Koronavirus / Covid-19

[Pystynen]

Fiksua luettavaa aiheesta: Vasara ja tanssi.

Perusideana, kun virustartuntojen kokonaismäärä on ensin saatu laskemaan voimakkailla rajoitteilla laskemaan, niin sen yleistä tarttuvuutta pystyy tämän jälkeen pitämään kurissa myös merkittävästi vähäisemmilläkin (mutta kuitenkin nollasta poikkeavilla) rajoitteilla, jolloin tartuntojen määrä ei pääse uudelleen kasvuun. Näin päästään sellaiseen stabiiliin tilaan jossa on oikeasti mahdollista odotella vuosi tai puolitoista rokotteen valmistumista.

[jussipussi]

https://www.uusisuomi.fi/uutiset/us/060 ... parit:4e18

Juuri nyt näyttäisi toimet purevan.

[Giösta]

Asian sivusta ...

Danten fb-ryhmässä joku postasi tämmöisen https://www.nature.com/articles/s41421-020-0147-1 "Comparative genetic analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) receptor ACE2 in different populations".

Kuvassa on listattuna 15 rs-numeroa jotka liittyvät tähän ACE2-geeniin. Koska tajusin koko tekstistä hyvin vähän, mutta haluan silti ihmetellä asioita, niin kaivelin omasta bam-fileestä nuo kaikki. Minulla ne olivat kaikki ancestraleja, eli ei ollut mutaatioita.

Minulla on hg19 bam, joten kaivoin nuo bamista komennolla

for i in 15615453 15644220 15698046 15701060 15739312 15643279 15686299 15676417 15706830 15711209 16544401 14760392 15550829 15200779 15693550; do samtools mpileup minun.bam -r chrX:$i-$i; done

Uudemmilla bameilla pitää kai kirjoittaa -r X:$i-$i eli tuo chr jäisi pois.

Komento tulostaa 15 riviä tämmöistä

chrX 15615453 N 19 aaaaaaAaAaAAaAaAAaA FDFFFFGEFFhE>FEFFFF

ja esim tuo aaaaaaAaAaAAaAaAAaA tarkoittaa että isältä ja äidiltä molemmilta on peritty a-alleelit. Jos jommaltakummalta olisi tullut g, niin tuo rimpsu olisi jotakin agAgaG... tyylistä ja jos molemmilta tulee mutantti-alleeli niin sitten ripsussa on pelkkiä g-kirjaimia.

Ja sitten voi verrata allaolevaan listaan onko anc(estral) vai alt.

#rs hg19 hg38 anc alt
rs4646127 15615453 15597330 A G
rs2158082 15644220 15626097 G A,C
rs5936011 15698046 15679923 C T
rs4830983 15701060 15682937 A C
rs5936029 15739312 15721189 C G,T
rs6629110 15643279 15625156 T C
rs6632704 15686299 15668176 C A
rs4830974 15676417 15658294 G A
rs4060 15706830 15688707 C A
rs1996225 15711209 15693086 C T
rs143695310 16544401 16526278 T A
rs75979613 14760392 14742270 C T
rs112171234 15550829 15532706 T G
rs12010448 15200779 15182657 T C
rs200781818 15693550 15675427 G GGGCGCGGTCCTTACGTGT

[Kinaporin kalifi]

Onko koronakriisi pahempi kuin 90-luvun lama? Ei ole, sanovat talousasiantuntijat
https://www.iltalehti.fi/talous/a/7bc8e ... 2e39eeaad7

Kangasharjun mukaan...
- -
– Mutta 1990-luvun laman suuret arvet olivat tavallisten ihmisten kärsimys, kun työttömyys nousi lähelle 20 prosenttia, ja laski niin hitaasti. Korkotaso oli niin korkea, että moni suomalainen menetti kotinsa. En näe mitään sellaisia riskejä juuri nyt.

.

Kangasharju sivuuttaa kyllä aika kevyesti sen suuren joukon ylivelkaantuneita suomalaisia, joilla on sekä kalliita korkeakorkoisia kulutusluottoja että lomautus- tai irtisanomisuhka nyt niskassa. Ennustan että tämä osuu kohta tuulettimeen. Lisäksi, palvelualan monilla vaikeuksissa olevilla pienyrittäjillä on todennäköisesti useilla nimenomaan koti yrityslainojen vakuutena. Tiedän itsekin pankkeja jotka eivät muuten näitä yritysluottoja yrittäjille olisi myöntäneet.

[Jaska]

Nyt jo palikampikin trolli näkee, ettei muiden maiden kuolleisuuskäyrä muistuta Ruotsin jyrkkää kasvua. Ja syy on päivänselvästi se, ettei Ruotsi ole ryhtynyt ponteviin toimiin viruksen leviämisen rajoittamiseksi.


http://www.elisanet.fi/alkupera/Koronakuolleet2.png

[Kinaporin kalifi]

Nyt jo palikampikin trolli...

Olisin itse hieman varovaisempi leimaamaan ihmisiä trolleiksi ihan mielipidekysymysten pohjalta, kun asiantuntijatkin ovat näiden toimenpidevalintojen edessä aika neuvottomia. Mielipiteet ovat tietysti kyllä jälkeenpäin joko vääriä tai oikeita, mutta vain aika näyttää. Mutta, tu casa ja niin edelleen.

[jussipussi]

Nyt jo palikampikin trolli näkee, ettei muiden maiden kuolleisuuskäyrä muistuta Ruotsin jyrkkää kasvua. Ja syy on päivänselvästi se, ettei Ruotsi ole ryhtynyt ponteviin toimiin viruksen leviämisen rajoittamiseksi.


http://www.elisanet.fi/alkupera/Koronakuolleet2.png

Palikampikin foorumin isäntä näkee, että käyrät Suomi vs Ruotsi ovat yhtenevät, kun tarkastellaan Ruotsin käyrää 10. - 20.3. Eli siitä, kun kuoleman tapauksia alkoi ilmetä enenevässä määrin ja vastaava ajanjakso Suomen käyrää 20. - 30.3. Käytät ovat itseasiassa käytännössä identtiset.

Seuraavat lähipäivät kertovat varmasti sen, ovatko toimenpiteet purreet. Uskon ja toivon Suomen käyrän jatkavan pienellä kulmakertoimella. Sitä ei kuitenkaan pysty tuosta datasta sanomaan nimiserkkuni Nätti-Jussikaan, Jaskasta puhumattakaan. Kuinka pihalla voi olla?

[Jaska]

Nyt jo palikampikin trolli...

Olisin itse hieman varovaisempi leimaamaan ihmisiä trolleiksi ihan mielipidekysymysten pohjalta, kun asiantuntijatkin ovat näiden toimenpidevalintojen edessä aika neuvottomia. Mielipiteet ovat tietysti kyllä jälkeenpäin joko vääriä tai oikeita, mutta vain aika näyttää. Mutta, tu casa ja niin edelleen.

Trollaamisella tarkoitan sitä, kun eräs väitti taannoin, ettei eri maiden käyrien jyrkkyysero liittyisi eristämistoimiin. Sellainen väitehän on ristiriidassa aivan kaiken tietämämme kanssa. Henkilö, joka heittelee todellisuuden vastaisia väitteitä pokerinaamalla, on luokitukseltaan trolli.

[Jaska]

Virus on levinnyt maakunnissa myös suurten keskusten ulkopuolelle:
https://www.is.fi/kotimaa/art-2000006459644.html

COVID-19-viruksen ilmaantuvuus on Uudellamaalla huomattavasti korkeampi kuin muissa maakunnissa. Tällä hetkellä Uudenmaan maakunnassa, jossa on 26 kuntaa, on yhteensä 843 todettua tartuntaa 20 kunnan alueella. Jotta estettäisiin tartuntojen leviäminen Uudeltamaalta muualle Suomeen, valtioneuvosto antoi 27.3.2020 asetuksen liikkumisen tilapäisistä rajoituksista väestön suojaamiseksi.

Varsinais-Suomessa, jossa on 27 kuntaa, on yhteensä 56 todettua tartuntaa 13 kunnan alueella. Kaarinassa, Koski Tl:ssä, Laitilassa, Marttilassa, Maskussa ja Salossa ja Turussa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Pirkanmaalla, jossa on 22 kuntaa, on yhteensä 100 todettua tartuntaa seitsemän kunnan alueella. Kangasalla, Orivedellä, Pirkkalassa, Tampereella ja Valkeakoskella on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Kanta-Hämeessä, jossa on 11 kuntaa, on yhteensä 23 todettua tapausta viiden kunnan alueella. Forssassa, Hämeenlinnassa ja Riihimäellä on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Etelä-Savossa, jossa on 14 kuntaa, on yhteensä 23 todettua tapausta kuuden kunnan alueella. Mikkelissä ja Pieksämäellä on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Keski-Suomessa, jossa on 23 kuntaa, on 56 todettua tapausta kuuden kunnan alueella. Jyväskylässä, Jämsässä ja Muuramessa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Pohjanmaalla, jossa on 15 kuntaa, on yhteensä 21 todettua tapausta neljän kunnan alueella. Vaasassa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Pohjois-Pohjanmaalla, jossa on 30 kuntaa, on yhteensä 56 todettua tapausta kuuden kunnan alueella. Oulussa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Pohjois-Savossa, jossa on 18 kuntaa, on yhteensä 23 todettua tapausta viiden kunnan alueella. Useampia COVID-19 tapauksia on Kuopiossa.

Etelä-Pohjanmaalla, jossa on 17 kuntaa, on yhteensä 12 todettua tapausta neljän kunnan alueella. Useampia COVID-19 tapauksia on Seinäjoella.

Lapissa, jossa on 21 kuntaa, on yhteensä 21 todettua tartuntaa kuuden kunnan alueella. Useampia COVID-19-tapauksia on Kemissä, Kittilässä, Kolarissa ja Rovaniemellä. Epidemian laajaa alueellista leviämistä ei voida vielä maakunnassa todeta. Maakunnan alueella COVID-19- viruksen leviämisen riskiä lisää myös länsi- ja pohjoisrajan yli tapahtuva työmatkaliikenne erityisesti, jos työmatkaliikenne jatkuu nykyisellään.

Satakunnassa, jossa on 17 kuntaa, on yhteensä 17 todettua tartuntaa seitsemän kunnan alueella. Porissa ja Raumalla on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Päijät-Hämeessä, jossa on yhteensä 9 kuntaa, on yhteensä 23 todettua tartuntaa kuuden kunnan alueella. Lahdessa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Kymenlaaksossa, jossa on 7 kuntaa, on todettuja tapauksia yhteensä 10 neljän kunnan alueella. Kouvolassa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Etelä-Karjalassa, jossa on 9 kuntaa, on yhteensä 8 todettua tapausta kahden kunnan alueella. Lappeenrannassa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Pohjois-Karjalassa, jossa on 12 kuntaa, on yhteensä 6 todettua tapausta neljän kunnan alueella. Joensuussa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Keski-Pohjanmaalla, jossa on kahdeksan kuntaa, on yhteensä 5 todettua tapausta kahden kunnan alueella. Kokkolassa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

Kainuussa, jossa on 8 kuntaa, on neljä todettua tapausta yhden kunnan alueella.

Ahvenanmaalla, jossa on 16 kuntaa, on yhteensä viisi todettua tapausta kolmen kunnan alueella. Maarianhaminassa on havaittu useita COVID-19 tapauksia.

[jussipussi]

Nyt jo palikampikin trolli...

Olisin itse hieman varovaisempi leimaamaan ihmisiä trolleiksi ihan mielipidekysymysten pohjalta, kun asiantuntijatkin ovat näiden toimenpidevalintojen edessä aika neuvottomia. Mielipiteet ovat tietysti kyllä jälkeenpäin joko vääriä tai oikeita, mutta vain aika näyttää. Mutta, tu casa ja niin edelleen.

Trollaamisella tarkoitan sitä, kun eräs väitti taannoin, ettei eri maiden käyrien jyrkkyysero liittyisi eristämistoimiin. Sellainen väitehän on ristiriidassa aivan kaiken tietämämme kanssa. Henkilö, joka heittelee todellisuuden vastaisia väitteitä pokerinaamalla, on luokitukseltaan trolli.

Kun olet foorumilla julistanut muistaakseni neljä trollia, ja minä olen ainoa heistä, joka tällä hetkellä saa kirjoittaa (aikalaisesta en ole varma, mutta hän ei ole tähän ketjuun kirjoittanut) pääsen päättelemällä siihen tulokseen, että tarkoitat tässä kommentissa minua.

Tuo heittosi on sen verran räikeä olkinukke että oksat pois. Vaatii perusteluja. En missään vaiheessa ole väittänyt tuollaista. Ainoastaan, että kuvaajasta on tulkittavissa muutakin kuin sinä tulkitsit ja tämä viimeisin tulkintasi oli jopa naurettava ja täysin perusteeton. Taisi olla lyhyt matikka lukiossa ja siitäkin jatkoon keräilyerien kautta. Osuiko?

[Jaska]

Koronakriisistä jättimäinen lasku – hallitus valmistautuu ottamaan miljardeja euroja lisää velkaa
https://www.is.fi/politiikka/art-2000006459496.html

Luvut ovat hurjia: julkisen talouden alijäämä voi kasvaa jopa 6,5–8 miljardia euroa. Tämän päälle tulee vielä hallituksen toimet, joilla lievitetään yrittäjien ja kotitalouksien ottamaa iskua, esimerkiksi suoria tukia lisätään ja veroja ja sosiaaliturvamaksuja lykätään.

VIELÄ joulukuussa valtiovarainministeriö ennusti tälle vuodelle prosentin kasvua. Korona pudottaa kasvuennustetta valtiovarainministeriön mukaan 6–7 prosenttiyksikköä.

[Jaska]

Ruotsalaiset alkavat tulla järkiinsä. Hiljalleen ja myöhässä mutta kuitenkin.
https://www.is.fi/kotimaa/art-2000006461016.html

Höllemmin kansalaistensa vapauksia rajannut Ruotsi on tehnyt käännöksen koronalinjassaan. Kuolleiden määrä on kaksinkertaistunut Ruotsissa vain kahden vuorokauden aikana. Kuolleita naapurimaassa on jo 239.

Suomen tapaan myös Ruotsi kehottaa nyt ikäihmisiä pysymään kotonaan. Ruotsissa aiotaan lisäksi rajoittaa kaupoissa kerrallaan asioivien määriä.

Kyse siis näyttää todellakin olleen vain hyväuskoisesta hölmöydestä eikä suinkaan tietoisesta strategiasta. Muutenhan mitään käännöstä ei tehtäisi vaan jatkettaisiin valitulla linjalla.

[Jaska]

Koronavirus tappaa miehiä enemmän kuin naisia – tutkijat löysivät selityksen
https://www.is.fi/kotimaa/art-2000006460655.html

Nyt päästään miesten ja naisten biologisiin eroihin.

– On kaksi biologista tekijää, jotka ovat hyvin merkittäviä. Yhtäältä estrogeeni- ja testosteronihormoneilla on vaikutusta, toisaalta eroja syntyy siitä, että naisilla on kaksi x-kromosomia, miehillä vain yksi, Altfeld sanoo.

Naisten estrogeeni kiihdyttää elimistön immuunipuolustuksen toimintaa, miehisellä testosteronilla puolestaan on päinvastainen, immuunivastetta vaimentava vaikutus. Selitys on interferonissa, joka säätelee virusten torjunnassa tärkeiden proteiinien tuotantoa.

– Tutkimustulokset osoittavat, että estrogeeni lisää interferonien tuotantoa. Hengitystieinfektiossa naisia auttaa parempi kyky tuottaa interferoneja, jotka estävät virusten leviämistä ja keuhkojen vaurioita, sanoi yhdysvaltalainen immunologi Susan Kovats uutistoimisto Xinhualle.

Monet immuunivastetta säätelevät proteiinit puolestaan ovat suoraan kytköksissä x-kromosomiin.

– Ajattelimme pitkään, ettei naisen toinen x-kromosomi ole aktiivinen. Mutta nyt tiedämme, että naisen immuunipuolustuksen solut voivat lukea molempien x-kromosomien ohjeita. Siksi monet immuunipuolustuksen säätelyn kannalta merkittävät molekyylit toimivat naisilla voimakkaammin kuin miehillä.

Tämä voisi selittää myös kansan tuntemaa ilmiötä ”miesflunssasta”. Naiset selviävät nuhakuumeesta ja influenssoista paremmin kuin miehet, ja myös heidän vasteensa rokotuksille on miehiä parempi.

Kiinassa tutkitut covid-19-potilaiden näytteet osoittavat, että naisten elimistössä on enemmän immuunipuolustukseen liittyviä soluja kuin miesten.

[Kinaporin kalifi]

Pekka Seppäsen hyvä analyysi koronan vaikutuksista yhteiskuntaan:

https://yle.fi/uutiset/3-11283941

Lisäksi, liittyen edellisiin:

"Verrattuna vuoteen 2008 eli aikaan ennen edellistä lamaa suomalaisilla kotitalouksilla on nyt yli 50 prosenttia enemmän velkaa.

...suomalaiset ovat ottaneet tolkuttoman määrän pikavippejä ja kulutusluottoja viimeisen kymmenen vuoden aikana.”

Vuoden 2019 lopussa peräti 386 000:lla suomalaisella oli maksuhäiriömerkintä.

”Tämän lisäksi hyvin monella on luottokortti tapissaan, ja velkoja maksetaan ottamalla lisää uutta velkaa. He eivät näy maksuhäiriötilastoissa mutta todellisuudessa ovat hyvin velkaantuneita”, Pantzar muistuttaa."

https://www.hs.fi/elama/art-2000006460905.html

Tämä siis tilanteessa, jossa "Nyt jo yli 300 000 suomalaista on koronapandemian takia aloitettujen yt-neuvottelujen piirissä, ja luku voi olla vasta alkua."

[Kinaporin kalifi]

"Valtiovarainministeri Katri Kulmuni (kesk) sanoo Kauppalehden haastattelussa, että Suomen julkisen talouden velka voi kasvaa tänä vuonna jopa yli 20 miljardia euroa.

Kulmunin mukaan on selvää, että luku on kaksinumeroinen.

– Ensimmäinen numero velan kasvussa saattaa olla kakkonen. Jos se siihen pysähtyy, olemme jollain lailla tästä selvinneet ja saaneet pidettyä maan tuotannollisesti käynnissä, Kulmuni sanoo KL:lle."

https://www.iltalehti.fi/politiikka/a/3 ... 940f29bbcf

Mitenhän tähän liittyen Finnveran takaukset risteilyvarustamoille? En väitä, että tilanne on paha, mutta ei se oikein hyvältäkään näytä. Olisikohan hallituksen jossain Voguen haastattelujen välissä syytä käydä läpi budjettia ja karsia sieltä vähemmän tärkeitä menoja? Samoin yleisemminkin sen pohtiminen, miten talous pidetään hengissä ihmisten lisäksi, voisi kannattaa.

[Jaska]

https://yle.fi/uutiset/3-11259199

Rajaliikenteen rajoittaminen Lapissa on osoittautunut vaikeammaksi kysymykseksi kuin hallituksessa etukäteen ajateltiin.

Asia on noussut myös diplomaattiseksi kysymykseksi: Ruotsi ja Norja eivät halua Suomen rajoittavan rajan yli kulkevaa liikennettä. Ylen tietojen mukaan asiasta on käyty neuvotteluja ministeritasolla asti.

No mutta mitähän se niille kuuluu? Etenkin kun Norja sulki rajansa suomalaisiltakin jo ajat sitten.

Hallitus esittää yrittäjille oikeutta hakea työttömyysturvaa, jos koronakriisi on heikentänyt yritystoimintaa. Sitä voi hakea myös takautuvasti 16. maaliskuuta jälkeen tulleista menetyksistä. Yrittäjän tulee kuitenkin hakea työttömyysturvaa 15. huhtikuuta mennessä, jotta oikeus turvaan on takautuvasti.

Hallituksen esityksen mukaan oikeus koskee kaikkia yrittäjiä, myös työllistäviä yrittäjiä. Lakiesitys mahdollistaa sen, että koronasta kärsinyttä yritystoimintaa ei tarvitse lakkauttaa, jotta päätoimisella yrittäjällä olisi oikeus työttömyysturvaan, kuten tällä hetkellä pitäisi tehdä. Samalla yrittäjä voisi edelleen saada myös jonkin verran yrittäjätuloa yrityksestään menettämättä kokonaan etuuttaan.

Tämä uudistus saisi jäädä pysyväksikin.

Täällä lisää yrittäjien ja työttömien avuksi tehtävistä lakimuutoksista:
https://www.iltalehti.fi/politiikka/a/9 ... 0f1a436bf9

[Kinaporin kalifi]

Positiivisen luottorekisterin ohella hallitus saisi viedä pikaisesti eteenpäin mahdollisuutta henkilökohtaiseen konkurssiin. Menettelyn ei tietenkään pitäisi olla helppo vaihtoehto varsinkaan kevytmielisesti kulutusluotoilla velkaantuneille, mutta emme todellakaan tarvitse mahdollisesti elinikäiseen velkavankeuteen nyt ajautuvaa, laajaa epäonnisten pienyrittäjien joukkoa.

[Jaska]

Ruotsin pääepidemiologi myöntää yhden virheen koronataistelussa
https://www.is.fi/ulkomaat/art-2000006463742.html

Hänen mukaansa Ruotsi reagoi koronavirusuhkaan myöhässä. Se johtui siitä, että covid-19-taudin vakavuutta ei ymmärretty vielä siinä vaiheessa kun se levisi Kiinassa.

– Monet meidän tavoin näkivät mitä tapahtui ja ajattelivat, että ehkä siitä ei tule sen enempää.

Kolme sanaa:
VITUN. IDI. OOTTI.

Ruotsissa ei edelleenkään tehdä mitään, vaikka viimeisten kolmen päivän aikana koronakuolemien määrä on kaksinkertaistunut. Maassa on noin 350 kuollutta, eli kohta 20 kertaa enemmän kuin Suomessa.


http://www.elisanet.fi/alkupera/Koronakuolleet3.png

[Jaska]

Sipoossa eniten koronavirustartuntoja väestöön suhteutettuna – THL julkaisi ensi kertaa tiedot kunnittain, katso tästä oman kuntasi tilanne
https://www.hs.fi/kotimaa/art-200000646 ... ccc00884f4


http://www.elisanet.fi/alkupera/Koronat ... ittain.png

[Kinaporin kalifi]

"That does not mean there will be no extra deaths - but, Sir David says, there will be "a substantial overlap".

"Many people who die of Covid [the disease caused by coronavirus] would have died anyway within a short period," he says.

Knowing exactly how many is impossible to tell at this stage.

Prof Neil Ferguson, the lead modeller at Imperial College London, has suggested it could be up to two-thirds."

https://www.bbc.com/news/health-51979654

Koronan aiheuttamiin kuolleisuuslukuihin pitänee siis suhtautua lievällä varauksella, koska mahdollisesti jopa kaksi kolmasosaa siihen kuolleista olisi joka tapauksessa kuollut lähiaikoina. Pandemiaan kuoleman ajoituksen osalta liittyvä, tehoterveydenhuollon mahdollinen ylikuormituspiikki pahentaa tietysti omalta osaltaan tilannetta.

Talouden supistuminen, esim. yli 6,4 %, alkaa ilmeisesti toisaalta lisäämään muuta kuolleisuutta siten että koronaan liittyvien rajoitustoimenpiteiden vaikutus neutralisoituu. Joten, suo siellä, vetelä täällä. Ajatus talouden pyörittämisestä avustuksilla, esim. yrityksille annetuilla, ei muuten tietenkään toimi. Avustuksien mittakaava ei tule mitenkään riittämään tähän.

P.S. niin ja se irtautumissuunnitelma eurosta pitäisi nyt kaikessa hiljaisuudessa luoda, jos sitä ei jo ole. On varsin epäselvää, tuleeko eurojärjestelmä kestämään erilaisten koronareaktioiden aiheuttaman talousshokin.