Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE Asia

Alkuperää koskeva uutisointi ja uudet tutkimukset.

Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE Asia

ViestiKirjoittaja Fagus » 07 Tammi 2021 14:08

Koillis-Aasian populaatioista löytyy N-haploryhmää:

Gülşah Merve Kılınç, Natalija Kashuba, Dilek Koptekin, Nora Bergfeldt, Handan Melike Dönertaş, Ricardo Rodríguez-Varela, Dmitrij Shergin, Grigorij Ivanov, Dmitrii Kichigin, Kjunnej Pestereva, Denis Volkov, Pavel Mandryka, Artur Kharinskii, Alexey Tishkin, Evgenij Ineshin, Evgeniy Kovychev, Aleksandr Stepanov, Love Dalén, Torsten Günther, Emrah Kırdök, Mattias Jakobsson, Mehmet Somel, Maja Krzewińska, Jan Storå, and Anders Götherström: Human population dynamics and Yersinia pestis in ancient northeast Asia, Science Advances 06 Jan 2021: Vol. 7, no. 2, eabc4587
DOI: 10.1126/sciadv.abc4587 https://advances.sciencemag.org/content/7/2/eabc4587
Fagus
Sutki savolainen
Sutki savolainen
 
Viestit: 614
Liittynyt: 17 Tammi 2014 18:19

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 08 Tammi 2021 20:32

Viittaan aiempaan keskusteluun eskimouralista todetakseni, että uusimmassa paperissa on pari N-haploa, jotka ovat jo melko lähellä Beringiaa:
Late Neolithic SW Yakutia Kyordyughen 2 N4a1 2830-2820 calBCE N1a-L729
Late Neolithic SW Yakutia Kyordyughen 1 N4b2 2475-2295 calBCE N1a1a1a-L708

Nämä ovat tietenkin liian nuoria ollakseen oikeasti kantauralia edeltävällä tasolla.

Jos tutkimukseen sisältyvät varhaisemmatkin näytteet kuuluisivat samaan väestöön, jolla olisi N-linjoja, kyseessä voisi olla todellinen linkki Uralilaisten kielten puhujien ja Eskimo-Aleut kielten puhujien välillä:
Early Neolithic SW Yakutia Matta-1 N2a 4895-4725 calBCE
Middle Neolithic SW Yakutia Onnyos N5a 4340-4235 cal BCE

Onnyos edustaa Belkachi-kulttuuria. Matta on nainen ja Onnyos on mies, mutta hänen isälinjastaan ei ole tietoa.

Luin Wikipediasta artikkelin Syalakhin kulttuurista: https://en.wikipedia.org/wiki/Syalakh_culture

Aiempien ja tämän uuden paperin valossa vaikuttaisi jopa todennäköiseltä, että keramiikan toi Jakutiaan väestöliike, jolla oli paljon N-haploja, koska Syalakhin kulttuurin alkuperä on keramiikkaa valmistavassa Transbaikalin väestöstä, joka ilmeisesti sulautui aiempaan Sumnaginin väestöön. Paleoeskimot saivat ilmeisesti alkunsa tästä uudesta kulttuurista.

Tässä mallissa N-haplot olisivat kuitenkin Baikalilta, joten olisi mielestäni todennäköisempää, että eskimouralin alkuperäiset piirteet tulisivat pikemminkin uralin kuin eskimoaleutin puolelta. Olisi luontevaa, että dynamiikka, mukaan lukien kieli, kulkisi etelästä pohjoiseen eli keskusalueelta kohti periferiaa, eikä toisinpäin.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 12 Tammi 2021 18:17

Selvittelin äsken KITLG-geenin alleelien frekvenssejä tässä uudessa paperissa.

Ensinnäkin "The derived allele of the KITLG gene (SNP rs12821256) that is associated with – and likely causal for – blond hair in Europeans is found in populations with Eastern but not Western Hunter-Gatherers ancestry"

Vähän tieteellisemmin: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articl ... figure/F4/

Lähde: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4704868/

Tässä ovat eri näytteiden arvot:

KITLG alleeli
brn003 2G XY N1a1a1a1-pre-M2005/P298
brn008 1A XY N1a1a1a-pre-L708
irk007 2G XY N1a2a-pre-CTS6380/M128
irk022 8G XY Q1b1a3-L330
irk025 6G XY Q1b1a-L53
irk030 9G/A XY Q1b1a3-L330
irk034 # XX
irk036 4A XY Q1b1a-L53
irk040 11G/A XY Q1b1a-L53
irk051 4A XX
irk061 6A XY Q1b1a-L53
irk068 2A XY Q1b1a-L53
irk071 3G XY Q1b-M346
irk075 5G XY Q1b-M346
N4b2 4G XY N1a1a1a1a-pre-L1026
yak022 11G XX
yak024 4G XX
kra001 8G XY N1a1a1a1a-L1026*
cta016 4G XX
irk00x # XY C2a1a-F1699/F6301
irk017 3G XX
yak021 2A XX

Lopputulos on, että neljällä viidestä N-miehestä on G alleeli. Neljällä Q-miehellä yhdeksästä on G alleeli. Kahdella yhdeksästä on G/A.

Osaisiko joku vielä kertoa, mitä numero G:n tai A:n edessä tarkoittaa?

Mikä onkaan lopputulema yleiskielellä?
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Jaska » 12 Tammi 2021 18:59

Kristiina kirjoitti:Selvittelin äsken KITLG-geenin alleelien frekvenssejä tässä uudessa paperissa.

Ensinnäkin "The derived allele of the KITLG gene (SNP rs12821256) that is associated with – and likely causal for – blond hair in Europeans is found in populations with Eastern but not Western Hunter-Gatherers ancestry"

Vähän tieteellisemmin: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articl ... figure/F4/

Lähde: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4704868/

Tässä ovat eri näytteiden arvot:

KITLG alleeli
brn003 2G XY N1a1a1a1-pre-M2005/P298
brn008 1A XY N1a1a1a-pre-L708
irk007 2G XY N1a2a-pre-CTS6380/M128
irk022 8G XY Q1b1a3-L330
irk025 6G XY Q1b1a-L53
irk030 9G/A XY Q1b1a3-L330
irk034 # XX
irk036 4A XY Q1b1a-L53
irk040 11G/A XY Q1b1a-L53
irk051 4A XX
irk061 6A XY Q1b1a-L53
irk068 2A XY Q1b1a-L53
irk071 3G XY Q1b-M346
irk075 5G XY Q1b-M346
N4b2 4G XY N1a1a1a1a-pre-L1026
yak022 11G XX
yak024 4G XX
kra001 8G XY N1a1a1a1a-L1026*
cta016 4G XX
irk00x # XY C2a1a-F1699/F6301
irk017 3G XX
yak021 2A XX

Lopputulos on, että neljällä viidestä N-miehestä on G alleeli. Neljällä Q-miehellä yhdeksästä on G alleeli. Kahdella yhdeksästä on G/A.

Osaisiko joku vielä kertoa, mitä numero G:n tai A:n edessä tarkoittaa?

Se kertoo, montako lukua kyseisestä nukleotidista on saatu. Jos ero on selvä, esim. 6 vs. 1, näyte yleensä tulkitaan homotsygoottiseksi, ja vasta jos suhde on tasaisempi, se tulkitaan heterotsygoottiseksi eli että henkilöllä oikeasti oli kumpikin alleeli.

Kristiina kirjoitti:Mikä onkaan lopputulema yleiskielellä?

Että yhden kohdan perusteella ei voi sanoa mitään. PDT_Armataz_01_18
Hiustenkin vaaleuteen liittyy monia kohtia. Siksi kokonaiskuvan vuoksi enenevässä määrin kehitetään ja käytetään HirisPlex-tyyppisiä nippuanalyysejä.
viewtopic.php?f=10&t=2983

Kaikki korrelaatiot toisvanhempaisten haploryhmien ja autosomaalisten kohtien välillä ovat väkisinkin hetkellisiä ja yhteisökohtaisia, koska nämä tasot ovat toisistaan täysin riippumattomia: korrelaatio voi muuttua jo naapuriyhteisössä tai parissa sukupolvessa.
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 12 Tammi 2021 19:17

Toisaalta nämä tulokset osoittavat, että on hyvin mahdollista, että uralilaisten kansojen taustalla olevat N-miehet jo kantoivat vaaleatukkaisuuden geenejä. Tietääkseni Euroopassa vielä pronssikaudellakin väestöillä oli pääasiassa alkuperäistä A alleelia.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Jaska » 12 Tammi 2021 20:26

Kristiina kirjoitti:Toisaalta nämä tulokset osoittavat, että on hyvin mahdollista, että uralilaisten kansojen taustalla olevat N-miehet jo kantoivat vaaleatukkaisuuden geenejä. Tietääkseni Euroopassa vielä pronssikaudellakin väestöillä oli pääasiassa alkuperäistä A alleelia.

Sitä pitäisi arvioida kunkin näytteen aika ja paikka kerrallaan: mistä ja miltä ajanjaksolta vaalean alleelin N-miehet ovat peräisin, ja onko systemaattista eroa tumman alleelin N-miehiin? Onko saman väestön piirissä eri alleeleja? Edustaako näyte arkeologisesti jotain kulttuuria, joka on säteillyt vaikutteita tänne suuntaan? Siltikään yhteyttä ei voisi yleistää laajalle alueelle ja pitkään ajanjaksoon.

Mutta joo, eri geenikohtien vaaleita alleeleja toki on kiertänyt Euroopassa jo pidempään. Kokonaisuus eli kaikki kymmenet kohdat sitten ratkaisevat, oltiinko oikeasti vaaleita vai ei.
http://www.elisanet.fi/alkupera/Tummaih ... stajat.pdf
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 16 Tammi 2021 00:05

YFull lisäsi tutkimuksen uudet näytteet puuhunsa, erityisen kiinnostava mm. ajoituksen osalta on Krasnojarskin alueen kra01, noin 4000 vuotta vanha näyte.

N-L1026 Z4862 * CTS10336 * CTS6967+32 SNPs formed 6200 ybp, TMRCA 4700 ybpinfo

N-L1026* id:kra01RUS [RU-KYA]

Löytöpaikka on Jenisein valuma-alueella, siis aika kaukana idässä myös Uralilta katsottuna. Joten, jos kantauralia puhuttiin kaverin eläessä jo Uralilla, mitäs kieltä hän puhui?
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6925
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Jaska » 16 Tammi 2021 03:33

Kinaporin kalifi kirjoitti:YFull lisäsi tutkimuksen uudet näytteet puuhunsa, erityisen kiinnostava mm. ajoituksen osalta on Krasnojarskin alueen kra01, noin 4000 vuotta vanha näyte.

N-L1026 Z4862 * CTS10336 * CTS6967+32 SNPs formed 6200 ybp, TMRCA 4700 ybpinfo

N-L1026* id:kra01RUS [RU-KYA]

Löytöpaikka on Jenisein valuma-alueella, siis aika kaukana idässä myös Uralilta katsottuna. Joten, jos kantauralia puhuttiin kaverin eläessä jo Uralilla, mitäs kieltä hän puhui?

Hyvä kysymys. Varmaan kymmenittäin muinaiskieliä Siperiassa on kadonnut viime vuosituhansien nuorten ekspansioiden alle: hanti, mansi, samojedi, jeniseiläiset, turkkilaiset, mongolilaiset ja tunguusilaiset kielet peittävät valtaosan Siperian pinta-alasta. Vain idässä ja koillisessa on jäljellä mahdollisesti vanhempien kieliaaltojen edustajia.
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 16 Tammi 2021 11:06

Jaska kirjoitti:
Kinaporin kalifi kirjoitti:YFull lisäsi tutkimuksen uudet näytteet puuhunsa, erityisen kiinnostava mm. ajoituksen osalta on Krasnojarskin alueen kra01, noin 4000 vuotta vanha näyte.

N-L1026 Z4862 * CTS10336 * CTS6967+32 SNPs formed 6200 ybp, TMRCA 4700 ybpinfo

N-L1026* id:kra01RUS [RU-KYA]

Löytöpaikka on Jenisein valuma-alueella, siis aika kaukana idässä myös Uralilta katsottuna. Joten, jos kantauralia puhuttiin kaverin eläessä jo Uralilla, mitäs kieltä hän puhui?

Hyvä kysymys. Varmaan kymmenittäin muinaiskieliä Siperiassa on kadonnut viime vuosituhansien nuorten ekspansioiden alle: hanti, mansi, samojedi, jeniseiläiset, turkkilaiset, mongolilaiset ja tunguusilaiset kielet peittävät valtaosan Siperian pinta-alasta. Vain idässä ja koillisessa on jäljellä mahdollisesti vanhempien kieliaaltojen edustajia.

Yksinkertaisin malli lienee se, että (esi-)kantaurali lähti liikkeelle jostain Altai-Sajanilta ja Seima Turbinon myötä vasta suunnilleen tämän veijarin vielä eläessä.

P.S. "По мнению некоторых исследователей появление памятников турбинско-сейминского типа связано с миграцией плёмен воинов-коневодов-металлургов с территории Алтая на запад в сер. 2 тыс. до н. э. " Eli: "Joidenkin tutkijoiden mukaan Turbino-Seima-tyyppisten muistomerkkien olemus liittyy sotureiden, hevoskasvattajien ja metallurgien heimojen siirtymiseen Altain alueelta länteen 2000 eKr puolivälissä."

http://enc.permculture.ru/showObject.do ... 1803977955

Kun Suomi taitaa olla ainoa paikka, missä kesyhevosista on löydetty Botai-hevosten perimää, voisi ajatella että tätä perimää tuli länteen osana ST liikehdintää.
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6925
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Rekonpoika » 16 Tammi 2021 12:25

Kesyhevosten Botai-perimää on löydetty Baltiasta ja Keski-Euroopastakin kun muinaisnäytteet rautakaudelta ja keskiajalta huomioidaan. kra01 voisi isälinjansa perusteella liittyä Bolshoihin ja Jäämeren rannan tai pohjois-Siperian kulttuureihin.
Rekonpoika
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 4295
Liittynyt: 12 Elo 2013 12:41

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 16 Tammi 2021 12:28

Rekonpoika kirjoitti:Kesyhevosten Botai-perimää on löydetty Baltiasta ja Keski-Euroopastakin kun muinaisnäytteet rautakaudelta ja keskiajalta huomioidaan. kra01 voisi isälinjansa perusteella liittyä Bolshoihin ja Jäämeren rannan tai pohjois-Siperian kulttuureihin.

Tietysti liittyy, ainakin jollain tasolla, mutta ei esim. N-Z1936 linjaa voi ihan helposti Kuolasta johtaa, jos ei oleta, että linja eteni samaan aikaan Uralilta Volgaa pitkin länteen.
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6925
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Rekonpoika » 16 Tammi 2021 12:36

Kinaporin kalifi kirjoitti:
Rekonpoika kirjoitti:Kesyhevosten Botai-perimää on löydetty Baltiasta ja Keski-Euroopastakin kun muinaisnäytteet rautakaudelta ja keskiajalta huomioidaan. kra01 voisi isälinjansa perusteella liittyä Bolshoihin ja Jäämeren rannan tai pohjois-Siperian kulttuureihin.

Tietysti liittyy, ainakin jollain tasolla, mutta ei esim. N-Z1936 linjaa voi ihan helposti Kuolasta johtaa, jos ei oleta, että linja eteni samaan aikaan Uralilta Volgaa pitkin länteen.


Ei Kuolasta mutta entäs Komin tasavallasta? PDT_Armataz_01_12 Tietty Z1936 on tainnut olla olemassa jo kra01:n aikaan. Levinneisyyden perusteella, jos se liittyy nykylinjoihin niin L550 ja eskimot voisivat olla perillisiä mutta pointti iästä pätee täälläkin.
Rekonpoika
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 4295
Liittynyt: 12 Elo 2013 12:41

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kinaporin kalifi » 16 Tammi 2021 12:51

Rekonpoika kirjoitti:
Kinaporin kalifi kirjoitti:
Rekonpoika kirjoitti:Kesyhevosten Botai-perimää on löydetty Baltiasta ja Keski-Euroopastakin kun muinaisnäytteet rautakaudelta ja keskiajalta huomioidaan. kra01 voisi isälinjansa perusteella liittyä Bolshoihin ja Jäämeren rannan tai pohjois-Siperian kulttuureihin.

Tietysti liittyy, ainakin jollain tasolla, mutta ei esim. N-Z1936 linjaa voi ihan helposti Kuolasta johtaa, jos ei oleta, että linja eteni samaan aikaan Uralilta Volgaa pitkin länteen.


Ei Kuolasta mutta entäs Komin tasavallasta? PDT_Armataz_01_12 Tietty Z1936 on tainnut olla olemassa jo kra01:n aikaan. Levinneisyyden perusteella, jos se liittyy nykylinjoihin niin L550 ja eskimot voisivat olla perillisiä mutta pointti iästä pätee täälläkin.

Arvailisin itse että N-Z1936 jakautui tsuhna- ja ugrihaaroihin jossain Kazanin ja Ufan tienoilla, Komi on selvästi liian pohjoisessa. Voihan tietysti olla että sinne tultiin Jäämereltä, mutta luulen että turvallisempi veikkaus on esim. Perm-Tumen-Omsk-tulosuunta. On kyllä tosiaan erikoista, miten erilaisiin suuntiin N joskus vuoden 4000 eaa jälkeen ajautui tai hakeutui, miten vain.
Avatar
Kinaporin kalifi
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 6925
Liittynyt: 14 Helmi 2011 19:18

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 16 Tammi 2021 14:36

KRA001:n ajoitus on 2336-2135 cal BCE. Se on ymmärtääkseni hyvälaatuinen genomi, joten on jännittävää nähdä, mihin se sijoittuu yfullissa, jonne se toivottavasti kohta ilmestyy. Tsuktsihaaran ja VL29:n edeltäjän, Y6058:n, TMRCA on 4700 vuotta. Pelkän tsuktsihaarankin (Y16323) ikä näyttäisi olevan melkein saman verran eli 4600 vuotta. Nämä kumpikin ovat kai mahdollisia. Ehkä todennäköisin lienee kuitenkin L1026/CTS6967, eli virolaispaperin mukainen N3a2'6. Z1936 näyttäisi olevan vain nippa nappa mahdollinen, koska sen ikä on 4100 vuotta.

Virolaispaperin mukaan N3a2'6-haploja tavataan aika isolla alueella:
karjalaiset, vepsäläiset
Arhangelin ja Pinegan venäläiset
latvialaiset liettualaiset
Belgorodin venäläiset
Krimin ja Volgan tataarit
karakalpakit
komipermjakit
hantit ja mansit
dolganit
Vilyun jakuutit, pohjoiset jakuutit
Aasian eskimot
nanait

Minusta on varsin mielenkiintoista, että jukagiiriyhteyskin alkaa muotoutua. Kyordyughen 1 N4b2 on N-M2126* jota näyttäisi olevan jukagiireilla edelleen.

Oma veikkaukseni on, että Siperiasta tulee löytymään paljon erilaisia N-linjoja, joista moni on sammunut. Hienoa, että meillä on nyt näytteitä idästä. Toivottavasti niitä saataisiin myös lännestä, koska eihän uralilaiskysymystä voi edes yrittää ratkaista pelkästään etänäytteillä.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 18 Tammi 2021 09:12

Onko kukaan yrittänyt mallintaa Ymyjahtah-miestä, N4b2:tä? Miten tämä mies suhtautuu KRA001:een ja Bolshoyn näytteisiin? Entä toisinpäin?

Miehen äitilinja on A12a2 (MH359223.1). N4a1-miehen äitilinja on A12a (MH359222.1). Toisaalta N4b2-mies on mtDNA-puussa kaksi kertaa, joten voi olla, että kummallakin on oikeasti sama äitilinja.

Tätä linjaa näyttäisi löytyvän juuri niiltä kansoilta, jotka kantavat myös N-haploja: Mezőkövesd Unkari, mansit, hantit, tundranenetsit; evenit, jakuutit, selkupit, evenkit, uiguurit. Lisäksi sitä on Puolassa.

Sama levikki näkyy myös muinaisdatassa:
Vikings Norway_Nord-Trondelag 548 Mid Nord-Trondelag Norway VK548 9th AD A12a,
Kushnarenkovo-Karayakupovo culture Chelyabinsk Bashkortostan Kurgan 30 grave 900–1000 AD Uyelgi7 A12a,
Hun Conq Levice-Géňa Slovakia Lev3.405B A12a,
Hun Conq Harta-Freifelt Hungary HAR9.60B A12a (16039A)
a

A12 on itsessään harvinainen, mutta sitä on löytynyt myös muinaisunkarilaiselta: http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_ ... uences.htm

Sitä näyttäisi olevan myös arolla ja Iranissa: Iran Qashqai, turkmeenit, kazakit;

Okunevostakin on löytynyt A12: Okunevo Khakassia Itkol’ II kurgan 14 kh17 A12 (189C 290T 319A 16362C)

Itse asiassa Andronovosta ja sen jälkeiseltä arolta on löytynyt paljon A-haploiksi analysoituja näytteitä, joissa on A12:lle ominainen mutaatio 16189:
LBA dairy pastoralists/ Deer Stone-Khirigsuur Complex Arbulag Soum Khövsgöl W Mongolia ARS016 1450 BC A (152+16362+16189),
Andronovo/Fedorovo BA Tartas TA7 Länsi-Siperia A* (+188 189 290 356 362),
Early Tagar Podgornovo Novaya chernaya-1 Khakassia TG38 900-600 BC A (183 189 290 319A 362),
Central Saka IA Taldy 2 Kurgan 5 Karkarali East Kazakhstan DA13 500 BC A (152+16362+16189),
Karakhanid Butakty 1 grave 34 Zharbulak River Kazakhstan DA204 1000 AD A (+152+16362+16189)
Viimeksi muokannut Kristiina päivämäärä 18 Tammi 2021 18:08, muokattu yhteensä 1 kerran
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Jaska » 18 Tammi 2021 16:58

A12 näyttää tosiaan edustavan selkeästi itäistä geenivirtaa. Lieneekö tullut Z1a1a:n ja D5a3a1a:n kanssa?
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 18 Tammi 2021 19:02

Ilmeisesti ei. Levikin perusteella näyttäisi siltä, että A12:lla on selkeä yhteys rautakautiseen Volgan itäpuoliseen seutuun, koska se esiintyy Bashkortostanin Uyelgin näytteissä ja sitä on kahdellakin muinaisunkarilaisella.

Bolshoysta näyttäisi sitä vastoin löytyvän sekä Z1a:ta että Z1a1a:ta, kuten myös saamelaisilta. Kyse lienee saamelaisperimästä. Linja on todennäköisesti ollut Fennoskandiassa kauemmin eli lähes 1500 BC lähtien.

Saamelaisten lisäksi D5a3a1a:ta on kai eniten Karjalassa. Ehkä tuokin on pikemminkin saamelaisperua. Sukukansoista sitä löytyy komipermjakeilta ja manseilta. Bolshoyn D ei ole kuitenkaan tuota samaa linjaa vaan D4e4 (ainakin näytteet BOO006/BOO72).

Eikä tuo A12:kaan ole harvinainen Siperiassa, vaikkei näytteitä olekaan juuri tullut Ian Loganin sivustolle tai yfullin äitilinjapuuhun. Linjaa näyttäisi löytyvän ainakin seuraavilta: Pamir, mm. kirgiisit; turkmeenit, kazakit; uiguurit; burjaatit; hakassit; ketit.

Iranilainen näyte on A23/A4h, joka on A12:n sisarlinja (A12'23). Tätäkin haploa näyttäisi löytyvän kutakuinkin samoilta kansoilta.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 22 Tammi 2021 22:34

Vertailin perjantai-illan iloksi Baikalin N-haplojen ja äsken virallisesti julkaistun Fatyanovo-paperin joidenkin näytteiden fenotyyppitietoja.

Vertailussa ovat mukana seuraavat aasialaiset näytteet ja pari poimintaa lähialueelta:
Early Neolithic Cis-Baikal Irkutsk Oblast Popovskij Lug 7035-6690 calBCE irk007 N1a2a-pre-CTS6380/M128
Late Neolithic SW Yakutia Kyordyughen 1 N4b2 2475-2295 calBCE N1a1a1a1a-M2126
EBA Krasnoyarsk Krai Kansk Nefteprovod-2 2336-2135 calBCE kra001 N1a1a1a1a-L1026*
Veretye Mesolithic Peschanitsa Arkhangelsk oblast 10785–10626 calBC PES001 R1a1bR1a5-YP1301
Fatyanovo LN Goluzinovo Yaroslavl oblast 2575–2349 calBC GOL001 R1a1a1-M417 (96% Yamnaya Kalmykia)
Tarand Graves Estonia Kunda Lääne-Viru 770-430 BC OLS10 N1a1a1a1a2a1a1-Z1926
Medieval Estonia Karja Saare id:IIa 1230-1300 AD N1a1a1a1a1a1a-L550/Z4917

Jälkimmäisen valitsin sen vuoksi, että hänen fenotyyppinsä arvioitiin taulukossa kutakuinkin kaikkein vaaleimmaksi.

On ilmeistä, että jälkimmäiset kolme kuuluvat samaan sarjaan, kun taas edelliset ovat tummemmassa sarjassa.

Erot PES001:n ja irk007:n, N4b2:n ja KRA001:n välillä.
Kaikilla Aasian N-haploilla on rs885479 A, joka tuottaa vaalean ihon ja tumman tukan yhdistelmää. PES001:llä on ASIP/PIGU G, joka voimistaa hiusten ruskeaa väriä. N4b2:lla on EXOC2 A, joka vaalentaa hiusten sävyä. KRA001:llä ja irk007:llä on SLC24A4 T, joka vaalentaa hiusten ja silmien väriä. Tuloksena voisi juuri olla sellaiset haaleat tummat värit kuin minulla.

Erot GOL001:n ja OLS10:n välillä: OLS10:llä on MC1R/rs2228479 A, joka liittyy punahiuksisuuteen, OLS10:llä on KITLG C, joka voimistaa vaaleahiuksisuutta. OLS10:llä on SLC24A4 G, joka ilmeisesti lisää vihreäsilmäisyyttä. OLS10:llä on HERC2 G, joka tekee silmistä siniset. GOL001:llä on ASIP/PIGU G, joka voimistaa hiusten ruskeaa väriä. GOL001:llä on SLC24A4 T, joka vaalentaa hiusten ja silmien väriä. Yllättävästi kaikilla on ilmeisesti TYR A, joka vähentää pisamaisuutta. Se on yleistynyt Euroopassa viime vuosituhansina.

Enkä takaa, että taulukossa kaikki tiedot ovat oikein. Taulukoita ei ole rakennettu samalla periaatteella, joten olen joutunut täydentämään tietoja. O/X tarkoittaa sitä, että taulukossa arvo on nolla, ja olen itse lisännyt perään alleelin.

Hirsiplex irk007 N4b2 KRA001 PES001 GOL001 OLS10 IIa
rs11547464_A 1G 6G 15G G G G G Suomalaiset 100% G
rs885479_T A 7A 11A G G G G Suomalaiset 80% G
rs1805008_T 1C 7C 12C C C C 1T Esim. puolalaiset 80% C
rs1805005_T 3G 4G 11G G G G G Suomalaiset 95% G
rs1805006_A 2C 7C 7C C C C C Suomalaiset 100% C
rs1805007_T - 5C 14C C C C C Suomalaiset 90% C
rs1805009_C 2G 3G 8G G G G G Suomalaiset 100% G
rs2228479_A 2G 6G 8G G G 1A 1A Suomalaiset 90% G
rs1110400_C - 6T 14T T T T T
rs28777_C 2C 2C 9C 2C 0/A 0/A 0/A Suomalaiset 90% A
rs16891982_C 4C 4C 8C 2C 0/G 0/G 0/G Suomalaiset 90% G
rs12821256_G 3T 1T 10T 0/T 0/T 1C 1C Suomalaiset 15% C
rs4959270_A 1C 5A/C 9C 1C 1C 1C 0/A Suomalaiset 60% C
rs12203592_T 5C 3C 19C 0/C 0/C 0/C 0/C Suomalaiset 90% C
rs1042602_T 1C 4C 9C C 1A 1A 2A Suomalaiset 80% C
rs1800407_A 3C 7C 7C 0/C 0/C 0/C 0/C Suomalaiset 95% C
rs2402130_G 3A 3G/A 11A 0/A 0/A 1G 0/A Suomalaiset 80-85% A
rs12913832_T 7A 3A 12A 2A 1A 0/G 0/G Suomalaiset 90% G
rs2378249_C 1A 2A 8A 1G 1G 0/A 0/A Suomalaiset 90% A
rs12896399_T 1T 1G 4G/T 0/G 1T 0/ G 2T Suomalaiset 55% T
rs1393350_T 2G 1G 19G 0/G 0/G 0/G 0/G Suomalaiset 25% A
rs683_G 1C 1C 12C 0/A 1A 1A 0/C Suomalaiset 60% A

Samassa järjestyksessä:
MC1R increase of red hair
MC1R dark hair + pale skin
MC1R red hair, pale skin
MC1R decrease of blond, increase of brown
MC1R decrease of blond, increase of brown
MC1R T increases red hair
MC1R red hair
MC1R A associated with red hair
MC1R Hair colour: blond/red
SLC45A2 Black vs. red hair; Skin colour: dark
SLC45A2 Eye colour: brown; Hair colour: black vs. non-black
KITLG increases blond hair
EXOC2 A increases blond hair
IRF4 C increases brown eyes; non-red hair, T increases freckles
TYR A associated with the absence of freckles
OCA2 T increases oculocutaneous albinism II
SLC24A4 Blue vs. green eyes
HERC2 GG-blue/AA-brown; Hair colour: non-red
ASIP/PIGU G increases brown hair
SLC24A4 T Lighter hair color & blue eyes more likely
TYR A Blue rather than green eyes
TYRP1 C increases brown hair
Viimeksi muokannut Kristiina päivämäärä 23 Tammi 2021 14:39, muokattu yhteensä 5 kertaa
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Kristiina » 22 Tammi 2021 23:00

En saanut taulukkoa pysymään helposti luettavana vaan siitä tuli väkisin tuollainen lukijaepäystävällinen.

Tässä vielä luonnehdinnat Fatyanovo-paperista:
PES001: ruskeat silmät, musta tukka, tumma tai hyvin tumma iho
GOL001: ruskeat silmät, musta tai tummanruskea tukka, vaaleahko tai vaalea iho
OLS10: siniset silmät, vaalea tukka, vaaleahko tai vaalea iho
IIa: siniset silmät, vaalea tukka, vaalea tai hyvin vaalea iho

Oma oletukseni Aasian N-haploista on, että niillä on ruskeat silmät, tumma tai tummahko tukka ja vaaleahko iho.
Viimeksi muokannut Kristiina päivämäärä 23 Tammi 2021 10:53, muokattu yhteensä 1 kerran
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kılınç: Human population dynamics and Y. pestis in NE As

ViestiKirjoittaja Jaska » 23 Tammi 2021 02:57

Kristiina kirjoitti:Ilmeisesti ei. Levikin perusteella näyttäisi siltä, että A12:lla on selkeä yhteys rautakautiseen Volgan itäpuoliseen seutuun, koska se esiintyy Bashkortostanin Uyelgin näytteissä ja sitä on kahdellakin muinaisunkarilaisella.

No jaa, mikä sitten on selkeä yhteys? Pitäisi tietää myös sen esiintyvyys väliin jäävällä alueella.

Kristiina kirjoitti:Bolshoysta näyttäisi sitä vastoin löytyvän sekä Z1a:ta että Z1a1a:ta, kuten myös saamelaisilta. Kyse lienee saamelaisperimästä. Linja on todennäköisesti ollut Fennoskandiassa kauemmin eli lähes 1500 BC lähtien.

Saamelaisten kaikki koko mtDNA:n tarkkuudella analysoidut näytteet ovat Z1a1a:ta, joten todennäköisesti myös epätarkemmat ovat samaa, vaikka Z1a:sta eteenpäin sijoittumisen voisi nähdä vain Coding regionin mutaatioista. Sama koskee myös BOO-näytteitä.

Z1a1a:lla on runsaasti "matalia" alatyyppejä Keski-Siperiasta Fennoskandiaan - myös Volgan reitillä. Se ei siis välttämättä ole levinnyt tänne yksinomaan pohjoista BOO-reittiä.
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Seuraava

Paluu Uutiset ja tutkimukset

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Ei rekisteröityneitä käyttäjiä ja 15 vierailijaa