Kokonaiskuva saamelaisten äitilinjoista

Alkuperää koskeva uutisointi ja uudet tutkimukset.

Re: Kokonaiskuva saamelaisten äitilinjoista

ViestiKirjoittaja Anskuq » 10 Helmi 2021 13:29

Jaska kirjoitti:
Anskuq kirjoitti:D5a3a1 puuttuu Ruotsin saamelaisilta ja Leväluhtasta kokonaan. Voidaanko olettaa, ettei tämä haploryhmä ole alkujaan ollut kantasaamelaisilla, vaan he saivat sen vasta Lapissa? Tuukkalan näytekin on vain vajaa tuhat vuotta vanha, voinut tulla sinne ihan mistä vain idästä, koska myös karjalaisilla sitä on.
Esimuotoa D5a3a1-II on löytynyt vain inarinsaamelaisista ja Altain–Etelä-Siperian alueelta ja sisarlinjaa vain karjalaisilta (Vienan karjalaiset?).

Noiden harvinaisten linjojen kohdalla on hyvin mahdollista, että niitä on viimeisten parintuhannen vuoden aikana kadonnut eri väestöistä, vaikka ne olisivat olleet läsnä kantasaamelaisissa. Toki on myös mahdollista, että aukkoinen levinneisyys johtuu niiden kantasaamea myöhemmästä leviämisestä.

Norjan- ja venäjänsaamelaisissa on kuitenkin kehittynyt ihan omat alatyyppinsä, joita ei löydy mistään muualta, joten kovin nuoresta leviämisestä ei voi olla kyse.

Samaa mieltä. Nämä äitilinjat ovat hankalia, koska iän arviointi on tosi hankalaa ja uusia markkereita syntyy niin vähän.
Esim. U5a2a1:ta löytyy paljon saamelaisista, leviksistä ja suomalaisista. Voi pitää aika varmana, että tämä halporyhmä oli jo kantasaamelaisilla.
edit:
Vai tarkoitatko ettei D5a3a1 voi olla Lapista, koska saamelaisilla on omia alatyyppejä tästä?
Anskuq
Kielevä karjalainen
Kielevä karjalainen
 
Viestit: 904
Liittynyt: 29 Elo 2015 19:08

Re: Kokonaiskuva saamelaisten äitilinjoista

ViestiKirjoittaja Kristiina » 10 Helmi 2021 14:24

U5a2a1:n osalta löytyy nämä:

BA Estonia Muuksi Harju X10 1220-1020 BC U5a2a1,
IA Finnics Kerstovo Ingria VII15 45-77 AD U5a2a1
Levänluhta Isokyrö Suomi JK1964/Levänluhta3 300-800 AD U5a2a1
Medieval Hungarian village cemetery Homokmégy-Székes/34 900-1100 AD HMSZper34 U5a2a1 (T372C 16284G),
Medieval Estonia Vaabina Võru IIIt 1250-1450 AD U5a2a1

Nämä eivät ole tietenkään ainoat muinaisnäytteet vaan niitä löytyy muualtakin Euroopasta ja Aasiasta.

HMSZper34: 73G 263G 750G 1438G 2706G 3197C 4769G 7028T 9477A 11467G 11719A 12308G 12372A 13617C 13827G 13928C 14766T 14793G 15326G 16114A 16192T 16256T 16270T 16294T 16526A + 372C 8856A 10101C 14470C 16284G

Unkarilaisten näyte voi olla lähellä tätä venäläistä haplotyyppiä: GU122993(Russia) Malyarchuk

Toisaalta tätä lähinnä näyttäisi olevan suomalainen haplotyyppi: MF497507(Finland-leukaemia) Jarviaho

Kummaltakin puuttuu T152C ja kummallakin on 372C ja 10101C, joita ei ole millään muualla Ian Loganin sivuston U5a2a1-näytteellä.

http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_ ... uences.htm

Saamelaisten ja suomalaisten oma haplotyypppi on U5a2a1a-16271. Sitä ei ole muinaisaineistossa löytynyt muualta kuin Tuukkalasta.
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Kokonaiskuva saamelaisten äitilinjoista

ViestiKirjoittaja Jaska » 10 Helmi 2021 22:59

Anskuq kirjoitti:
Jaska kirjoitti:
Anskuq kirjoitti:D5a3a1 puuttuu Ruotsin saamelaisilta ja Leväluhtasta kokonaan. Voidaanko olettaa, ettei tämä haploryhmä ole alkujaan ollut kantasaamelaisilla, vaan he saivat sen vasta Lapissa? Tuukkalan näytekin on vain vajaa tuhat vuotta vanha, voinut tulla sinne ihan mistä vain idästä, koska myös karjalaisilla sitä on.
Esimuotoa D5a3a1-II on löytynyt vain inarinsaamelaisista ja Altain–Etelä-Siperian alueelta ja sisarlinjaa vain karjalaisilta (Vienan karjalaiset?).

Noiden harvinaisten linjojen kohdalla on hyvin mahdollista, että niitä on viimeisten parintuhannen vuoden aikana kadonnut eri väestöistä, vaikka ne olisivat olleet läsnä kantasaamelaisissa. Toki on myös mahdollista, että aukkoinen levinneisyys johtuu niiden kantasaamea myöhemmästä leviämisestä.

Norjan- ja venäjänsaamelaisissa on kuitenkin kehittynyt ihan omat alatyyppinsä, joita ei löydy mistään muualta, joten kovin nuoresta leviämisestä ei voi olla kyse.

Samaa mieltä. Nämä äitilinjat ovat hankalia, koska iän arviointi on tosi hankalaa ja uusia markkereita syntyy niin vähän.
Esim. U5a2a1:ta löytyy paljon saamelaisista, leviksistä ja suomalaisista. Voi pitää aika varmana, että tämä halporyhmä oli jo kantasaamelaisilla.
edit:
Vai tarkoitatko ettei D5a3a1 voi olla Lapista, koska saamelaisilla on omia alatyyppejä tästä?

Voisi se periytyä myös jo Lapin aiemmalta väestöltä. Tosin BOO:ssa ei ollut sitä vaan D4:ää, jota taas ei ole nykysaamelaisilla. Toivottavasti muinais-DNA:sta tarttuisi haaviin näitä harvinaisempia haploryhmiä, niin saataisiin varmuus siitä, missä ne viimeistään olivat mihinkin aikaan.
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Kokonaiskuva saamelaisten äitilinjoista

ViestiKirjoittaja Lri » 17 Syys 2021 08:13

Jaska kirjoitti: "Muinais-DNA:ssa U5b1b1a ilmestyykin näkyviin ensi kertaa neoliittisen kivikauden Liettuassa (Mittnik et al. 2018), ja seuraavan kerran vasta noin 4000 vuotta myöhemmin keskirautakauden Etelä-Pohjanmaalla (Lamnidis et al. 2018) ja viikinkiajan Skandinaviassa (Krzewińska et al. 2015)."

Kuukausi sitten julkaistussa paperissa Freilich et al. 2021 on nyt mukana noin 4000 vuotta vanha kroatialainen näyte, jonka luokitus on U5b1b1a:

Koodi: Valitse kaikki
$ tab()(awk '{if(NF>m)m=NF;for(i=1;i<=NF;i++){a[NR][i]=$i;l=length($i);if(l>b[i])b[i]=l}}END{for(h in a){for(i=1;i<=m;i++)printf("%-"(b[i]+n)"s",a[h][i]);print""}}' n=${2-1} FS="${1-$'\t'}")
$ curl https://haplogroup.info/all-ancient-dna.txt|iconv -f iso-8859-1 -t utf-8|(read;echo "$REPLY";grep U5b1b1a|sort -t$'\t' -nk48)|cut -f1,3,4,5,8,28,40,45,48,54,55,57|tab
Object-ID  Latitude   Longitude  Sex mtDNA-haplogroup Y-Simple SNPs    Source                    Mean  Label                 Location                                              Country
Kretuonas4 55.259995  26.098001  F   U5b1b1a                   1006360 MittnikNatCommun2018      -4200 Lithuania_EMN_Narva   "Kretuonas 1B, Lithuania"                             Lithuania
JAG78      45.338767  18.698861  M   U5b1b1a          G2a2a1a2 922257  FreilichSciRep2021        -1700 Croatia_Jag_MBA       "Jagodnjak-Krcevine, Osijek"                          Croatia
JK1963     62.948744  22.410146  U   U5b1b1a1                  17839   SikoraNature2019          550   Finland_Levanluhta    Levänluhta                                            Finland
JK1966     62.948744  22.410146      U5b1b1a1a                         ÖverstiSciRep2019         550                         Levänluhta5                                           Finland
JK1967     62.948744  22.410146  U   U5b1b1a                   8970    ÖverstiSciRep2019         550   Finland_Levanluhta_lc Levänluhta6                                           Finland
JK1969     62.948744  22.410146      U5b1b1a1b                         ÖverstiSciRep2019         550                         Levänluhta8                                           Finland
VK518      67.69      12.7       F   U5b1b1a                   392793  MargaryanNature2020       850   Norway_Viking_o1.SG   Nor_North                                             Norway
VK355      56.2847285 16.409356  M   U5b1b1a          L2       780272  MargaryanNature2020       853   Sweden_Viking.SG      Oland                                                 Sweden
VK129      65.79      -17.34     M   U5b1b1a          R1aS4458 1112668 MargaryanNature2020       950   Iceland_Viking.SG     Ingiridarstadir                                       Iceland
IBEper135  48.133333  21.716667      U5b1b1a                           MaárbioRxiv2021           1008                        "Ibrány-Esbóhalom, Szabolcs-Szatmár-Bereg County"     Hungary
TU651      61.7192469 26.5754661     U5b1b1a                           ÖverstiSciRep2019         1300                        Tuukkala15                                            Finland
LP172mt    54.762914  11.5320777     U5b1b1a                           KlunkAmJPhysAnthropol2019 1350                        "Refshale, Maribo, Lolland"                           Denmark
CHV001     67.1675    37.5864    F   U5b1b1a3                  696242  LamnidisNatCommun2018     1800  Russia_Chalmny_Varre  "Chalmny Varre cemetery, Ponoy River, Kola Peninsula" Russia


Jaska myös kirjoitti, että norjalaisilla oli vain yksi U5b1b1a-näyte viikinkiajalta. Mutta jos se tarkoittaa näytettä VK518, niin se ei varmaan ole etninen norjalainen, koska se on G25:ssä nykyisten saamelaisten keskiarvoa itäisempi. Malli kaikilla nykyväestöillä:

VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518 (.023):
61% Saami
22% Khanty
9% Mari
3% Nganassan
2% Lithuanian_PZ
2% Mixe
1% Eskimo_Sireniki

Malli lähteillä levis ja BOO:

VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518 (.029):
61% FIN_Levanluhta_IA
39% RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov
Lri
Mettänpeikko
Mettänpeikko
 
Viestit: 323
Liittynyt: 09 Maalis 2019 15:01

Re: Kokonaiskuva saamelaisten äitilinjoista

ViestiKirjoittaja Jaska » 17 Syys 2021 11:58

Kiitos, mielenkiintoista.
Olisikohan vielä viikinkiaikana saamelaistuminen/sekoittuminen voinut olla vielä siinä määrin keskeneräinen prosessi, että noin itäisiä ihmisiä saattoi löytyä esim. Kuolasta tai muualta Lapista? Tämä voisi viitata siihen, että saamelaisten kielentuojien mukana olisi levinnyt vähemmän siperialaisperimää (alle 25 %), kun taas paleolappilaisilla olisi vielä ollut enemmän siperialaisperimää (yli 25 %).
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Kokonaiskuva saamelaisten äitilinjoista

ViestiKirjoittaja Lri » 17 Syys 2021 14:39

Jaska kirjoitti:Kiitos, mielenkiintoista.
Olisikohan vielä viikinkiaikana saamelaistuminen/sekoittuminen voinut olla vielä siinä määrin keskeneräinen prosessi, että noin itäisiä ihmisiä saattoi löytyä esim. Kuolasta tai muualta Lapista? Tämä voisi viitata siihen, että saamelaisten kielentuojien mukana olisi levinnyt vähemmän siperialaisperimää (alle 25 %), kun taas paleolappilaisilla olisi vielä ollut enemmän siperialaisperimää (yli 25 %).


No yhdelle levikselle (JK1963/DA238) tulee G25:ssa suunnilleen yhtä paljon BOO:ta kuin sille VK518:lle:

FIN_Levanluhta_IA_o:JK2065 (.191): 100% FIN_Levanluhta_IA
FIN_Levanluhta_IA:DA234 (.038): 100% FIN_Levanluhta_IA
FIN_Levanluhta_IA:DA238 (.031): 62% FIN_Levanluhta_IA + 38% RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov
FIN_Levanluhta_IA:JK1968 (.033): 100% FIN_Levanluhta_IA
FIN_Levanluhta_IA:JK1970 (.026): 95% FIN_Levanluhta_IA + 5% RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov
VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518 (.029): 61% FIN_Levanluhta_IA + 39% RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov

Tai kun lähteisiin laittaa kaikki modernit väestöt:

FIN_Levanluhta_IA:DA238 (.031): 78% Saami + 8% Nganassan + 7% Mansi + 3% Mari + 3% Surui + 0% Ju_hoan_North + 0% Papuan

Se sama levis ei isotooppianalyysin mukaan tykännyt meriruoasta (Sikora et al. 2018, https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2018/10/22/448829.DC1/448829-1.pdf):

> In summary, the 87Sr/86Sr data suggest, that individual JK1963/DA238 was probably a local relying on terrestrial foodstuffs, while individuals JK1968/DA234 and JK2067/DA237 might well have been locals incorporating a component of Baltic sea resources in their diet. Individual JA2065/DA236 could have been of foreign origin, or a local using almost exclusively Baltic Sea dietary items.

Tai sitten tässä on tehty kaksisuuntaisia G25-malleja kra001:n ja virolaisten yhdistelmänä, ja toisessa sarakkeessa näkyy kra001:n prosenttiosuus:

$ printf %s\\n ais\ 1UrhcfNMLW0oMXIbHGUE60v2taCM7PFw1 aas\ 1F2rKEVtu8nWSm7qFhxPU6UESQNsmA-sl mis\ 1HYrDwxEXv82DvDLoq736pS5ZTGJA4dn5 mas\ 1wZr-UOve0KUKo_Qbgeo27m-CQncZWb8y|while read l m;do curl "https://drive.google.com/uc?export=download&id=$m" -Lso $l;done
$ way2()(awk -F, 'NR==1{for(i=2;i<=NF;i++)a[i]=$i}NR==2{for(i=2;i<=NF;i++)b[i]=$i}NR>2&&$1!=""{min=-1;for(r=0;r<=100;r+=1){s=0;for(i=2;i<=NF;i++)s+= ($i-((1-r/100)*a[i]+(r/100)*b[i]))^2;s=s^.5;if(min==-1||s<min){min=s;minr=r}}minp=sprintf("%.3f",min);sub("^0","",minp);print minp,minr,$1}' "$@")
$ way2 <(grep Estonian mas;grep Yarsk_BA aas) <(egrep 'Levanluhta|VA_o|Bolshoy' aas;grep Saami mis)|sort -nk2
.081 0 FIN_Levanluhta_IA_o:JK2065
.026 9 VK2020_SWE_Gotland_VA_o:VK56
.022 12 Saami_Kola:SaamiKola49
.030 14 Saami_Kola:SaamiKola7
.030 15 Saami_Kola:SaamiKola47
.043 15 VK2020_NOR_North_VA_o2:VK519
.042 18 Saami_Kola:SaamiKola74
.045 21 Saami_Kola:SaamiKola5
.034 22 FIN_Levanluhta_IA:DA234
.037 22 Saami:Saami001
.051 22 Saami:saami4
.037 23 Saami_Kola:SaamiKola40
.038 23 Saami_Kola:SaamiKola25
.046 23 Saami_Kola:SaamiKola6
.046 24 FIN_Levanluhta_IA:JK1968
.046 24 Saami:saami6
.042 25 Saami:GS000035026
.044 25 Saami:saami12
.045 26 Saami:saami3
.048 26 Saami:saami13
.050 26 Saami:saami9
.046 27 Saami:saami8
.048 27 Saami:saami14
.050 27 Saami:saami5
.057 27 Saami:saami7
.039 28 Saami:saami1
.046 29 FIN_Levanluhta_IA:JK1970
.048 30 Saami:saami11
.049 30 Saami:GS000035025
.049 31 Saami:saami2
.059 35 FIN_Levanluhta_IA:DA238
.055 36 VK2020_NOR_North_VA_o1:VK518
.098 44 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov:BOO003
.106 45 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov:BOO005
.100 46 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov:BOO002
.104 46 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov:BOO004
.098 48 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov:BOO001
.085 57 RUS_Bolshoy_Oleni_Ostrov_o:BOO006

Postasin muutama kuukautta sitten kahden komponentin ADMIXTURE-ajon, jossa itäisen komponentin osuus oli 35% ja 39% kahdella saamelaisnäytteellä, 36% VK518:lla, ja 33% JK1963:lla, eli siis yhdellä saamelaisella oli vielä enemmän itäistä perimää kuin sillä pohjoisnorjalaisella outlierilla: http://muinainensuomi.foorumi.eu/viewtopic.php?p=60978#p60978. Tulosten poikkeaminen G25:stä johtui ehkä siitä, että siinä ei käytetty projektiota, vaikka ADMIXTURE:n kanssa kuuluisi varmaan projektoida muinaisnäytteet. Kun kokeilin nyt tehdä niin, että tein ensin ADMIXTURE-ajon moderneilla näytteillä, ja projektoin siihen sen jälkeen muinaiset näytteet, niin lopputulos oli paljon lähempänä G25:ta. Otin ajoon nyt mukaan myös Tambets 2018:n saamelaiset, ja niistä eniten itäisille näytteille tuli 29% itäistä komponenttia. JK1963:lle tuli 34% ja VK518:lle tuli 35%.

3 Hungarian (n=20)
4 Estonian (n=10)
7 Finnish (n=8)
7 Finnish.DG (n=1)
8 Tambets_Estonians (n=32)
8 Mordovian (n=32)
8 Karelian (n=15)
8 Tambets_Russians_Central (n=2)
9 Norway_Viking_o2.SG:VK530.SG
9 Veps (n=10)
17 Russia_Mezhovskaya.SG:RISE523.SG
19 Russia_HG_Karelia:I0061
20 Saami.DG:S_Saami-1.DG
20 Tambets_Tatars (n=2)
20 Saami.WGA:SD60_297
21 Russia_HG_Karelia:I0211
21 Russia_Mezhovskaya.SG:RISE525.SG
21 Besermyan (n=6)
23 Tambets_Saami_SWE:saami4
23 Finland_Levanluhta:JK1968
23 Tambets_Saami_SWE:saami12
24 Tambets_Saami_SWE:saami6
24 Russia_Chalmny_Varre:CHV001.A0101
24 Udmurt (n=10)
25 Tambets_Saami_SWE:saami14
25 Russia_Chalmny_Varre:CHV002.A0101
25 Russia_Mezhovskaya.SG:RISE524.SG
25 Tambets_Saami_SWE:saami3
25 Tambets_Saami_SWE:saami9
26 Saami.DG:S_Saami-2.DG
26 Tambets_Saami_SWE:saami7
27 Tambets_Saami_SWE:saami8
27 Tambets_Saami_SWE:saami13
28 Tambets_Saami_SWE:saami1
28 Finland_Levanluhta:JK1970
29 Tambets_Saami_SWE:saami11
29 Tambets_Saami_SWE:saami5
29 Tambets_Saami_SWE:saami2
34 Finland_Levanluhta:JK1963
35 Norway_Viking_o1.SG:VK518.SG
39 Russia_Bolshoy:BOO002.A0101
40 Russia_Bolshoy:BOO005.A0101
41 Russia_Bolshoy:BOO004.A0101
42 Russia_Bolshoy:BOO001.A0101
42 Russia_Bolshoy:BOO003.A0101
46 Mansi (n=8)
48 Russia_Bolshoy:BOO006.A0101
49 Tambets_Khanty (n=10)
59 Selkup (n=24)
70 Enets (n=3)
95 Nganasan (n=33)

Ei kannata luottaa liikaa tällaisiin amatöörien ajoihin eikä G25-kokeiluihin. Noiden Tambetsin näytteiden yhdistämisessä oli jotain häikkää, mistä voi johtua se, että Tambetsin virolaisille ja keskivenäläisille tuli 8% itäistä komponenttia.
Lri
Mettänpeikko
Mettänpeikko
 
Viestit: 323
Liittynyt: 09 Maalis 2019 15:01

Edellinen

Paluu Uutiset ja tutkimukset

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Bing [Bot] ja 14 vierailijaa