Sivu 1/1

Eurooppalaisten kolme perustajaväestöä

ViestiLähetetty: 24 Joulu 2013 12:08
Kirjoittaja Sigfrid
Jaettu ketjusta "Tuloksia eri projekteista":
viewtopic.php?f=10&t=106&start=520

-----------


Näyttää varsin samanlaiselta suomalaisten ja ympäristön osalta kuin omat PCA:ni PDT_Armataz_01_20 Tuo suomalaisten ketjumaisuus johtuu suomalaisten näytteiden keskinäisistä eroista, joka taas on geneettistä ajautumaa.

http://3.bp.blogspot.com/-fc2W-6tR-HA/U ... europe.png

Dienekez blog http://dienekes.blogspot.fi/2013/12/eur ... ithic.html

Hyvää Joulua forumisteille!

Re: Tuloksia eri projekteista

ViestiLähetetty: 24 Joulu 2013 12:48
Kirjoittaja Rekonpoika
Tuon tutkimuksen mukaan näyttää siltä että pohjoisvenäläisten ja mordvalaisten itäinen perimä on reilusti nuorempaa kuin suomalaisten. Tarkoittanee, että pohjoisvenäläiset eivät ole saaneet siperia-admixiaan itämerensuomalaisesta populaatiosta.

There may in fact be multiple layers of Siberian gene flow into northeastern Europe after the initial ANE gene flow, as our analyses
reported in SI 12 show that some Mordovians, Russians and Chuvash have Siberian-related admixture that is significantly more recent than that in Finns(SI12).
...
Finally, we used ALDER to investigate whether a linkage disequilibrium signal of recent admixture exists in Northeastern Europe using the Han as a reference and found a significant (Z>3) curve for three populations (for Finnish, Z=1.27, while we could not use this method on asingle Saami individual).

East Eurasian admixture (%) Time
Lower bound (%) std. error Generations std. error
Chuvash 11.7 1.7 62.5 11.0
Mordovian 6.7 1.3 69.8 16.9
Russian 5.7 0.4 52.3 5.8


Hyvää joulua kaikille :)

Re: Tuloksia eri projekteista

ViestiLähetetty: 24 Joulu 2013 13:12
Kirjoittaja Sigfrid
Tuo asetelma itämerensuomalaisten ja pohjoisvenäläisten kesken on perusteltavissa maantieteellä ja historialla.

Re: Tuloksia eri projekteista

ViestiLähetetty: 24 Joulu 2013 17:37
Kirjoittaja Sigfrid
I haplo muinaisessa Motalassa: Suplemetary information ss. 27-33

http://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/1312/1312.6639.pdf

Re: Tuloksia eri projekteista

ViestiLähetetty: 25 Joulu 2013 12:34
Kirjoittaja Kinaporin kalifi
Rekonpoika kirjoitti:Tuon tutkimuksen mukaan näyttää siltä että pohjoisvenäläisten ja mordvalaisten itäinen perimä on reilusti nuorempaa kuin suomalaisten. Tarkoittanee, että pohjoisvenäläiset eivät ole saaneet siperia-admixiaan itämerensuomalaisesta populaatiosta.

There may in fact be multiple layers of Siberian gene flow into northeastern Europe after the initial ANE gene flow, as our analyses reported in SI 12 show that some Mordovians, Russians and Chuvash have Siberian-related admixture that is significantly more recent than that in Finns(SI12).
...
Finally, we used ALDER to investigate whether a linkage disequilibrium signal of recent admixture exists in Northeastern Europe using the Han as a reference and found a significant (Z>3) curve for three populations (for Finnish, Z=1.27, while we could not use this method on asingle Saami individual).

East Eurasian admixture (%) Time
Lower bound (%) std. error Generations std. error
Chuvash 11.7 1.7 62.5 11.0
Mordovian 6.7 1.3 69.8 16.9
Russian 5.7 0.4 52.3 5.8



Toisaalta, tutkimus toteaa näin (Extended Data Figure 7: Evidence for Siberian gene flow into far northeastern Europe.): "Some northeastern European populations (Chuvash, Finnish, Russian, Mordovian, Saami) share more alleles with Han Chinese than with other Europeans who are arrayed in a cline from Stuttgart to Lithuanians/Estonians in a plot of f (Test, BedouinB; Han, Mbuti) against f 4 (Test, BedouinB; MA1, Mbuti)."

Jos oikein ymmärsin, tutkimuksen eri kohdissa näitä ryhmiä yhdistävä taustaryhmä on Han, nimenomaan Kauko-Itään liittyvän geenipoolin vuoksi. Tämä kaukainen vaikutusaalto on mesoliittista kivikautta nuorempi:

"K=11 reveals a Siberian component, which is maximized in the Nganasan. Siberians previously
showed mixed membership in the Native American and East Asian components, consistent with the
idea that present-day Siberians have been formed by admixture with East Asians. The near absence of
the Siberian component in ancient hunter-gatherers contrasts with its presence at low levels in
present-day Northeastern Europeans, consistent with more recent Siberian influences in that part of
Europe. A Chipewyan-maximized North American component also appears; this re-appears at K=13
and persists thereafter."

En kuitenkaan ymmärrä Z-käyrän merkitystä, tarkoittavatko luvut sitä että esim. mordvalaisten Han-viritteinen geenilisä ajoittuu jonnekin 500-luvun vaiheille?

I-haplo näyttää asuneen Skandinaviassa jo mesoliittisella kivikaudella:

"Our finding that Loschbour and all four Motala males whose haplogroups we could determine belong
to Y-haplogroup I is not entirely unexpected, as this clade of the human Y-chromosome phylogeny is
found almost exclusively in Europe, with much rarer occurrences elsewhere."

Re: Tuloksia eri projekteista

ViestiLähetetty: 25 Joulu 2013 13:12
Kirjoittaja Pesservisser
Tämä olisi kai 1.kerta, kun korostetaan itäaasialaista vaikutusta. Aiemmin sekä DNA Tribes että Dienekes ovat puhuneet Amerind-vaikutuksesta. Se olisi luonnollinen Altain ja Jenisein populaatioiden vaikutus. Han-vaikutus on monet kerrat erikseen todettu olemattomaksi.
Yhteiset alleelit-havainto voisi olla seurausta siitäkin, että N1 esiintyy myös Kiinan alueella liki 10% osuudella, eli yhteisyyden mekanismi olisi erisuuntainen.
Volgalla itäiset vaikutukset liittyvät turkkilaiskansojen invaasioihin, ja bolgaarien saapuminen oli suunnilleen 500-luvulla. Turkkilaisten mukana tuli itäisiä mtDNA-ryhmiä, joita sitten on myös Vienanmeren ja Varanginvuonon rannoilla.

Muuten tämä tutkimuslinkki keskusteluineen kuuluisi tutkimukset-kohtaan, jossa jatkuva keskustelukin pysyisi koossa.

Re: Tuloksia eri projekteista

ViestiLähetetty: 25 Joulu 2013 13:32
Kirjoittaja Sigfrid
Nganassanit eivät suinkaan ole puhtaita siperialaisia, vaikkakin puhtaimpia. Heillä on huomattava osio eurooppalaista ädmiksiä, joka ei kuitenkaan näy relatiivisessa ädmiks-analyysissä. Ralatiivisuudella tarkoitan sitä, että analyysin ääripäät saavat arvon 100% riippumatta todellisesta samankaltaisuudesta.

Re: Tuloksia eri projekteista

ViestiLähetetty: 25 Joulu 2013 14:08
Kirjoittaja Rekonpoika
Pesservisser kirjoitti:Tämä olisi kai 1.kerta, kun korostetaan itäaasialaista vaikutusta. Aiemmin sekä DNA Tribes että Dienekes ovat puhuneet Amerind-vaikutuksesta. Se olisi luonnollinen Altain ja Jenisein populaatioiden vaikutus. Han-vaikutus on monet kerrat erikseen todettu olemattomaksi.


Johtunee siitä, että verrokkina eivät ole intiaanit ja kiinalaiset vaan 24 000-vuotias Mal'ta-siperialainen ja kiinalaiset. "Puhtaimmissa" Karitiana-intiaaneissakin on jo sen verran itäaasialaista perimää että vertailuissa se kattaa itäeurooppalaisten siperia-admixin, Mal'tan tapauksessa näin ei ole.

Re: Eurooppalaisten kolme perustajaväestöä

ViestiLähetetty: 28 Joulu 2013 18:49
Kirjoittaja Pesservisser
Siperian löytöjen taustaa on selostettu artikkeleissa

http://www.pasthorizonspr.com/index.php ... -malta-boy

http://www.sciencedaily.com/releases/20 ... 133925.htm

http://www.sciencedaily.com/releases/20 ... 151606.htm

http://www.sciencedaily.com/releases/20 ... 123655.htm

Mukana oli esineistöä, kuten Venus-veistos jota on pidetty eurooppalaisena.
Kun jääkausi peitti pahimmin Eurooppaa ja eteni alk. 26 000 vuotta sitten, olisi pako Euroopasta Siperiaan ollut ymmärrettävää.
Tässä oletetaan sekoittumisen itäaasialaisiin tapahtuneen idempänä. Aiemmin on toisaalta arvioitu intiaanien Q-tyypin lähteneen Altailta noihin aikoihin.
Siperiassa sopii toki vaeltamaan sekä lännessä että idässä. Jääkausi silti puristi tilan ahtaaksi pohjoisen jään ja Altai-Sayan vuorten välissä.
Altain eteläpuolella oli ehkä viihtyisämpää.

Re: Eurooppalaisten kolme perustajaväestöä

ViestiLähetetty: 06 Tammi 2014 15:34
Kirjoittaja Pesservisser
DNA Tribes on tehnyt perusteellisen tarkastelun aiheesta omilla menetelmillään, historiallisia ja arkeologisia tietoja yhdistäen.
Siperialla näyttää olleen yhteyksiä jopa Kaakkois-Aasiaan ja Intian niemimaalle.
Ns. uralilaiset väestöt yhdistetään Sejma-Turbinon ilmiöön, jonka sanotaan ulottuneen Suomen alueelle asti. Spekulaatiota on myös yhteydestä dravida-kieliin.

http://www.dnatribes.com/dnatribes-dige ... -01-03.pdf

Re: Eurooppalaisten kolme perustajaväestöä

ViestiLähetetty: 06 Tammi 2014 20:26
Kirjoittaja Pertinax
Varhaisten eurooppalaisten geeniperimän perusteella Eurooppa oli noin 7000-8000 vuotta sitten sulatusuuni, jossa yhdistyivät Afrikasta kulkeneiden metsästäjäkeräilijöiden, Lähi-idästä saapuneiden maanviljelijöiden ja siperialaisen ”mysteerikansan” perimät.

Geenitutkijoiden tuoreista tutkimushavainnoista kertoo Nature. Johtopäätökset perustuvat useisiin vielä julkaisemattomiin tutkimuksiin, joissa on tarkasteltu noin 8000 vuotta sitten eläneiden luxemburgilaisten ja ruotsalaisten metsästäjien, 7500 vuotta sitten eläneen saksalaisnaisen sekä noin 7000 vuotta sitten eläneen espanjalaisen geeniperimää.

Osoittautui, että geenit kertoivat kantajistaan ristiriitaisia tietoja. Esimerkiksi Luxemburgissa ja Espanjassa asuneet metsästäjäkansan jäsenet olivat todennäköisesti tummaihoisia, mutta sinisilmäisiä. Oletetusta elämäntavastaan huolimatta heitä yhdisti saksalaiseen maanviljelijänaiseen syljeneritykseen liittyvä geenimuutos, joka liitetään tavallisesti viljaperäiseen ruokavalioon.
http://www.uusisuomi.fi/tiede-ja-ympari ... -odottanut

http://www.nature.com/news/ancient-euro ... ry-1.14456