Assessing Finnish Y-chromosomal haplogroups using genotyping

Alkuperää koskeva uutisointi ja uudet tutkimukset.

Assessing Finnish Y-chromosomal haplogroups using genotyping

ViestiKirjoittaja Kristiina » 15 Syys 2021 19:04

Toukokuussa 2021 on julkaistu Annina Preusnerin hieno pro gradu -tutkielma: Assessing Finnish Y-chromosomal haplogroups using genotyping array data : towards understanding the role of Y in complex disease

Mitään yllätyksiä tutkimuksesta ei haploryhmäjaon osalta ilmene. Aikaisempiin tutkimuksiin verrattuna aineisto on kuitenkin omaa luokkaansa, joten tilastollinen luotettavuus lienee huippuluokkaa. Haploryhmäjako löytyy sekä 33 001 miehen että 24 160 miehen otokselle. Niiden kesken ei ole juurikaan eroa.

Tässä on tuon jälkimmäisen otoksen haploryhmäjako:

N1c1 60,18 %
I1 26,44 %
R1a1 5,99 %
R1b 5,01 %
I2 0,97 %
E1b1 0,51 %

Kuvassa 7 (Fig 7) Suomi on jaettu kahtia Länsi-Suomeen ja Itä-Suomeen. Odotetusti N1c1 nousee idässä, eli lännessä osuus on 53,8 % ja idässä 71,6 %. Muiden haploryhmien osuus kasvaa lännessä yksittäisten haploryhmien osalta noin 50-100 %, eli esim. R1b:n osuus kasvaa 3,1 prosentista 6,1 prosenttiin.

Tutkimuksesta käyvät ilmi myös kahden aiemman tutkimuksen luvut N1c1:n ja I1:n osalta. Tutkimukset ovat Lappalainen et al. 2006 ja Neuvonen et al. 2015. Ero Lappalaisen tutkimukseen, jonka N1c1-otos on 312 miestä, on pieni. Tässä uudessa tutkimuksessa N1c1-otos on peräti 14 397 miestä. N1c1:n osuus on Lappalaisella 58,2, eli Lappalaisen tutkimuksessa on todennäköisesti enemmän näytteitä lännestä. Sitä vastoin erot Neuvosen tutkimukseen ovat merkittäviä. Neuvosen N1c1-otos on 289 miestä ja prosenttiosuus 49,5.

Jos halutaan viitata suomalaisten miesten haploryhmäjakaumaan, tämä uusi tutkimus lienee paras referenssi. Alueellista jakautumaa selitetään seuraavasti:

"Sample frequencies were calculated within each of the 18 Finnish regions (N = 23 074), excluding samples from abroad and ceded Karelia. The sample frequencies of each birth region were compared with the population structure of Finland from 2019 (https://www.tilastokeskus.fi/tup/suoluk ... y%20region 10.1.2021) to infer the representativeness of different regions in Finland in the data. The correlation between the distribution of samples in the dataset and the regional distribution of the Finnish population (Pearson r = 0.94; 95% CI = 0.85-0.98; p = 2.5x10-9) implied that the dataset comprehensively represented Finland."

https://helda.helsinki.fi/handle/10138/ ... tribute=fi
Kristiina
SuuBaltti
SuuBaltti
 
Viestit: 1368
Liittynyt: 18 Maalis 2015 12:24

Re: Assessing Finnish Y-chromosomal haplogroups using genoty

ViestiKirjoittaja Jaska » 16 Syys 2021 00:29

Kiitos, Kristiina!
Onpa todella laaja otos.
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02


Paluu Uutiset ja tutkimukset

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Bing [Bot], Kinaporin kalifi ja 15 vierailijaa