Mattila et al. 2023: Stone Age Central and Eastern Europe

[merimaa]

Mattila, T.M., Svensson, E.M., Juras, A. et al. (2023)
Genetic continuity, isolation, and gene flow in Stone Age Central and Eastern Europe
Communications Biology 6, 793.
https://www.nature.com/articles/s42003-023-05131-3

Tutkimuksessa havaitaan geneettinen jatkumo välillä WHG - EHG - Afontova Gora 3.

"One of the most striking findings was that before the dawn of the European Neolithic, Central and Eastern Europe was inhabited by a population that descends from a gradient admixture population between genetically distinct West European and Siberian hunter-gatherer groups. Such a pattern suggests long distance population genetic connectivity, likely via a stepping-stone admixture model."

Admixture-kuva lisämateriaalin sivulla 47 näyttää sekoitussuhteet virolaisille, mordvalaisille, tšuvasseille, selkupeille, nganasaneille ja eskimoille. Vähän yllättäen vanhimmat eurooppalaiset näytteet, kuten Sungir ja Goyet, ottavat jonkin verran nganasan-perimää ja nuoremmat, kuten EHG, eskimo-perimää. Mitä siitä ajattelette?

[Kinaporin kalifi]

Vähän yllättäen vanhimmat eurooppalaiset näytteet, kuten Sungir ja Goyet, ottavat jonkin verran nganasan-perimää ja nuoremmat, kuten EHG, eskimo-perimää. Mitä siitä ajattelette?

Ehkä asetelma vain ylittää Admixturen kyvyt. Toisaalta, eikö arktiselle alueelle, Baikal-järveä sivuten, pitänytkin ulottua jonkinlainen ANE-jatkumo eli oikeastaan nganasanissa olisi vähän ANE-perimää, eikä päinvastoin jne.

[merimaa]

Voisiko olla kyse siitä, että Euroopan varhaisten asuttajien perimässä näkyy vielä jälkiä eurooppalaisten ja aasialaisten yhteisistä esivanhemmista? Esimerkiksi aiemmin tänä vuonna julkaistussa tutkimuksessa kerrottiin eurooppalaisista muinaisnäytteistä, jotka jakavat perimää aasialaisen Tianyuanin näytteen kanssa.

ks. sivu 15: Traces of Early Asian ancestry
https://static-content.springer.com/esm ... M1_ESM.pdf

[Kinaporin kalifi]

Voisiko olla kyse siitä, että Euroopan varhaisten asuttajien perimässä näkyy vielä jälkiä eurooppalaisten ja aasialaisten yhteisistä esivanhemmista? Esimerkiksi aiemmin tänä vuonna julkaistussa tutkimuksessa kerrottiin eurooppalaisista muinaisnäytteistä, jotka jakavat perimää aasialaisen Tianyuanin näytteen kanssa.

ks. sivu 15: Traces of Early Asian ancestry
https://static-content.springer.com/esm ... M1_ESM.pdf

En nyt jaksa alkaa kahlaamaan tutkimuksia läpi, mutta eikö asian ratkaise se onko esim. nganasanin rinnalla muitakin siperialaisnäytteitä? Jos nekin jakavat, kyseessä voisi olla yhteinen perimä. Jos ei, jokin muu selitys voi olla parempi, esim. menetelmän ongelma, väärä kausaliteetti l. anakronismi tjsp.

Joka tapauksessa, esim. Jeong et al: "Nganasans have high genetic affinity with prehistoric individuals with the ANE
ancestry in North Eurasia, such as the Upper Palaeolithic Siberians or the Mesolithic eastern European hunter-gatherers (EHG), which is exceeded only by Native Americans and by Beringians among Eastern Eurasians (Supplementary Fig. 7)."

Tässä taitaa olla kyseessä samantapainen tilanne kuin muinoin Rekonpojan todetessa että nganasanin sovittaminen suomalaisiin Admixturen avulla perustuu menetelmän puutteelliseen ymmärrykseen. Globetrotter osoittaa että kyseessä on pikemminkin evenki, ilman omaa itsenäistä ANE-perimää, joka tulee kuvaan mukaan vasta jossain matkalla kohti Eurooppaa.

[Kristiina]

Pribislav postasi äsken GenArchivistiin (https://genarchivist.freeforums.net/thr ... enrichment) analyysin yhdestä vanhimmista TAT-haploista eli näytteestä, joka sisältyy Three assays for in-solution enrichment of ancient human DNA at more than a million SNPs -tutkimukseen:
I1961 - Around Baikal, sometime after 4500BC N1a1a1a1a A10a1

Paper: genome.cshlp.org/content/32/11-12/2068.full.pdf+html
Supplementary material: genome.cshlp.org/content/32/11-12/2068/suppl/DC1
BAM files: http://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB54983

Pribislavin mukaan kyseessä on N-TAT>F1419>L708>Z4863>Y9023* (xY9022)

Linja on N-Y9022:n ja N-Z4863:n välissä: https://www.yfull.com/tree/N-Z4863/

Miehen genomia voi analysoida:
teepean47 posted genotype data: drive.google.com/drive/folders/14_eFTmhZ10j-1RkoG9TvXoHl2BPztQD5
Zelto posted G25 coordinates: drive.google.com/file/d/1qyViFiNx6ONvQs80RQ2RqTS8ArXpRtmX/view

Jos jotakuta kiinnostaa, olisi kiva saada tästä tyypistä PC-kuvaa tai sekoitusanalyysia. Y9022 on sentään uralilaisilla esiintyvä haplotyyppi. Se on siis sikäli uralilaisille relevantimpi linja kuin Ir1:n N2 tai Kiinan neoliittinen N1b-F2905 tai jopa Taka-Baikalin haplot.

[Kinaporin kalifi]

Distance to: S1961
0.03329701 RUS_Ust_Ida_LN:DA342__BC_3667__Cov_74.05%
0.03334445 RUS_Baikal_MA:I7781__AD_1335__Cov_22.68%
0.03374079 RUS_Lena_River_N:irk030__BC_4019__Cov_99.68%
0.03428859 RUS_Lena_River_N:irk017__BC_3182__Cov_74.95%
0.03450930 MNG_Center_West_LBA_4:I6262__BC_1320__Cov_70.42%
0.03542432 RUS_Ust_Ida_LN:DA345__BC_3504__Cov_55.14%
0.03622831 MNG_Munkhkhairkhan_MBA_1:I12955__BC_1874__Cov_73.83%
0.03647196 MNG_Munkhkhairkhan_MBA_1:I6348__BC_1682__Cov_83.70%
0.03707904 RUS_Ust_Belaya:I7336__BC_4305__Cov_53.00%
0.03802543 RUS_Ust_Ida_LN:DA355__BC_3519__Cov_23.51%
0.03814975 RUS_Baikal_BA:STB001__BC_2654__Cov_73.83%
0.03850035 RUS_Ust_Ida_EBA:DA343__BC_2869__Cov_38.84%
0.03861130 RUS_Lake_Baikal_N:irk071__BC_3182__Cov_87.97%
0.03890370 RUS_Lena_River_N:mak026__BC_2809__Cov_27.85%
0.03902528 MNG_Center_West_LBA_4:I13767__BC_1248__Cov_71.56%
0.04025280 MNG_Khovsgol_BA:ARS016__BC_1439__Cov_81.80%
0.04067214 RUS_Ust_Belaya_Angara:I20760__BC_4305__Cov_53.00%
0.04104527 RUS_Angara_River_N:irk033__BC_2908__Cov_33.92%
0.04153009 CHN_Songshugou_BA3:C3343__BC_3002__Cov_99.03%
0.04164475 RUS_Ust_Ida_LN:DA344__BC_3645__Cov_15.00%
0.04169773 MNG_BA:I12973__BC_1276__Cov_74.15%
0.04319379 MNG_Khovsgol_BA:ARS002__BC_1105__Cov_48.36%
0.04410358 RUS_Ust_Ida_EBA:DA361__BC_2180__Cov_36.92%
0.04468227 RUS_Angara_River_BA:irk050__BC_2400__Cov_8.33%
0.04471782 RUS_Angara_River_N:irk034__BC_3575__Cov_96.96%

Target: S1961
Distance: 0.8259% / 0.00825886
26.6 RUS_Lena_River_BA
20.6 RUS_Angara_River_BA
14.6 MNG_Early_Xiongnu_rest
5.6 RUS_Ust_Belaya
4.8 RUS_Lena_River_N
4.2 KAZ_Botai
4.0 USA_San_Catalina_Island
3.6 RUS_Karelia_HG
3.4 RUS_Kurma_EBA
3.2 MNG_Early_Med_Uigur
2.8 CHN_Tarim_EMBA1
2.4 CHN_Yinwang_500BP
1.6 RUS_Sosonivoy_HG
1.4 Baltic_LVA_MN
0.8 RUS_Yakutia_Ymyiakhtakh_LN
0.4 RUS_Lake_Baikal_BA

... ja PCA-kuvassa ryhmittyy modernien tuvalaisten viereen, ks. https://en.wikipedia.org/wiki/Tuvans.

[Kinaporin kalifi]

Vs. modernit:

Distance to: S1961
0.07014793 Mogush:MOG7
0.07333553 Mogush:MOG32
0.07460396 Tuvinian:841_R01C02
0.07665359 Mogush:MOG18
0.07703829 Tuvinian:841_R01C01
0.07803632 Tuvinian:841_R02C01
0.07805368 Mogush:MOG29
0.07865075 Mogush:MOG33
0.07932852 Mogush:MOG6
0.08023238 Khakass:Khs-302
0.08041123 Tuvinian:840_R01C01
0.08084073 Khakass_Kachins:Khs-402
0.08104388 Khakass_Kachins:Khs-424
0.08205654 Mogush:MOG9
0.08225672 Tuvinian:840_R02C02
0.08234066 Tuvinian:839_R01C01
0.08251909 Tuvinian:840_R02C01
0.08259602 Mogush:MOG12
0.08267833 Mogush:MOG4
0.08272958 Mogush:MOG11
0.08314557 Mogush:MOG3
0.08342084 Tuvinian:839_R02C02
0.08452606 Khakass:Khs-308
0.08457973 Mogush:MOG10
0.08580018 Todzin:TUV-121

Target: S1961
Distance: 3.4997% / 0.03499724
32.6 Todzin
19.6 Tuvinian
14.6 Shor_Mountain
10.8 Ket
8.4 Amerindian_North
7.2 Tibetan_Shigatse
4.2 Mixe
2.6 Negidal

Re Mogush: "Genetically, the Daurs are descendants of the Khitan, as recent DNA analyses have proven.[3] In the Qianlong Emperor's "钦定《辽金元三史语解》" (Imperially commissioned Translations of the History of Liao, History of Jin and History of Yuan) he retranslates "大贺", a Khitan clan described in the History of Liao, as "达呼尔". That is the earliest theory that claims Daurs are descendants of Khitans.

In the 17th century, some or all of the Daurs lived along the Shilka, upper Amur, on the Zeya and Bureya River. They thus gave their name to the region of Dauria, also called Transbaikal, now the area of Russia east of Lake Baikal."

https://en.wikipedia.org/wiki/Daur_people

[Kristiina]

Ei tuosta Wikipedian Daur-artikkelista löydy Mogusheista mitään. Sitä vastoin tämä etnonyymi esiintyy altailaisten kansojen luettelosta:

others are present in Northern Asia, in Siberia, in the
Altai mountains, and the Mongolian steppe (e.g. Altai-Kizhi, Mogush, Ondar, Telengit, Tubalars,
Buryats, Khakas, Shores or Mongolians)

Secondly, samples from populations belonging to the Altaian groups Mogush and Ondar
were genotyped on the OmniExpress-Exome v1.2 at Aros Applied Biotechnology A/S, Aarhus,
Denmark.

Lähde: https://static-content.springer.com/esm ... M1_ESM.pdf

Luulen, että nuo Mogushit ovat samoja kuin Altain tuvalainen Mongush-klaani: https://www.researchgate.net/publicatio ... _of_Tuvans
Yllä olevan tutkimuksen mukaan niillä on noin 40 % N-haploja (N-P43:a ja TAT-haploja).

[Kinaporin kalifi]

Ei tuosta Wikipedian Daur-artikkelista löydy Mogusheista mitään. Sitä vastoin tämä etnonyymi esiintyy altailaisten kansojen luettelosta:

others are present in Northern Asia, in Siberia, in the
Altai mountains, and the Mongolian steppe (e.g. Altai-Kizhi, Mogush, Ondar, Telengit, Tubalars,
Buryats, Khakas, Shores or Mongolians)

Secondly, samples from populations belonging to the Altaian groups Mogush and Ondar
were genotyped on the OmniExpress-Exome v1.2 at Aros Applied Biotechnology A/S, Aarhus,
Denmark.

Lähde: https://static-content.springer.com/esm ... M1_ESM.pdf

Luulen, että nuo Mogushit ovat samoja kuin Altain tuvalainen Mongush-klaani: https://www.researchgate.net/publicatio ... _of_Tuvans
Yllä olevan tutkimuksen mukaan niillä on noin 40 % N-haploja (N-P43:a ja TAT-haploja).

Kyllä, olet aivan oikeassa. Mogushit ovat ilmeisesti juuri tuo suhteellisesti mongoleja lähinnä oleva tuvalaisklaani, mutta eivät siis itse esim. daureja.

[Kristiina]

Tuossa isälinjapaperissa tehdään seuraavat johtopäätökset Mongushien suhteesta mongolivalloittajiin:

It could be therefore assumed that Tuvinian clans Mongush
and Oorzhak originated from autochtonous people
(supposedly, from the local Samoyed and Kets substrata). The
minor component of Central Asian haplogroups in the gene
pool of these clans allowed to suppose that Mongol expansion
did not have a significant influence upon the Tuvinan gene
pool at a whole.

However, genetic relation
of the Mongush clan to Mongolian populations is slightly
closer revealing somewhat stronger influence of their southern
neighbors. Though the case in point is rather a weak trace
of Central Asian genetic ancestry.

Nevertheless the source of a weak “Central Asian” genetic
ancestry is, the performed study unambiguously indicates
that the main part of gene pools of Tuvinian clans confidently
being associated by ethnographers with the Mongol expansion
is inherited from the autochtonous population of the Altai-
Sayan highlands. Predominance of “North Eurasian” Q, N1a2
and N3a haplogroups allows to assume that Tuvinian gene
pool was formed on the basis of Samoyed and Kets tribes
having inhabited the territory of present-day Tyva since the
Neolithic (6000–3000 BC). The conclusion about rather low
proportion of East Eurasian haplogroups within the gene pools
of the Mongush and Oorzhak Tuvinian clans, referring to a
later and less significant genetic layer, correlates well with
the anthropological data, which consider the South Siberian
component of Tuvinian ethnogenesis as an earlier and more
relevant in comparison with the South Central Asian one
(Aksyanova, 2009). It must be emphasized that genetic and
anthropological data betoken only the biological trace of
migrations, their demographic intensity and contribution to
the gene pool. They say nothing about the intensity of cultural
influence,which is the field of ethnographic and historical
estimation.

[Kinaporin kalifi]

Miksi kra001 ei näy tässä N-näytteessä, jos kyse on Baikalin alueesta ja ajoituskin ilmeisesti on edes oikean suuntainen? Liikaa jotain ANE-pohjaista?

[Jaska]

Tuossa isälinjapaperissa tehdään seuraavat johtopäätökset Mongushien suhteesta mongolivalloittajiin:

Predominance of “North Eurasian” Q, N1a2
and N3a haplogroups allows to assume that Tuvinian gene
pool was formed on the basis of Samoyed and Kets tribes
having inhabited the territory of present-day Tyva since the
Neolithic (6000–3000 BC).

Uskomatonta, että tuollaisia heittoja vielä esiintyy. Kivikaudella ei vielä ollut samojedeja eikä ketejä olemassakaan. Olisi kannattanut puhua vain alueen aiemmista väestöistä lätkimättä niiden päälle virheellisiä nimilappuja.

[Kristiina]

Tämä heppu liikkui Baikalin etupuolella. Näyte on löydetty Irkutskin alueelta ja ajoitus on 4316-3997 calBCE eli noin 1500 vuotta ennen kra001:tä. Äitilinja A10a on peräisin Länsi-Siperiasta. Tämä Y9023*-mies edustaa autosomaalisesti Etu-Baikalin Glazkovoa ja sillä on ANEa tai WSHG:tä. Uskaltaisin jopa veikata, että tämän miehen sekä äitilinja että isälinja on lähtöisin Länsi-Siperian suunnalta, eikä ollut alueella ennen Glazkovoa. Toinen vaihtoehto tietysti on, että isälinja oli alueella jo neoliittisella kaudella, mutta muuttui autosomaalisesti Glazkovon kulttuurin myötä, kun geenivirta lännestä lisääntyi. kra001 edustaa aivan muuta ajankohtaa ja kulttuuria ja liittyy jollain tavalla Ymjahtahiin, mihin tätä heppu ei selvästikään mitenkään liity.

Näyte on autosomaalisesti lähimpänä seuraavia:
Baikal LN Ust Ida Russia UID_1989.022/ DA342 4880 BP R1b1 (äitilinja)
Ust'-Belaya medieval Ust’-Belaya II Angara river I7781 Mos118 670-560 calBP C4a'b'c
Neolithic Cis-Baikal (Glazkovo) Korkino Irkutsk Oblast 4150-3950 calBC irk030/ MH359201.1 A10a1/ A10a1b (yfull), Q1b1a3a*-BZ180 (yfull)
Bronze Age Cis-Baikal (Glazkovo) MakarovoIrkutsk Oblast irk017 3335-3210 cal BCE D4j5a/ D4j5a1* (yfull)
Mongolia LBA CenterWest Bayankhongor aimag Khar Sairiin am 1396-1231 calBCE I6262 A8a1 (WSHG 27%)

Minusta on oikein mukavaa, että N-miesten autosomaalisessa perimässä on vaihtelua. Tämä mies ei selvästikään tullut arktiselta alueelta tai Amurista, eikä kuulu samaan porukkaan kuin Ymjahtah-miehet.

[Kristiina]

Pilinpenko on oikein julkaissut artikkelin A10-äitilinjasta: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4423966/

Hän teki tällaisia loppupäätelmiä:

In the light of our ancient DNA data, we suggest that the mtDNA haplogroup A10 is an autochthonous component of the gene pool of West Siberian indigenous populations, and that this component underwent a long evolution in West Siberia before the arrival in the region of genetically contrasting western Eurasian and eastern Eurasian groups.

A10-linjan esiintyminen nykyväestöissä käy ilmi seuraavasta kuvasta:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articl ... 7182.g003/

Kuvassa ovat hyvin edustettuna itäisemmät uralilaiset ryhmät ja pari muuta pohjoisen Euraasian väestöä, joilla on tunnetusti paljon N-linjoja, kuten baskiirit, tataarit, tsuvassit, dolganit ja Krasnojarskin evenkit.

[merimaa]

Vahaduo olikin yllättävän helppo ottaa käyttöön, joten kokeilin mallintaan sillä tuota näytettä I1961. Tein aivan mielivaltaisia mallinnuksia, joissa lähdin liikkeelle Baikalin näytteistä ja yritin sen jälkeen parantaa sovitusta lisäämällä itäistä, läntistä ja/tai arktista perimää. Näitä ei kannata ottaa liian vakavasti.

Koodi: Valitse kaikki

Target: I1961:S1961
Distance: 2.1235% / 0.02123506
56.8   Russia_LenaRiver_N.SG
39.2   Russia_UstIda_LN.SG
4.0   China_AmurRiver_N

Target: I1961:S1961
Distance: 2.1487% / 0.02148666 | R3P
53.6   Russia_LenaRiver_N.SG
41.0   Russia_UstIda_LN.SG
5.4   Mongolia_Arkhangai_PreBronze

Target: I1961:S1961
Distance: 1.9790% / 0.01978969 | R3P
84.2   Russia_LenaRiver_N.SG
10.0   China_AmurRiver_N
5.8   Kazakhstan_Mereke_MBA

Target: I1961:S1961
Distance: 1.8821% / 0.01882082 | R3P
80.2   Russia_LenaRiver_N.SG
11.6   China_AmurRiver_N
8.2   Kazakhstan_Dali_EBA

Target: I1961:S1961
Distance: 1.8079% / 0.01807936 | R3P
62.6   Russia_LenaRiver_N.SG
25.4   Mongolia_North_N
12.0   Kazakhstan_Botai_Eneolithic.SG

Target: I1961:S1961
Distance: 1.7372% / 0.01737205 | R3P
58.2   Russia_LenaRiver_N.SG
28.8   Mongolia_North_N
13.0   Russia_Tyumen_HG

Target: I1961:S1961
Distance: 1.8534% / 0.01853364
43.8   Russia_LenaRiver_N.SG
29.6   Russia_UstIda_LN.SG
26.6   China_Xinjiang_Songshugou_BA_Afanasievo

Target: I1961:S1961
Distance: 1.8209% / 0.01820856 | R3P
61.8   Russia_LenaRiver_N.SG
33.8   China_Xinjiang_Songshugou_BA_Afanasievo
4.4   Kazakhstan_Dali_EBA


Tämän jälkeen Baikalilta on mukana myös pronssikautisia näytteitä
*****************************************************************

Target: 1:S1961
Distance: 1.5879% / 0.01587893
70.2   Russia_UstBelaya_Angara.SG
15.2   China_AmurRiver_N
14.6   Russia_Tyumen_HG

Target: 1:S1961
Distance: 1.5751% / 0.01575106 | R3P
46.2   Russia_Shamanka_Eneolithic.SG
34.2   Russia_LenaRiver_BA.SG
19.6   Russia_Tyumen_HG

Target: 1:S1961
Distance: 1.4982% / 0.01498249
33.8   Russia_Shamanka_Eneolithic.SG
25.2   Russia_Siberia_Lena_EBA
24.2   Russia_UstBelaya_Angara.SG
16.8   Russia_Tyumen_HG

Target: 1:S1961
Distance: 1.4246% / 0.01424625 | R4P
42.6   Russia_Shamanka_Eneolithic.SG
35.0   Russia_LenaRiver_BA.SG
17.2   Russia_Tyumen_HG
5.2   USA_Alaska_TrailCreek_9000BP.SG

Target: 1:S1961
Distance: 1.3774% / 0.01377360 | R5P
23.8   Russia_LenaRiver_BA.SG
23.0   Mongolia_North_N
20.6   Russia_UstBelaya_Angara.SG
17.0   Russia_Buryatia_M.SG
15.6   Russia_Tyumen_HG

Target: 1:S1961
Distance: 1.3337% / 0.01333720 | R5P
38.6   Russia_UstBelaya_Angara.SG
21.0   Russia_LenaRiver_BA.SG
14.0   Russia_Tyumen_HG
13.6   China_AmurRiver_N
12.8   Russia_Buryatia_M.SG


Huomasin, että jos laittaa liikaa läntistä perimää (esim. Länsi-Siperian metsästäjä), malli tasapainottaa sitä ottamalla lisää itäistä perimää (esim. Kiinan Amurin metsästäjä).

[merimaa]

Miksi kra001 ei näy tässä N-näytteessä, jos kyse on Baikalin alueesta ja ajoituskin ilmeisesti on edes oikean suuntainen? Liikaa jotain ANE-pohjaista?

Kun kokeilin erilaisia malleja, huomasin, että kra001 tai Jakutian näytteet eivät tuo niihin oikein mitään lisäarvoa. En kyllä osaa sanoa miksi.

[Kinaporin kalifi]

Miksi kra001 ei näy tässä N-näytteessä, jos kyse on Baikalin alueesta ja ajoituskin ilmeisesti on edes oikean suuntainen? Liikaa jotain ANE-pohjaista?

Kun kokeilin erilaisia malleja, huomasin, että kra001 tai Jakutian näytteet eivät tuo niihin oikein mitään lisäarvoa. En kyllä osaa sanoa miksi.

Jos oikein muistan, Baikalin länsipuolen perimä on lähempänä ANE-pohjaista arktista inkkaria, ml. vanhempi Lena-joen alue, kuin perimä järven itäpuolella. Uralinpuhujiin liittyvä typillinen itäinen perimä on minun ymmärtääkseni taas lähinnä yhdistelmä tätä vanhempaa Lena-tyypin perimää ja Taka-Baikalin muinaiselta Amurilta periytyvää, aidosti itäista pohjoista Aasiaa.

[Kristiina]

Jos verrataan nykykansoja, voidaan tehdä ainakin seuraavia päätelmiä:
-kaikilla uralilaisilla on yhteistä pohjoista siperiaa, mutta nganasan-perimä poikkeaa kuitenkin selvästi länsisiperialaisesta perimästä, jota on muilla uralilaisilla kuin nganasaneilla
-tsuvasseilla, baskiireilla ja tataareilla on enemmän mongolaa (=Amur) kuin pohjoista siperiaa, mutta niillä turkkilaisilla, joilla on paljon N-haploja, on myös enemmän pohjoista siperiaa
-mongoleilla on yhtä paljon kiinalaista kuin Mongolaa, mikä on ymmärrettävää, kun ajatellaan heidän sijaintia ja asemaa Silkkitiellä

Lähde: Showing 1/13: S1_Fig.pdf
https://journals.plos.org/plosgenetics/ ... en.1005068

[merimaa]

Yritin käyttää nykyajan näytteistä nganasania tämän I1961:n mallintamiseen, mutta se toimi huonosti.

[Kinaporin kalifi]

Jos verrataan nykykansoja, voidaan tehdä ainakin seuraavia päätelmiä:
-kaikilla uralilaisilla on yhteistä pohjoista siperiaa, mutta nganasan-perimä poikkeaa kuitenkin selvästi länsisiperialaisesta perimästä, jota on muilla uralilaisilla kuin nganasaneilla
-tsuvasseilla, baskiireilla ja tataareilla on enemmän mongolaa (=Amur) kuin pohjoista siperiaa, mutta niillä turkkilaisilla, joilla on paljon N-haploja, on myös enemmän pohjoista siperiaa
-mongoleilla on yhtä paljon kiinalaista kuin Mongolaa, mikä on ymmärrettävää, kun ajatellaan heidän sijaintia ja asemaa Silkkitiellä

Lähde: Showing 1/13: S1_Fig.pdf
https://journals.plos.org/plosgenetics/ ... en.1005068

Allentoft et al terminologian pohjalta uralilaisilla ei ilmeisesti ole yhteistä neoliittista länsisiperialaista perimää, ainoastaan pohjoista itäaasiaa. Toisaalta, jonkun verran jotain Glazkovon oloista on kuitenkin ilmeisesti mukana kra001-tyypin perimässä, joten.

EDIT eli siis:

right = c('Congo_Mbuti.DG', 'Anatolia_Barcin_N.SG', 'Italy_GrottaContinenza_HG.SG', 'RUS_Arkhangelsk_HG.SG', 'Botai.SG', 'Tarim_EMBA1', 'Andaman_100BP.SG', 'Jomon.SG', 'RUS_Irkutsk_Shamanka_EN.SG', 'RUS_Primorsky_DevilsCave_N.SG', 'Mongolia_KutagOndor_N', 'RUS_Irkutsk_AngaraRiver_LN.SG', 'RUS_Krasnoyarsk_Bazaikha_EBA', 'RUS_ZabayKalsk_ArgunRiver_Meso.SG', 'RUS_Buryatia_Meso.SG', 'RUS_Yakutia_KolymaRiver_Meso.SG', 'Peru_RioUncallane_1800BP.SG')
allsnps=TRUE

RUS_Krasnoyarsk_Nefteprovod_BA.SG
RUS_Yakutia_MN.SG 0.514001 0.0518357 9.91597
RUS_ZabayKalsk_KadalinkaRiver_N.SG 0.485999 0.0518357 9.37576
Tail: 0.52