Uusia haploryhmiä ja alahaploryhmiä Y-kromosomiin

Alkuperää koskeva uutisointi ja uudet tutkimukset.

Uusia haploryhmiä ja alahaploryhmiä Y-kromosomiin

ViestiKirjoittaja Jaska » 27 Marras 2013 13:55

Y-haploryhmiin uudistuksia:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/earl ... 1.full.pdf

Mielenkiintoista on, että yhdeltä Intian tamililta (telugu) löytyi upouusi haploryhmä X, joka on sukua NO:lle.

Myös N1c1:n loppupäähän kerrotaan löytyneen uusia mutaatioita, mutta jutussa ei ole sukupuuta niiden osalta. Supporting information B:stä löytyy ASCII-puu:
http://biorxiv.org/content/early/2013/1 ... gures-only

Valitettavasti löytyy vain HG-numerot eikä haplotyyppejä mistään tai edes mutaatioiden nimiä, joten pitää jäädä odottamaan. Mutta näyttäisi siis löytyvän rinnakkainen haara Z1940:lle karjalaisesta ryhmästä, jos oikein ASCII-puuta tulkitsin ISOGGin puuhun verraten...
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Uusia haploryhmiä ja alahaploryhmiä Y-kromosomiin

ViestiKirjoittaja Kirmu » 28 Marras 2013 09:21

Tuolta löytyy sukupuu, jossa snp:t. Selviääkö tästäkään vielä mitään tarkennusta.
Yläkulman download PDF http://arxiv.org/abs/1310.6590

Kuva
http://i40.tinypic.com/opp6s7.jpg
Niilo, Iivari, Jasmine ja Ulrika
Kirmu
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen
 
Viestit: 162
Liittynyt: 17 Tammi 2013 08:08

Re: Uusia haploryhmiä ja alahaploryhmiä Y-kromosomiin

ViestiKirjoittaja Jaska » 28 Marras 2013 14:04

Kirmu kirjoitti:Tuolta löytyy sukupuu, jossa snp:t. Selviääkö tästäkään vielä mitään tarkennusta.
Yläkulman download PDF http://arxiv.org/abs/1310.6590

http://i40.tinypic.com/opp6s7.jpg

Kiitos erittäin paljon!
Oudolta kyllä näyttää, jos tuon mukaan Z1941 olisi ihan eri oksassa kuin Z1940, vaikka ne satavarmasti ovat peräkkäin samassa linjassa. Joko kyseessä on koneellisen vertailun tuottama virhe, tai sitten näytteiden perässä ei jostain syystä mainita kuin sattumanvarainen otos mutaatioista.
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02

Re: Uusia haploryhmiä ja alahaploryhmiä Y-kromosomiin

ViestiKirjoittaja Kirmu » 28 Marras 2013 20:00

Puusta saattaa puuttua olelliset arvot. Hg-numeroiden tietoja tarjolla, mutta vaikea selkoista. Odotellaan tarkennuksia.
Niilo, Iivari, Jasmine ja Ulrika
Kirmu
Pohtiva pohjalainen
Pohtiva pohjalainen
 
Viestit: 162
Liittynyt: 17 Tammi 2013 08:08

Re: Uusia haploryhmiä ja alahaploryhmiä Y-kromosomiin

ViestiKirjoittaja Jola » 30 Marras 2013 19:52

Hei. Vaikutti siltä, että em. puussa oli paljon toistoa, esim. Z1925 ja Z1935 monessa haarassa? Toisaalta siitä puuttui Z1927.
Jola
YDNA: N-BY30452 Pre-Savo (YFullin mukaan N-YP6269), mtDNA: H45a. Juuret pääosin Savosta ja Kainuusta
Jola
Sutki savolainen
Sutki savolainen
 
Viestit: 502
Liittynyt: 16 Helmi 2011 21:58
Paikkakunta: Tampere

Re: Uusia haploryhmiä ja alahaploryhmiä Y-kromosomiin

ViestiKirjoittaja Jaska » 30 Marras 2013 22:13

Jola kirjoitti:Hei. Vaikutti siltä, että em. puussa oli paljon toistoa, esim. Z1925 ja Z1935 monessa haarassa? Toisaalta siitä puuttui Z1927.

Niinpä. Aivan omituinen luokittelu, jos noita mutaatioita katsoo. En ymmärrä, mikä logiikka on taustalla. Pessimistille tulisi heti mieleen, että ohjelmaan on ajettu haplotyypit ja katsottu miten ne ryhmittyvät, viis SNP-mutaatioista, jolloin samaakin mutaatiota tavataan eri haaroista muttei kaikilta. Mutta toivon ettei ole kyse kuitenkaan tästä...
~ "Per aspera ad hominem - vaikeuksien kautta henkilökohtaisuuksiin" ~

Y-DNA: N1c1-YP1143 (Olavi Häkkinen 1620 Kuhmo? >> Juhani Häkkinen 1816 Eno)
mtDNA: H5a1e (Elina Mäkilä 1757 Kittilä >> Riitta Sassali 1843 Sodankylä)
Avatar
Jaska
Ylihärmiö
Ylihärmiö
 
Viestit: 10977
Liittynyt: 14 Helmi 2011 04:02


Paluu Uutiset ja tutkimukset

Paikallaolijat

Käyttäjiä lukemassa tätä aluetta: Ei rekisteröityneitä käyttäjiä ja 16 vierailijaa