Näytä vastaamattomat viestit | Näytä aktiiviset viestiketjut Tänään on 19 Marras 2017 17:07



Vastaa viestiin  [ 1 viesti ] 
 PAST 
Kirjoittaja Viesti
Ylihärmiö
Ylihärmiö
Avatar

Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02
Viestit: 6577
Viesti PAST
PAST on helppokäyttöinen, koodaustaitoa vaatimaton ohjelma, jolla saa tuotettua esimerkiksi sukupuita (Multivar > Cluster), MDS-kuvia (Multivar > non-metric MDS) ja prinsipaalikomponenttianalyyseja (Multivar > PCA).

Excel-taulukosta voi liittää taulukon suoraan PASTiin kopioi & liitä -toiminnoilla. Lisäksi tajusin juuri, että ohjelmaan voi kopioida rivi kerrallaan esim. Y-haplotyyppejä samoin Excel-taulukosta, ja niistä saa sitten puita ja kuvaajia. Testin perusteella tulokset ovat oikeita. HUOM! Oletuksena on vain 26 saraketta, mutta se kasvaa automaattisesti jos kopioi pitkän haplotyypin; myös Edit-valikosta saa lisää sarakkeita.

Jos kyseessä on matriisitaulukko, jossa riveillä ja sarakkeilla ovat samat henkilöt, valitaan parametriksi "User similarity"; jos sarakkeilla on eri muuttujia (esim. DYS-arvoja) kuin riveillä (henkilöt), valitaan yleensä "Gower".

Ohjelma:
http://folk.uio.no/ohammer/past/

Käyttöopas:
http://folk.uio.no/ohammer/past/past.pdf

Täällä ovat nämä Esan ryhmittelemät haplotyyppitaulukot muutamille Y-haploryhmille: jokainen löytyy lähiosumiensa kanssa samasta ryhmästä, joten siitä vain penkomaan omaa polveutumista:
http://www.sukujutut.fi/dna/index.htm

_________________
"Jokainen elämä on uusi laiffi." (Nykäsestä sovittanut Häkkinen)

Y-DNA: N1c1 (Mikael Häkkinen, s. 1728 Nurmes)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä, s. 1757 Kittilä)


16 Loka 2012 17:50
Profiili WWW
Näytä viestit ajalta:  Järjestä  
Vastaa viestiin   [ 1 viesti ] 

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Ei rekisteröityneitä käyttäjiä ja 2 vierailijaa


Et voi kirjoittaa uusia viestejä
Et voi vastata viestiketjuihin
Et voi muokata omia viestejäsi
Et voi poistaa omia viestejäsi

Etsi tätä:
Hyppää:  
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group.
Designed by STSoftware.
Käännös, Lurttinen, www.phpbbsuomi.com uncommitted-decoy