Kinaporin kalifi kirjoitti:En nyt jaksa kaivaa kuvausta esille, mutta jos muistan oikein niin jakson pituutta ei analyysissä juuri rajattu. Mutta, niin tai näin, en juuri nyt keksi miksi tutkimus on rakennettu niin kuin se on rakennettu. Komponenttien valinta vaikuttaa näytevetoiselta, "man tager vad man haver" kuten vanhassa keittokirjassa, johtaen anakronismeihin ja yleiseen sekavuuteen.
Tarkoitat varmaan tätä kohtaa liitetiedostossa Supplementary Notes 2-7, sivulla 45:
”For IBD Mixture Modelling we calculated total shared IBD lengths as in S6.2, but with a minimal cut off of 1 cM per segment, and no lower limit on the total shared length. We undertook mixture modelling (Hofmanová et al., 2016) on the total shared IBD lengths as described in (Allentoft, Sikora, Refoyo-Martínez, et al., 2024), starting with the well-established diverse ancestries across Eurasia and adding more proximal sources (Table S4). These results were plotted as ‘ADMIXTURE’ style bar charts faceted by regions and country
(Figure S6.3.1.1), by IBD Cluster (Figure S6.3.1.2) and on the Western Eurasian PCA (Figure S6.3.1.3).”
IBD-jaksojen minimipituus (1 cM) on käsittääkseni lyhyt, joten se voi tietysti vaikuttaa tuloksiin. En osaa arvioida, millä tavalla, mutta yleisesti ottaen lyhyet IBD-jaksot voivat periytyä kauempaa menneisyydestä kuin pitkät.
Jos mallinnukset kuitenkin tehdään IBD-jaksojen kokonaismäärän perusteella samalla tavalla kuin aiemmassa tutkimuksessa (Allentoft et al. 2024), voisin kuvitella, että joillekin näytteille kasaantuu enemmän esimerkiksi England/France EMBA -perimän jaksoja kuin toisille, jolloin malleista voisi tehdä päätelmiä näytteiden eroista.
Eri ikäisten referenssinäytteiden sekoittaminen samaan malliin lisää tietysti sekavuutta. Se voi silti olla tarpeen siksi, että kaikilta nuorakeraamisen kulttuurin leviämisalueilta ei ole vielä olemassa näytteitä. Esimerkiksi Valko-Venäjältä ei ole yhtään näytettä, eikä Ukrainastakaan taida olla montaa sopivanikäistä.
”Admixture-style bar charts” viittaa tässä vain kuvien esitystapaan, ei mallinnusmenetelmään.
