräisin vain amatööreiltä: Taraskinin AG-postauksesta ja Quilesilta (https://indo-european.eu/2021/01/earlie ... t-siberia/). Ei varmaan kuitenkaan ole syytä mitenkään vahvasti olettaa, että määritys olisi väärä. Lisäksi kysyin myös sitä, ovatko he onnistuneet parantamaan alkuperäisen näytteen coveragea, koska se on uudessa paperissa selvästi parempi.

Ahaa, toivottavasti vastaa. Ehkä tieto isälinjasta on olemassa tutkijoilla, mutta sitä ei ole vielä julkaistu.
merimaa
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
 
Viestit: 200
Liittynyt: 17 Marras 2022 19:14

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 25 Elo 2023 17:38

Vastaus tuli jo! PDT_Armataz_01_01

Vapaasti suomennettuna selitys on, että analyysivaiheessa määrittivät itsenäisesti Onnyos-näytteen haploryhmän Q1a2a:ksi, mutta valitettavasti tämä tieto jäi lisäämättä Excel-taulukkoon.

Q1a2a-L53 (ISOGG 2016)
Q1b1-L53 (ISOGG 2019-2020)

Lisäksi he huomasivat, että ENA-arkistoon ladattu kyseisen näytteen datatiedosto olikin ilmoitettua parempi, joten sen avulla olikin mahdollista tehdä tarkempia analyysejä.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja merimaa » 25 Elo 2023 19:43

Kristiina kirjoitti:Vastaus tuli jo! PDT_Armataz_01_01

Hienoa, kiitos vaivannäöstä!
merimaa
Turiseva turkulainen
Turiseva turkulainen
 
Viestit: 200
Liittynyt: 17 Marras 2022 19:14

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja perttimp » 25 Elo 2023 21:56

-
Tuolla on kuva , jossa mallinnettu siperialaisia näytteitä.
https://drive.google.com/file/d/1M67KOzPruFCYCb9HRd6UKlojto71CbCU/view?usp=sharing

Pari esimerkkiä.
Target: Russia_Krasnoyarsk_BA.SG:kra001_noUDG.SG
Distance: 2.5245% / 0.02524497
43.2 China_AmurRiver_LPaleolithic:NE56_noUDG
30.4 Virtual_old_Siberia
22.8 Chile_LosRieles_12000BP:I11974
2.6 ITA_Villabruna:Villabruna
1.0 MAR_Taforalt:TAF011
0.0 USA_AK_PaleoAleut:I0712
0.0 IRN_HotuIIIb_Meso
0.0 TUR_Pinarbasi_HG:ZBC_IPB001
0.0 GEO_CHG:KK1
0.0 RUS_AfontovaGora3:AfontovaGora3
0.0 Russia_Siberia_UP:UKY001
0.0 Russia_LenaRiver_LUP.SG:yak025_noUDG.SG
0.0 Levant_Natufian_EpiP:I0861
0.0 Virtual_Even
0.0 China_AmurRiver_LPaleolithic:NE5_noUDG

Target: Russia_CentralYakutia_LN.SG:N4b2_noUDG.SG
Distance: 1.2840% / 0.01284010
29.4 China_AmurRiver_LPaleolithic:NE5_noUDG
21.2 Virtual_old_Siberia
17.4 USA_AK_PaleoAleut:I0712
12.2 China_AmurRiver_LPaleolithic:NE56_noUDG
11.0 Russia_Siberia_UP:UKY001
2.8 RUS_AfontovaGora3:AfontovaGora3
2.4 Chile_LosRieles_12000BP:I11974
1.6 Virtual_Even
1.4 ITA_Villabruna:Villabruna
0.4 Levant_Natufian_EpiP:I0861
0.2 TUR_Pinarbasi_HG:ZBC_IPB001
0.0 IRN_HotuIIIb_Meso
0.0 GEO_CHG:KK1
0.0 Russia_LenaRiver_LUP.SG:yak025_noUDG.SG
0.0 MAR_Taforalt:TAF011
-
Siinä on käytetty virtuaalikomponenttia (Virtual _old_Siberia), kun aitoja ei ole Pohjois-Euraasiasta. Sen takia mallinnus ei ole aivan täysin realistinen, mutta näytteitä voi verrata toisiinsa, että ovatko samanlaisia vai erilaisia geneettisesti. USA_AK on eskimo-tyyppinen komponentti. Sitä ei ole kra001 näytteellä.
-
perttimp
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen
 
Viestit: 181
Liittynyt: 30 Joulu 2011 12:21

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 26 Elo 2023 07:40

Ihan pätevän näköisiä malleja, osin proxyjen pohjalta tietysti. Alkuperäinen neoliittinen Amur ja ns. varhaisempi Lena (joka saattoi ulottua pitkällekin Krasnojarskin suuntaan?) laimenevat eri tavoin uralilaisissa ryhmissä länteen edetessä, esim. samojedit kai sekaantuvat ket-ryhmään jne. Amurin ja Lenan perimänkin sekoittuminen, liikkeen alkuvaiheessa, perustuu tietysti muuttoon Baikalin itäpuolelta kohti länttä, - tai luodetta, riippuen siitä missä Jakutia_MN-perimää silloin on ollut tarjolla. Ehkä jopa itäisellä Sajanilla?
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6928
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Gill et al. 2023: ancient and present-day Siberian ...

ViestiKirjoittaja Kristiina » 26 Elo 2023 22:15

Mielenkiintoinen analyysi! Tein pieniä vertailuja ensin läntisempien uralilaisten ja erityisesti saamelaisten ja Bolshoyn välillä: Bolshoyssä on pieniä määriä epipaleoliittista Heilongjiangin NE-5:tä, mikä käytännössä puuttuu uralilaisilta. Toinen ero ENA-perimässä liitty paleoaleutilaisperimään, jota uralilaisilla ei nganasaneja lukuun ottamatta myöskään ole. Mutta toisaalta nganasaneilla tämän perimän osuus on peräti 17 prosenttia. Sekä Bolshoylla että uralilaisilla molemmilla ENA koostuu pääasiassa samasta kahdesta ryhmästä: paleoliittisesta Heilongjangin NE56-perimästä ja virtuaalisesta siperiasta.

Sargat on odotetusti aika lähellä uralilaisia, mutta heillä on jonkin verran NE-5-perimää, joka on modaalinen perimä Baikalin pronssikautisella väestöllä, kuten myös Amurin nykyväestöillä sekä yleensä tunguusi-, mongoli- ja turkkilaisväestöillä. Jos katsoo, miten kra001, nenetsit ja nganasanit poikkeavat ENAnsa osalta muista uralilaisista, nenetsejä erottaa läntisistä uralilaisista Chilen Los Rieles-perimä, jonka prosenttiosuudet nganasaneilla ja kra001:llä ovat vielä tätäkin suurempia. Itse asiassa kra001:llä on tätä perimää koko taulukon suurin määrä, 23 prosenttia.

Mongolien itäinen perimä on lähes pelkästään Amur-tyyppistä NE-5:tä. Heillä on hyvin vähän virtuaalista siperiaa, joka maksimoituu nganasaneissa ja kra001:ssä, eikä lainkaan urailaisilla yleistä NE56-perimää. Turkkilaisten ENA on samantapaista kuin mongoleilla. Heillä on kuitenkin huomattavan paljon läntistä perimää.

Kun katsoo taulukon arvoja, kra001 vaikuttaa varsin omintakeiselta ja pikemminkin vanhemmalta kuin uudemmalta sekoitukselta:
43 % LGM Heilongjiang NE China NE56/AR19K 19587–19175 calBC
30 % Virtual Old Siberia
23 % LosRieles Chile 11 BP
3 % Villabruna
1 % Taforalt

Tämän analyysin valossa Onnyos/N5a poikkeaa kuitenkin selvästi kra001:stä:
24 % LGM Heilongjiang NE China NE56/AR19K 19587–19175 calBC
22 % UKY001 Ust'Kyakhta South Baikal 14054–13771 BP
18 % Paleo-Aleut I0712 1260-870 calBP
13 % Virtual Old Siberia
11 % Epipaleolithic Heilongjiang NE China NE-5/AR14.1K 14814–14017 calBC
6 % Afontova Gora 3 16,7 kya
5 % LosRieles Chile 11 BP
2 % Mesolithic Pınarbaşı Turkey 13.6-13 kya
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Seuraava

Paluu Uutiset ja tutkimukset

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Ei rekisteröityneitä käyttäjiä ja 15 vierailijaa